Вирусы водорослей и высших растений Симптомы вирусных

Вирусы водорослей и высших растений

Симптомы вирусных болезней растений Хлоротичные пятна на листьях и светло-зеленые плоды огурца с темно-зелеными пятнами (поражение вирусом огуречной мозаики)

Некрозы Местные некрозы на листьях баклажана, поражённого Хвирусом картофеля Клубни картофеля, пораженные вирусом моп-топ (вирусом курчавости верхушки картофеля); граница распространения очерчена дугами некротической ткани

Изменение формы листьев При заражении томатов вирусом огуречной мозаики наблюдается подавление развития листовых пластинок с образованием «папоротниковидных» листьев

Мозаичность Листья огурца, поражённые вирусом огуречной мозаики Листья перца, пораженные вирусом табачной мозаики

Полосатая мозаика Растение, пораженное вирусом полосатой мозаики ячменя

Деформация Листья, поражённые вирусом скручивания листьев фасоли Поражение ствола (борозды)

Изменение окраски цветов Растения, пораженные вирусом пестролепестности тюльпанов

Поражение плодов (мозаика, задержка роста, деформация, хлоротические пятна)

ВИРУСЫ ВОДОРОСЛЕЙ И ВЫСШИХ РАСТЕНИЙ С двухцепочечной ДНК С одноцепочечной + РНК Семейства: Phycodnaviridae; Tymoviridae; Betaflexiviridae; Alphaflexivirida; Secoviridae; Caulimoviridae. Tombusviridae; Luteoviridae; Virgaviridae; Bromoviridae; Potyviridae; Closteroviridae. С одноцепочечной ДНК Роды: Семейства: Sobemovirus; Geminiviridae; Polemovirus; Ourmiavirus; Nanoviridae. Idaeovirus; Benyvirus; Cilevirus.

С одноцепочечной –РНК Семейства: Bunyaviridae; Ophioviridae; Rhabdoviridaе. Роды: Varicosavirus; Tenuivirus; Emaravirus. С двухцепочечной РНК Семейства: Partitiviridae; Reoviridae; Endornaviridae.

Phycodnaviridae (Phyco. DNA греч. растение ДНК ) Геном – линейная двухцепочечная ДНК (100 -560 kb), оба конца которой имеют самокомплементарные последовательности, формирующие шпилечные структуры. Кодирует около 700 открытых рамок считывания. - от Семейство Phycodnaviridae Род Chlorovirus Типичный вид Paramecium bursaria Chlorella virus (PBCV-1 ) Хозяева- водоросли Вирион имеет капсид икосаэдрического типа симметрии (Т=169) 100 -220 нм в диаметре. На вершинах, образованных сходящимися 5 -тью гранями находится «плотный материал» . Имеется внутренняя мембрана, находящаяся под капсидом.

Mastrevirus Maize streak virus Вирус полосатости (gemini – англ. близнецы) кукурузы Curtovirus Beet curly top virus Вирус волнистости свеклы Begomovirus Bean golden yellow mosaic virus Вирион без оболочки, длина – 38 нм, диаметр – 22 нм Вирус золотисто-желтой мозаичности бобов (MSV) cо сдвоенным неполным капсидом Topocuvirus икосаэдрического типа, имеющий 22 пентомера, Tomato pseudo-curly top состоящие из 110 капсидных белков (СР). Геном virus состоит из одной или двух частей одноцепочечной Вирус кольцевой ДНК (2, 5 -3 либо 4, 8 -5, 6 kb, соответственно). псевдоволнистости Репликация происходит в ядре через образование томатов двухцепочечной ДНК. Geminiviridae

Nanoviridae Nanovirus Subterranean clover stunt virus (SCSV) Вирус остановки роста клевера Babuvirus Banana bunchy top virus (BBTV) Вирус верхушечной выпуклости бананов Вирион без оболочки, шаровидной формы, капсид икосаэдрического типа (Т=1) 18 -19 нм в диаметре. Сегментированный одноцепочечный ДНК геном, состоящий из 6 -8 сегментов размером 1 kb, которые находятся в разных частицах. Каждый сегмент генома является матрицей для моноцистронной м. РНК и кодирует один белок. Реже кодирует 2 перекрывающиеся ОРС.

