Семейства белковрегуляторов транскрипции у эукариот.
Типы транскрипционных факторов § Базальные – обязательно необходимые, для связывания РНК-полимеразы с промотором. § Активаторы- белки, связывающиеся с промотором и усиливающие транскрипцию § Репрессоры - белки, связывающиеся с промотором и угнетающие транскрипцию § В эукариотах последовательность на промоторе, узнаваемая активаторами называется response element § Коактиваторы- факторы не связывающиеся с ДНК, но необходимые для связывания факторов с ДНК.
Response element § § Heat shock response element (HRE) Glucocorticoid response element (CRE) Estrogen response element (ERE) Serum response element (SRE)
Способы активации ТФ
Классификация транскрипционных факторов § Факторы, ДНК-связывающий домен которых обогащен положительно заряженными аминокислотными остатками -Факторы с доменами спираль-петля-спираль (b. HLH) § Факторы, у которых ДНК-связывающий домен формируется с участием координированных ионов цинка - zinc-coordinated DNA-binding domain § Факторы, имеющие ДНК-связывающий мотив типа спираль-поворот-спираль ( helix-turn-helix DNA binding motif, 369 факторов ). -Гомеодомены
Zn-finger (Цинковый палец). ”Классический” C 2 H 2 § Cys-X 2 -4 -Cys-X 3 -Phe-X 5 -Leu-X 2 -His-X 3 -His § His и Cys остатки связываются с Zn благодаря чему весь мотив сворачивается в компактный домен § В одном белке может Содержаться от 2 до 30 Цинковых пальцев
Zn-finger C 2 H 2 § С- концевая часть каждого пальца формирует альфа-спираль. § N-концевая часть Каждого пальца формирует бета-лист. § Каждая альфаспираль формирует 2 специфичных контакта с ДНК
Взаимодействие с ДНК
Ядерные рецепторы гормонов как активаторы § Лиганд-зависимые активаторы. § Имеют отдельные ДНК - и лиганд – связывающие домены.
Способы активации ТФ
Стероидные рецепторы имеют Zn-finger типа C 4 § ДНК –связывающие домены стероидных рецепторов – разновидность Zn-finger, имеющих Cys , но не His остатки. § Cys-X 2 -Cys-X 13 -Cys-X 2 -Cys § Стероидные рецепторы связываются с ДНК как димеры (палиндромный сайт посадки на ДНК)
Глюкокортикоидные и эстрагеновые рецепторы § 2 цинковых пальца § 1 ый участвует ДНК-связывании. § 2 ой отвечает за димеризацию. § Образуют гомодимеры
Тиреоидные и ретиноидные рецепторы. § Образуют гетеродимеры. § Сайт посадки – прямые ДНК повторы. § Разным гетеродимерам соответствуют последовательности на ДНК с разной длиной между прямыми повторами.
Zn-finger(Zn 2 C 6) в структуре фактора GAL 4
К вопросу о димерах и мономерах. .
Белки с гомеодоменами § Гомеодомен – ДНК-связывающий домен ок. 60 а. о. , образующих 3 альфаспирали. § 17 а. о третьей альфа-спирали на Сконце взаимодействуют с большой бороздкой ДНК § Белки с гомеодоменами могут быть как активаторами, так и репрессорами транскрипции
Белки с гомеодоменами
НТН-мотив встречающийся в гомеодоменах также встречается у прокариот. HTH мотив Спецефические Взаимодействия Не специфические Взаимодействия
Нelix-loop-heliх § helix-loop-helix (HLH) =спираль-петля-спираль – мотив, ответственный за димеризацию класса транскрипционных факторов (HLH белков) § b. HLH белки имеют ДНК-связывающий участок, прилегающий к HLH мотиву. § HLH белки длиной 40 -50 а. о. , содержат 2 амфипатический альфа-спирали, разделенные 15 -16 а. о § HLH белки связываясь с b. HLH белками образуют гетеродимер не способный связываться с ДНК.
Нelix-loop-heliх
Пример регуляции при помощи HLH белков
Leucine zippers – Лейциновая молния § Лейциновая молния – тип димеризующего мотива. § Димеризация происходит за счет амфипатической cпирали, в которой каждым седьмым аминокислотным остатком является Leu § Все боковые остатки Leu выступают с одной стороны альфа-спирали и при воздействии двух полипептидных цепей переплетаются друг с другом, как в застежке-молнии
Signaling
Скачать презентацию Семейства белковрегуляторов транскрипции у эукариот Типы транскрипционных
905d5326c2fd31bc03b7aea1d5ead4bf.ppt