белки.ppt
- Количество слайдов: 28
Рис. 1 -1. Уровни организации белковой структуры: первичная структура (аминокислотная последовательность), вторичная структура (a-спираль и один тяж b-структуры), третичная структура глобулы, сложенной одной цепью, и четвертичная структура олигомерного (в данном случае - димерного) белка.
Рис. 1 -2. Доменная структура большого белка сходна с четвертичной структурой, сложенной из малых белков.
Рис. 1 -4. Три сходных по форме, но разных по функции aспиральных белка: цитохром c', миогемэритрин и белок оболочки вируса табачной мозаики. Показана как белковая цепь, так и кофакторы: скелетные модели — гем (в цитохроме) и фрагмент РНК (в белке оболочки вируса), оранжевые шарики — ионы железа (в геме цитохрома и в миогемэритрине), красный шарик — связанный железом кислород (в миогемэритрине).
Рис. 1 -5. Два разных по форме, но почти идентичных по функции белка (сериновые протеазы): химотрипсин и субтилизин. Несмотря на кардинальное различие в укладке цепи, их каталитические центры состоят из одинаковых и одинаково в пространстве расположенных остатков: Ser 195 (оранжевый), His 57 (синий) и Asp 102 (малиновый) в химотрипсине, и Ser 221 (оранжевый), His 64 (синий) и Asp 32 (малиновый) в субтилизине.
ЯМР Рентгеноструктурный анализ
, Рис. 11 -2. Перевитые правые a-спирали.
Рис. 12 -2. Бактериородопсин в мембране (а - вид вдоль мембраны, б - вид на мембрану сверху). Цилиндрами показаны семь спиралей этого белка. Показаны и соединяющие эти спирали петли, а также (голубым цветом) молекула ретинола, прикрепленная внутри бактериородопсина.
Рис. 12 -3. Порин. (а) Вид вдоль плоскости мембраны (расположение липидов в ней показано очень схематично). (б) Вид поперек плоскости мембраны.
Рис. 12 -5. Фотосинтетический реакционный центр. Мембрана показана схематично. Трансмембранная субъединица М выделена голубой раской, трансмембранная субъединица L — зеленой, субъединица Н (у нее есть одна трансмембранная спиралью) — желтой; цитохром — серый. Обратите внимание, насколко внутримембранные части регулярнее внемембранных! Субъединицы L и М связывают фотосинтетические пигменты — хлорофиллы (красные с желтым ионом магния в центре) и феофитины (темно-синие). И у тех, и у других есть длинные гидрофобные "хвосты", выступающие из белка в мембрану. Субъединицы L, M связывают и два хинона (выделенные фиолетовой окраской). Цитохром, лежащий вне мембраны, включает четыре гема (черно-серые, с оранжевыми ионами железа внутри). Все кофакторы изображены в виде скелетных моделей
белки.ppt