Caulimovirus Cauliflower mosaic virus Вирус мозаики цветной капусты Cavemovirus Cassava vein mosaic virus Вирус мозаики маниоки Petuvirus Petunia vein clearing virus Вирус просветления Не имеют оболочки. Сферические изометрические жилок (Т=7) вирусы ( 45 -50 нм), состоящие из 420 петунии субъединиц и содержащий на поверхности вирус. Soymovirus ассоциированный белок или бациллоформные (30× 60 Soybean chlorotic mottle -900 нм). virus Вирус хлоротической пятнистости сои Caulimoviridae

Caulimoviridae Badnavirus Commelina yellow mottle virus Вирус желтой пятнистости комелины Tungrovirus Rice tungro baciliform virus Вирус бациллоформности риса Геном – двухцепочечная кольцевая ДНК 7 -8, 2 kb с разрывами в обеих цепях: один в транскрибированной цепи и от одного до трех в нетранскрибируемой цепи. Кодирование от 1 до 8 белков. Репликация генома происходит через стадию образования одноцепочечной РНК (обратная транскрипция).

Tymoviridae Tymovirus Turnip yellow mosaic virus Вирус желтой мозаики турнепса Округлые изометрические частицы (Т=3) 25 -30 нм. Геном – линейная одноцепочечная +РНК длиной 6. 3 kb, 3'-конец имеет т. РНК-подобную структуру, содержит 3 ОРС. Вирусы со сложной транскрипцией, содержат субгеномную м. РНК. Синтез белка идет со сдвигом рамки считывания, также используется протеолитический процессинг полипротеинов.

Betaflexiviridae Без наружной оболочки. Вирион нитевидный извилистый длиной 600 -1000 нм и более, диаметром 12 -13 нм. Геном - линейная оц. РНК (+) размером 6. 5 -9 kb. 3'-конец полиаденилирован, а у некоторых родов 5'конец кэпирован. Кодирование от 1 до 6 белков. Capillovirus Apple stem grooving virus (ASGV) Вирус бороздчатости ствола яблони Carlavirus Carnation latent virus Латентный вирус гвоздики Citrivirus Citrus leaf blotch virus Вирус пятнистости листьев цитрусовых

Alphaflexiviridae Potexvirus Potato virus X (PVX) Вирус картофеля Х Без наружной оболочки. Вирион нитевидный извилистый длиной 470 -800 нм и более, диаметром 12 -13 нм. Геном - линейная оц. РНК (+) размером 5, 4 -9 kb. 3'конец полиаденилирован, а у некоторых родов 5'-конец кэпирован. Кодирование от 1 до 6 белков.

Secoviridae Без наружной оболочки. Капсид икосаэдрический с Т=3 псевдосимметрией диаметром 25 -30 нм, состоит из 1 -3 капсидных белков. Геном двухкомпонентный (одноцепочечная +РНК), размеры 6 -8 и 4 -7 kb. Каждый сегмент на 3’ конце полиаденилирован , а с 5’ концом связан вирусный геномный белок (VPg). Порядок Picornavirales Семейство Secoviridae Подсемейство Comovirinae Род Comovirus Типичный вид Cowpea mosaic virus (CPMV) Вирус мозаики коровьего гороха

Tombusviridae Tombusvirus Tomato bushy stunt virus Вирус кустистой карликовости томатов Без наружной оболочки. Вирион сферческой формы 2834 нм в диаметре, капсид икосаэдрического типа (Т=3) состоит из 30 гексомеров, 180 белковых субъединиц. Геном- одноцепочечная линейная +РНК (4 -5, 4 kb), не имеющая кэп и полиаденилированых концов.

Luteoviridae Luteovirus Barley yellow dwarf virus-PAV Вирус желтой карликовости ячменя Enamovirus Potato leafroll virus Вирус скручивания листьев картофеля Polerovirus Pea enation mosaic virus-1 Вирус мозаики гороха Без наружной оболочки. Вирион сферческой формы 25 -30 нм в диаметре, капсид икосаэдрического типа (Т=3) состоит из 180 белковых субъединиц. Геном- одноцепочечная линейная +РНК (5, 3 -5, 7 kb), не имеющая полиаденилирования или т. РНК-подобных структур на 3’конце

Furovirus Soil-borne wheat mosaic virus Почвенный вирус мозаики пшеницы Hordeivirus Barley stripe mosaic virus (BSMV) Вирус полосатой мозаики ячменя Pecluvirus Peanut clump virus (PCV) Виус комковатости арахиса Без оболочки. Жесткие палочки 20 -25 нм в Pomovirus диаметре. капсид спирального типа Potato mop-top virus (PMTV) симметрии. В центре канал с нуклеиновой Вирус моп-топ (курчавости кислотой (1 -3 фрагмента в зависимости от верхушки) картофеля рода). Геном – одноцепочечная линейная +РНК, у Tobamovirus некоторых родов сегментированная. На Tobacco mosaic virus (TMV) 3’конце имеется т. РНК-подобная структура. Вирус табачной мозаики У гордевирусов обнаружена Tobravirus полиаденилированная область, находящаяся Tobacco rattle virus (TRV) между кодирующейся последовательностью Вирус погремковости табака и т. РНК-подобной структурой Virgaviridae

