Загальна характеристика родини Coronaviridae 1. Класифікаційне положення родини

Загальна характеристика родини Coronaviridae 1. Класифікаційне положення родини 2. За г альна характеристика коронавірусів 3. Патогенез та епідеміологічні особливості інфекцій, спричинених коронавірусами 4. SARS як чинник атипової пневмонії

Порядок Nidoverales 1. Родина Coronaviridae 1. 1. Рід Coronavirus 1. 2. Рід Torovirus 2. Родина Arteriviridae 2. 1. Рід Arterivirus 3. Родина Roniviridae 3. 1. Рід Okavirus

• До складу підродини Coronavirinae входять три роди. • 1. Рід Alphacoronavirus – альфакоронавірус першого типу, коронавіруси собак першого й другого типів, котів першого й другого (вірус інфекційного перитоніту котів) типів, інфекційного гастроентериту свиней, вірус інфекційного трахеобронхіту свиней ISU-1 , людські коронавіруси 229 Е та NL 63, коронавіруси кажанів Scotophilus 512 тощо.

• 2. Рід Betacoronavirus – коронавіруси людини ( ОС 43 та HKU 1) , корів (Мебус), коней ( NC 99) , мишей (вірус гепатиту мишей), гемаглютинуючий вірус енцефаломієліту свиней, SARS-подібні віруси, коронавірус пацюків, коронавіруси кажанів Pipistrellus HKU 5 , Rousettus HKU 9 тощо. • 3. Рід Gammacoronavirus – коронавіруси птахів (вірус інфекційного бронхіту курей, коронавірус індиків) і кита-білухи.

• Підродина Torovirinae містить роди Torovirus та Bifinivirus. • 1. Рід Torovirus : коронавірус коней, вірус Берне, вірус Бреда (ВРХ), торовіруси людини та свиней. • 2. Рід Bifinivirus – вірус білого ляща.

Bo. TV Po. TV Торовіруси

S — білки шипів ; M- мембранні білки ; E – оболонкові білки ; N – білок нуклеокапсидугл ік о п р о т е їн и Віріони сферичні, оточені ліпідвмісною оболонкою. Д іаметр 120 -160 нм, серцевин а – ікосаедричн а (діаметр 64 нм), оточує спіральний нуклеокапсид. Пепломери (тримери (зубець шип)- spike protein ) довжиною біля 20 нм. У деяких коронавірусів другий шар пепломерів формує г емаглютинінестеразу (НЕ).

Структурні білки : S ( spike protein ) – приєднання до рецепторів, злиття оболонок, гемаглютинація, індукція нейтралізуючих антитіл. Головний антиген. Найбільший – з 1452 АК. У деяких коронавірусів розпадається на S 1 і S 2 субодиниці; M ( membrane protein ) –- брунькування та формування оболонки віріону. З 225 -260 АК. Може індукувати а-інтерферон; E ( small membrane protein ) – асоційований з оболонкою білок. З 80 -109 АК. Разом з М білком приймає участь у зб і рці віріонів; НЕ — гемаглютинінестераза (присутній не у всіх вірусів). Частково споріднений з НЕ вірусу грипу С. N ( білок нуклеокапсиду ) – асоційований з геномом , основний фосфопротеїн. Приймає участь у реплікації геному.

Неструктурні білки : pol закодована у дво х відкрити х рамка х зчитування 1 a та 1 b , які перекриваються в декількох нтд. Ген pol може відповідати за функції 3 С-подібної протеази, багатий на цистеїн фак т ор росту, РНК-зал-РНК-пол, нуклекапсид трифосфат (НТФ) приєднувальни й /хеліказний домен та домен приєднання до НК.

Геном — 1 молекула лінійної 1 л РНК, позитивної полярності. 27, 6 -31 kb. На 5 ’- кінці — сар, а на 3’- кінці — poly ( A ). На 5 ’- кінці з а сар структурою знаходиться лідуюча послідовність з 65 -98 нт д та регіон з 200 -400 нтд , що не транслюється ( UTR ). На 3’- кінці poly ( A ) передує UTR , що складається з 200 -500 нтд.

