Занятие III Программы для химического моделирования Оглавление

Занятие III Программы для химического моделирования

Оглавление 1)Компьютерная химия. Квантовая химия. Хемоинформатика 2)Программы для химического моделирования. Система SMILES 3)Avogadro 4)Marvin Sketch 2

Компьютерная химия (математическая химия) — сравнительно молодая область химии, основанная на применении компьютерных методов и дискретной математики, прежде всего[источник не указан 989 дней], теории графов и комбинаторики, к химическим задачам фундаментального и прикладного характера. 3

Квантовая химия — это направление химии, рассматривающее строение и свойства химических соединений, реакционную способность, кинетику и механизм химических реакций на основе квантовой механики 4

Хемоинформатика — это часть теоретической химии, базирующаяся на своей собственной молекулярной модели; в отличие от квантовой химии, в которой молекулы представлены как ансамбли электронов и ядер, и основанного на силовых полях молекулярного моделирования, имеющего дело с классическими «атомами» и «связями» , хемоинформатика рассматривает 5

Оглавление 1)Компьютерная химия. Квантовая химия. Хемоинформатика 2)Программы для химического моделирования. Система SMILES 3)Avogadro 4)Marvin Sketch 6

SMILES 7

Примеры употребления SMILES 8

9

Оглавление 1)Компьютерная химия. Квантовая химия. Хемоинформатика 2)Программы для химического моделирования. Система SMILES 3)Avogadro 4)Marvin Sketch 10

Avogadro http: //avogadro. cc/wiki/Main_Page 11

12

SMILES в Avogadro 13

Оптимизация структуры 14

15

Оптимизированная структура 16

Поля Ван-Дер-Ваальса 17

18

Оглавление 1)Компьютерная химия. Квантовая химия. Хемоинформатика 2)Программы для химического моделирования. Система SMILES 3)Avogadro 4)Marvin Sketch 19

Marvin Sketch https: //www. chemaxon. com/products/marvinsketch / 20