Bromoviridae Alfamovirus Alfalfa mosaic virus Вирус мозаики люцерны Bromovirus Brome mosaic virus Вирус мозаики костра Без суперкапсидной оболочки. Форма шаровидная или бациллоформная с икосаэдрическим типом симметрии (Т=1 или Т=3) 26 -35 нм в диаметре. Геном сегментированый линейная одноц. +РНК. Три геномных и один субгеномный сегменты находятся в разных частицах. Каждый фрагмент содержит на 3’конце т. РНК-подобную структуру, а на 5’ конце – кэп.

Potyviridae Potyvirus Potato virus Y (PVY) Вирус картофеля Y Без оболочки. Вирионы извилистые, нитевидные, представлены одним типом (650 -900 нм) или двумя (500 -600 и 200 -300 нм) длины и 12 -15 нм в диаметре. Спиральной симметрии. Геном из 1 -2 частей, линейный, оц. РНК (+) 8, 5 -12 kb. 3' конец полиаденилирован. 5 'конец связан с геномным белком (VPg). Геномная РНК (или сегменты генома), транслирует полипротеин (ы), которые затем расщепляются протеазами в функциональные продукты.

Closteroviridae Closterovirus Beet yellows virus (BYV) Вирус желтухи свеклы Без оболочки, извилистые и исключительно длинные, нитевидные частицы около 9502200 нм в длину и 10 -13 нм в диаметре. Капсид собран из основного капсидного белка (CP) и хвост состоит из минорного карсидного белка (CPM). Геном - линейная оц. РНК (+) 15 - 20 kb. 3'-конец не имеет поли (А) и 5'-конец, вероятно, имеет метилированный нуклеотидный кэп.

Sobemovirus Семейство не определено Southern bean mosaic virus (SBMV) вирус южной мозаики бобов Вирион без оболочки, сферической формы диаметром 30 нм, капсид икосаэдрический (Т=3) построен из 180 белковых субъединиц. Геном – несегментированная линейная одноцепочечная +РНК (4 kb), 5΄-конец связан с геномным белком (VPg), 3΄-конец не полиаденилирован.

Polemovirus (от polerovirus-sobemovirus гибрид) Семейство не определено Poinsettia latent virus (Pn. LV) Вирион без оболочки сферической формы диаметром 30 нм, капсид икосаэдрический (Т=3) построен из 180 белковых субъединиц. Геном – несегментированная линейная одноцепочечная +РНК кодирует предположительно 4 ОРС. Геном в первой трети подобен полеровирусу, а в остальной части собемовирусу. 5'конец связан с геномным белком (VPg).

Ourmiavirus Семейство не определено Ourmia melon virus (Ou. MV) Без оболочки. Форма вириона бацилловидная с икосаэдрическим типом симметрии (Т=1) диаметром 18 нм, длиной 30 -62 нм в зависимости от числа капсомеров. Геном сегментированный, линейные оц. РНК (+). Три сегмента 0. 9 kb, 1. 0 kb и 2, 8 kb, соответственно. Каждый сегмент возможно упакован в отдельный капсид.

Idaeovirus Семейство не определено Raspberry bushy dwarf Вирус кустистой карликовости малины Без оболочки, вирусные частицы изометрические (икосаэдр) слегка сплюснутые, трех типов, но близкие по размерам (33 нм). Геном состоит из 3 компонентов линейной оц. РНК (+): 2 -х геномных (5, 4 и 2, 2 kb) и 1 -го субгеномного (1 kb), которые находятся в разных частицах, отличающихся по плотности. РНК-1 имеет 1 ОРС, РНК-2 имеет 2 ОРС, субгеномная РНК кодирует капсидный белок.

Benyvirus Семейство не определено Beet necrotic yellow vein virus Вирус некротической желтухи свеклы Без оболочки, форма стержня 85 -390 × 20 нм Капсид-правостороння спираль (шаг- 2, 6 нм, период идентичности 4 оборота, с участием 49 субъединиц капсида). Каждый капсидный белок покрывает 4 нуклеотида на геномно РНК. Геном – 4 -5 сегмента, линейные оц. РНК (+) от 1, 3 до 6, 7 kb, каждый в отдельно капсиде. Концы кэпированы и полиаденилированы.