Організація геному Characteristic gene order of Typical coronaviruses and SARS: 5’— Replicase (Rep)— Spike (S)— Envelope (E)— Membrane (M)— Nucleocapsid (N) – 3’ Rota. P. et. al

Маса віріонів 400 х 10 3 к. Да. Плавуча густина в градієнті щільності сахарози 1, 15 -1, 2 г/см 3 , а у Cs. Cl – 1, 23 -1, 24 г/см 3. Константа седиментації – 300 -500 S. Віріони чутливі до підвищенної температури, органічних розчинників, неіонних детергентів, формальдегіду, окисників (кілька хв) та ультра-фіолетового опромінення (10 -15 хв). Пряме сонячне опромінення призводить до повільної інактивації вірусів – 3 год при 37 -38ºС. Деякі представиники двох родів стійкі при р. Н 3. Оптимальний р. Н – 7 -7, 5. В і ріони зберігають інфекційність у ліофілізованому стані при 4 С впродовж років, у замороженому – при температурі – 70ºС. Коронавіруси зберігають інфекційну активність у повітрі у вигляді аерозол ю протягом 8 -10 год, у питній воді – до 9 діб, при температурі 0 -18ºС поза приміщенням – до 4 -10 діб, нижче за 0ºС – до 33 -44 діб.

Час реплікації= 24 -30 год. (вірус грипу 4 -8 год. )

Група Вірус Хвороба І Людськкий коронавірус – 229 Е Людський коронавірус- NL 63 Людський коронавірус- NH Вірус трансмісивного гастроентериту свинней Коронавірус собак Вірус інфекційного перитоніту кішок Коронавірус кажанів ГРЗ, пневмонія Бронхіоліти, ГРЗ, пневмонія Системний васкуліт (хвороба Кавасакі) Пневмонія, гастроентерит Гастроентерит Перитоніт, ентерит Асимптоматичний перебіг (респір. чи ентерит)

Група Вірус Хвороба ІІ Людськкий коронавірус –ОС 43 Е Людський коронавірус- HKU 1 Вірус гепатиту мишей Коронавірус ВРХ ГРЗ, пневмонія Пневмонія Гепатити, енцефаліти Пневмонія, гастроентерити ІІ b SARS коронавірус Пневмонія, гастроентерити ІІІ Вірус інфекційного бронхіту птахів Трахеїт, інфекція нирок

Спочатку 5 ’ 20 kb + РНК (геномної РНК) транслюється з утворенням вірусної полімерази, яка потім продукує повнорозмірну – РНК, яка використовується як матриця для утворення транскриптів м. РНК з ідентичними 5 ’ -кінцями (неструктурна лідуюча послідовність з 72 нт д) та відповідним генам 3 ’ кінця. Кожна м. РНК – моноцистр о нна, гени з 5 ’ -кінця транскрибуються з утворенням найдовшої м. РНК і т. д. Ці м. РНК утворюються не в результаті сплайсингу, а за рахунок специфічної роботи полімерази. Між кожним з генів існує повторювальна послідовність – UCUAAAC – що взаємодіє з полімеразою та клітинними факторами для зшивки лідуючої послідовності з початком кожної ORF.

Патогенез Коронавіруси уражують велику кількість видів ссавців та птахів. У людей коронавіруси викликають: • — Респіраторні інфекції, включаючи SARS ; • — Ураження ШКТ (в основному у немовлят, менше 1 року); • — Неврологічний синдром (рідко).

Механізми передачі • аерозольний, • фекально-оральний, • контактний.

Лабораторна діагностика коронавірусів Матеріал для дослідження Клінічний : змиви з носоглотки, мазки з носа та зіва, фекалії. Секційний : фрагменти тканини трахеї, бронхів, легені. Сироватка крові Методи дослідження Експресні Вірусологічні Серологічні МФА, ЕМ, ІЕМ Виділення вірусу в ОКТЕЛ, первинних КК легенів та нирок ембріону людинеи, диплоїдній культурі клітин ембріону людини, суспензійній культурі клітин L 132 РН у ОКТЕЛ, РГГА, РНГА Індикація За втратою рухливості війок епітелію ОКТЕЛ, за ЦПД, МФА Ідентифікація МФА, РГГА (дляштамів типу ОС 38 і ОС 43), РЗК, ЕМ, ІЕМ

SARS

SARS – тип вірусної пневмонії, з симптомами лихоманки, сухого кашлю, диспенії, головн им б о л ем , гіпоксі єю (низька концентрація кисню у крові), лімфопені єю та низьки м рів нем Ал. Ат (що вказує на руйнування печінки). Смерть може наступити в результаті прогресуючої респіраторної недостатності через руйнування альвеол.

