Сплайсинг митохондриальных транскриптов Экзоны Интроны Открытые рамки

Сплайсинг митохондриальных транскриптов

Экзоны Интроны Открытые рамки считывания в интронах

Мобильность митохондриальных интронов

Интроны группы I Хоминг

Хоминг – Горизонтальный перенос интрона в последовательность, в которой этот интрон отсутствует – Происходит с высокой частотой, высокоспецифичное событие – Результатом хоминга является дупликация интронной последовательности – Эндонуклеазы, инициирующие хоминг, закодированы в последовательности, находящейся внутри интрона

Интроны группы II Ретрохоминг • В основе лежит внедрение интронной РНК в 2 -нитевую ДНК • Закодированная в этой последовательности обратная транскриптаза экспрессируется и синтезирует к. ДНК на интронной последовательности, которая встраивается в комплементарную цепь • РНК-матрица деградирует, образовавшаяся брешь застраивается по матрице к. ДНК • Ретрохоминг приводит к дупликации интронов группы II

Интроны группы II Эктопическая инсерция • В основе лежит обратный сплайсинг, т. е. внедрение интронной РНК в другую молекулу РНК за счет комплементарности IBS и EBS • Закодированная в этой последовательности обратная транскриптаза экспрессируется и синтезирует к. ДНК на интронной последовательности, которая встраивается в комплементарную цепь • РНК-матрица деградирует, образовавшаяся брешь застраивается по матрице к. ДНК • Ретрохоминг приводит к дупликации интронов группы II

Two pathways for retrotransposition of group II introns: a retrohoming, and b, ectopic insertion. During the highly sequence-specific retrohoming reaction (a), an intron-encoded protein facilitates attack of the lariat intron on the sense-strand of the DNA duplex (i, iii). The protein also cleaves the antisense strand (ii) and reverse-transcribes the inserted intron RNA (iv, v). Two cycles of reverse transcription followed by gap repair may serve to stably integrate the intron DNA. During ectopic insertion (b), the lariat RNA recognizes another RNA molecule through a weak set of EBS 1/IBS 1 base pairs (i). The lariat then catalyzes its own reverse splicing into the RNA (the role of the protein is unclear) (ii). This modified RNA is then reverse transcribed in both directions to generate a c. DNA, which becomes stably incorporated through recombination (ii−v).

Импорт белков в митохондрии

Mitochondrial protein import: co- and post-translational Lithgow, FEBS Letts. 476: 22 -26, 2000.

Cytoplasmic ribosomes can associate with outer membrane Lithgow, FEBS Letts. 476: 22 -26, 2000.

Helical Wheel Projection of COX IV Presequence

Mito. protein -import involves two transport complexes: Tom & Tim Pfanner, Current Biol. 10: R 412, 2000