Cilevirus Семейство не определено Citrus leprosis virus C Плоды и листья лимона, поражённые вирусом Без оболочки, палочковидные, приблизительно 150 нм в длину и 50 нм в ширину, напоминающие рабдовирусы. Геном сегментирован (двукомпонентный), линейные, оц. РНК (+). Два сегмента около 8, 7 и 5 kb, каждый сегмент находится в отдельном капсиде. Концы кэпированы и поли (А). РНК 1 содержит 2 ОРС, одна из них кодирует репликазу. РНК 2 содержит 4 OРС, и возможно кодирует транспортные белки.

Bunyaviridae Tospovirus Tomato spotted wilt virus (TSWV) Вирус пятнистого увядания томатов Вирион имеет оболочку, сферический от 80 до 120 нм в диаметре. Внутренний компонент представлен тремя (L, S, M) рибонуклеопротеинами, состоящие из одной цепи РНК (-), связанной с множеством копий белка нуклеокапсида (N) и несколькими молекулами белка L (компонентом транскриптазы). Lсегмент кодирует белок L. Mсегмент кодирует поверхностные гликопротеины G 1, G 2 (факторы заражения и вирулентности) и неструктурный белок NSm. S сегмент кодирует в двух перекрывающихся рамках считывания белки N и NSs.

Ophioviridae Ophiovirus Citrus psorosis virus (CPs. V) Вирус псорозиса цитрусовых Извилистые голые нуклеокапсиды 3 -4 нм в диаметре, формирующие открытые кольца. Геном сегментированный (4 сегмента) представлен одноцепочечной линейной РНК (-), кодирует до 7 белков.

Rhabdoviridae Nucleorhabdovirus Potato yellow dwarf virus (PYDV) Вирус желтой карликовости картофеля Вирион имеет оболочку, в форме пули или бациллоформные, 180 нм длиной и 75 нм шириной. Геном – одноцепочечная РНК (-) размером 11 -15 kb, кодирует 6 -7 белков. Гены транскрибируются как 5’кэпированные и 3’полиаденилированные моноцистронные м. РНК. Репродукция в ядре.

Varicosavirus Семейство не определено Lettuce big-vein virus (LBVa. V) Вирион без оболочки в форме стержней длиной 320 -260 нм и диаметром 18 нм. Капсидный белок около 48 к. Д. Геном из 2 сегментов (6, 8 и 6, 1 kb) – одноцепочечная РНК (-).

Tenuivirus (от лат. Tenui - тонкий) Семейство не определено Rice stripe virus (RSV) Вирус полосатости риса Вирион без оболочки 3 -10 нм в диаметре. Геном сегментирован (4 -5 сегментов), представлен линейной одноцепочечной РНК (-). Полный геном составляет около 16 kb. Для 3 сегментов характерно амбисенс кодирование.

Emaravirus Семейство не определено European mountain ash ringspot-associated virus Кольцевой пятнистости рябины ассоциированный вирус Вирион сферический, имеет наружную оболочку. Геном сегментированный (4 сегмента), представлен линейной одноцепочечной РНК (-). Общий размер 12, 2 kb.

Partitiviridae Alphacryptovirus White clover cryptic virus 1 (WCCV-1) Betacryptovirus White clover cryptic virus 2 (WCCV-2) Без оболочки. Икосаэдрический капсид (Т=1 предположительно), около 3540 нм в диаметре. Два геномных сегмента (1, 4 -3 kb каждый) представлены дц РНК, расположенных в отдельных капсидах.

Reoviridae Oryzavirus Rice ragged stunt virus (RRSV) Fijivirus Fiji disease virus (FDV) Без оболочки. Имеет двойной капсид 70 нм диаметром. Наружный неполный капсид имеет Т = 13 икосаэдрической симметрии, внутренний капсид Т = 2 икосаэдрической симметрии. Капсид состоит из 4 типов белков. Геном сегментированнный (10 сегментов общей длиной 26 kb) представлен линейной дц. РНК кодирует 12 белков.

Endornaviridae Endornavirus Vicia faba endornavirus (VFV) эндорнавирус конского горошка Не имеет истинного капсида. Полимераза инкапсулируется вместе с линейным дц. РНК геномом. На расстоянии 1 -2 kb от 5ʹ конца обнаружен одноцепочечный разрыв (ник) в кодирующей цепи. Предположительно геном кодирует 1 ОРС. Транслируется 1 белок, который после расщепляется на функциональные белки. Репликация происходит в цитоплазматических везикулах.