Ведомственная коллекция полезных микроорганизмов сельскохозяйственного назначения Россельхозакадемии RCAM

Ведомственная коллекция полезных микроорганизмов сельскохозяйственного назначения Россельхозакадемии (RCAM) Роботизированный криобанк микроорганизмов – уникальная возможность для долгосрочного авторизованного хранения коммерческих Сафронова В. И. , Тихонович И. А. ГНУ Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии Россельхозакадемии Санкт-Петербург

Преимущества метода криоконсервации микроорганизмов • Сохранение жизнеспособности культур микроорганизмов в течение десятилетий без единого пересева • Обеспечение генетической стабильности (сохранение всех свойств культур, в т. ч. практически-ценных) • Возможность проведения генетической паспортизации штаммов в целях защиты авторских прав Метод рекомендован для использования в БРЦ микроорганизмов

Недостатки использования сосудов Дьюара и морозильных камер • низкая оперативность • высокая вероятность ошибок • флуктуации температуры в камере • возможность несанкционированного отбора коммерческих штаммов

Роботизированная система хранения - принципиально новый подход к проблеме надежного поддержания биологических образцов (культур микроорганизмов, ДНК, белков) Преимущества: • Стабильная температура хранения (− 80°C), исключение флуктуаций температуры в камере; • Организация авторизованного доступа к штаммам; • Вместимость (200 000 образцов); • Минимизация ошибок оперирования; • Защитные противоаварийные системы.

Уникальные 2 D-баркоды на дне пробирок позволяют локализовать образцы в хранилище и отследить все их перемещения. С помощью робота Tube. Picker единичные образцы отбираются без выгрузки (размораживания) целого штатива.

Система паролей при различных уровнях доступа размещение, выдача, контроль ж/c открытый доступ A B 1 B 2 ограниченный доступ закрытый доступ A … А - пароль руководителя коллекции В 1, В 2 … - пароли сотрудников коллекции С 1, С 2, С 3 … - пароли депозиторов A+C 1 A+C 2 A+C 3 …

Средства обеспечения стабильной температуры в хранилище Основные средства Резервные средства Генератор переменного тока Электрическая сеть ИБП 10 КВт Рефрижератор основной резервный Хранилище Генератор LN 2 back up система

Институты Россельхозакадемии – участники RCAM ГНУ Всероссийский институт защиты растений ГНУ Гос. НИИ хлебопекарной промышленности ГНУ ВНИИ пищевых ароматизаторов, кислот и красителей ГНУ ВНИИ мясной промышленности ГНУ ВНИИ пищевой биотехнологии ГНУ ВНИИ кормов ГНУ Дальневосточный зональный научноисследовательский ветеринарный институт ГНУ ВНИИ ветеринарной санитарии, гигиены и экологии ГНУ Якутский научноисследовательский институт сельского хозяйства

Полезные свойства микроорганизмов сельскохозяйственного назначения: • Антифунгальная активность • Энтомоцидные свойства • Биодеградация • Ростстимулирующий эффект • Антистрессовая активность • Продукция пищевых компонентов • Консервирующие свойства

Международные научные связи RCAM Университет г. Ланкастер ------- Ассоциативные бактерии, (Великобритания) утилизирующие АБК Научный центр г. Сассари ------- Микросимбионты (Италия) засухоустойчивых бобовых Университет г. Ватерлоо -------- Ассоциативные бактерии с АЦК (Канада) деаминазой Университет г. Вагенинген -------(Голландия) Бактерии с антифунгальной активностью Университет г. Хельсинки -------(Финляндия) Клубеньковые бактерии малоизученных видов бобовых культур

Система Bio. Log для идентификации микроорганизмов с помощью мультисубстратного тестирования:

Паспортизация коммерческих штаммов микроорганизмов с помощью геномного анализа

Методы, перспективные для молекулярногенетической паспортизации коммерческих штаммов микроорганизмов • Метод пульс-электрофореза (PFGE) - фракционирование высокомолекулярных ДНК от 10 тпн до 10 млн пн с помощью электрофореза в агарозном геле в условиях периодически меняющегося по направлению электрического поля. • Секвенирование обширных участков генома микроорганизмов (или целых геномов) с помощью системы Junior GS (Roche) для высокопроизводительного пиросеквенирования.

Резюме • • • Ведомственная коллекция Россельхозакадемии обладает обширным фондом микроорганизмов для использования в растениеводстве, земледелии, ветеринарии, пищевой промышленности. Коллекция обеспечивает долгосрочное хранение микроорганизмов без потери их ценных свойств. Коллекция гарантирует авторизованный доступ к практически-ценным штаммам, а также проводит их паспортизацию с целью защиты авторских прав.

СПАСИБО ЗА ВНИМАНИЕ