Типові симптоми SARS • лихоманка (94%), • грипоподібні симптоми ( 51 -72% ) , • втрата апетиту та міалгі я. Ураження ШКТ є менш типовим. Воно характеризується наявністю діаре ї (27%), блювот и (14%), черевним болем (13%). Інкубаційний період SARS – 4 -6 діб. Відсоток смертності : — для пацієнтів молодших 60 років — 2 -13% — для старших 60 років — 3 -43%.

www. health 24. com/ images/center/sars_flu. jpg

Клінічна картина • короткий інкубаційний період (6 днів ) період змоменту зараження до появи симптомів триває від 2 до 16 днів інтесивна терапія потрібна не пізніше ніж через 10 днів після появи симптомів Виділяють 3 фази захворювання : 1 тиждень : симптоми ГРВІ , гарячка , міалгія , озноб та біль у горлі. 2 тиждень, повторна гарячка. Початок діареї та кисневої недостатності. 3 тижден. Лише 20% досягає цієї фазиі потребують штучної вентиляції легень. Відсоток смертності становить 10%. Sudden onset of high fever (>38°C) & dry cough Chills and shivering & muscle aches Breathing difficulties 3 -7 days from onset of symptoms

В’єтнам 26 Лют. . 2003 2 1 12 Бер 2003 ВООЗ оголосила надзвичайну епід. ситуацію Підвищений нагляд 3 Гонконг Бер. 20034 Канада 14 Бер. 2003 515 Бер. 2003 Підвищений рівень глобальної небезпеки 10 Лют. 2003 Гуандонг. З 15 березня до 7 квітня у 18 країнах виявлено SARS: ВООЗ оголосила глобальну небезпеку 27 Бер. 2003 ВООЗ рекомендує ввести нові вимоги до міжнародних подорожей 2 Квіт. 2003 Експерти ВООЗ добровільне утримання від не важливих подорожей до Гонконгу та провінції Гуандонг в Китаї Сінгапур Бер.

Кількість випадків на 7 квітня 2003 Австралія 3 Бельгія 1 Бразилія 2 Велика Британія 5 В’єтнам 63 Гонконг 1402 Італія 3 Ірландія 1 Іспанія 1 Канада 132 Китай * 1959 Малайзія 6 Німеччина 5 Румунія 1 Сінгапур 178 США 39 Тайвань (Китай) 21 Таїланд 7 Франція 3 Швейцарія 1 Всього = 2 461 випадків та 98 загиблих In bold, affected areas/countries in which local chain(s) of transmission of SARS is/are occurring as reported by the national public health authorities

Г ім алайськ а цивет а ( Paguma larvata )

Останні дані свідчать про те, що пальмова цивета не є резервуаром SARS • Не поширене захворювання серед диких та свійських тварин (цивет) • У цивет не формується імунітету до SARS-Co. V

Природні хазяї SARS (або споріднений вірус) можливо циркулює у диких кажанів (подковоноси) у Китаї. Індикація: • Віруси з гомогологією у 92% до віруса SARS виділені дослідниками з Академії Наук Китая з трьох видів кажанів. • У цих тварин перебіг інфекції був або малосимптомний або безсимптомний Безпосередня передача від кажана до людини навряд відбувається • Між вірусами існує різниця в генах, що кодують білки-прикріплення. • Можливо відбулася пердача вірусу до проміжного хазяїна (цивета) та його адаптація в такий спосіб, що призвів до інфікування людини. Вважають, що підковоноси є природним резервуаром SARS ! galleries. news 24. com/. . . /images/11. jpg zmmu. msu. ru/bats/rusbats/ pictures/rhboch. jpg

Профілактика image. guardian. co. uk/. . . / 2003/12/29/sars. jpg Wearing N 95 mask was one of the main public preventive measures against SARSНе показано ефективність антивірусних препаратів при лікуванні SARS чи інших крорнавірусів. Хіміотерапевничні препарати та вакцина знаходиться у стадії розробки. Неспецифічна профілактика!