
Распространение и молекулярная диагностика полиморфизма c1c2 в гене cyp2e1.ppt
- Количество слайдов: 13
РАСПРОСТРАНЕНИЕ И МОЛЕКУЛЯРНАЯ ДИАГНОСТИКА ПОЛИМОРФИЗМА C 1/C 2 В ГЕНЕ CYP 2 E 1 ЖИТЕЛЕЙ РЕСПУБЛИКИ МОРДОВИЯ Слайд 1
• Профессор Кирка Вилгельмсен с сотрудниками из Университета Северной Каролины провели серию экспериментов и сделали вывод, что реакцию организма на алкоголь определяет расположенный в конце 10 -й хромосомы ген CYP 2 E 1. • Однако влияние данного гена на физиологические процессы гораздо шире и определяется различными полиморфными вариантами. • Вариант T полиморфизма Rsa. I (Rsa. I c 2) способствует повышенной транскрипционной активностью и связан с алкогольной болезнью печени в то время как вариант С полиморфизма Pst. I (Pst. I+) соответсвует повышенному риску развития онкологических заболеваний. Вариант C полиморфизма Dra. I тоже является онкологическим маркером. В европейский популяциях, частоты встречаемости вариантов Rsa. I c 2 и Pst. I+ составляют 1– 3%, встречаемость варианта Dra. I около 10%. Также риск развития онкологического процесса у людей имеющих данный полиморфизм повышается при употребление соленой пищи и курении, даже в небольшом количестве. Слайд 2
Актуальность: Изучение полиморфизма с1/с2 в гене CYP 2 E 1, его функционирования и способов регулирования его активности может позволить существенно снизить возможность развития алкоголизма и других патофизиологических состояний. Слайд 3
• Цель работы – изучение полиморфизма с1/c 2 гена CYP 2 E 1 у жителей Республики Мордовия. Задачи: 1. Дать структурно-функциональную характеристику гену CYP 2 E 1. • 2. Изучить основные полиморфные варианты и мутации в исследуемом гене. • 3. Провести анализ данных по частоте встречаемости полиморфизма с1/c 2 гена CYP 2 E 1 у жителей республики Мордовии • Слайд 4
хромосома 10 Слайд 5
Расположение экзонов в гене CYP 2 E 1 Слайд 6
Структура гена cyp 2 e 1 Слайд 7
Таблица 1. 2. 1. 1 – Номенклатура аллелей CYP 2 E 1 гена Аллель Белок Однонуклеотидные замены CYP 2 E 1*1 A CYP 2 E 1. 1 – CYP 2 E 1*1 B CYP 2 E 1. 1 9893 C>G CYP 2 E 1*1 C CYP 2 E 1. 1 6 тандемов CYP 2 E 1*1 D CYP 2 E 1. 1 8 тандемов CYP 2 E 1*2 CYP 2 E 1. 2 1132 G>A CYP 2 E 1*3 CYP 2 E 1. 3 10023 G >A Pst. I CYP 2 E 1*4 CYP 2 E 1. 4 4768 G>A Rsa. I CYP 2 E 1*5 A CYP 2 E 1. 1 – 1293 G>C – 1053 C>T Dra. I Pst. I CYP 2 E 1*5 B CYP 2 E 1. 1 7632 T>A – 1293 G>C Rsa. I Dra. I CYP 2 E 1*6 CYP 2 E 1. 1 – 1053 C>T CYP 2 E 1*7 A CYP 2 E 1. 1 7632 T>A CYP 2 E 1*7 B CYP 2 E 1. 1 – 333 T>A CYP 2 E 1*7 C Эндонуклеаза рестрикции Taq. I Dra. I, Xba. I – 71 G>T; – 333 T>A; – 352 A>G Слайд 8
• Материал исследования • Материалом для исследования послужили образцы ДНК, полученные из цельной венозной крови как здоровых, так и больных людей. • Методы исследования • Выделение ДНК проводили из образцов цельной крови с использованием протеиназы К (по L. L. Boodram) • Полиморфизмы генов анализировали методом ПЦР, а разделение фрагментов ДНК проводили методом электрофореза в 1, 5% агарозном геле. • В результате электрофоретического исследования на выявление полиморфизма c 1/с2 нами были получены электрофореграммы • Статистическая обработка данных. Слайд 9
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 Электрофореграммы полиморфизма с1/с2 гена СYP 2 E 1 Слайд 10
• В мордовской популяции для полиморфизма с1/с2 в гене CYP 2 E 1, согласно данным статистической обработки, частота нормального гомозиготного генотипа 27% (4 из 15 образцов). Встречаемость гетерозиготного генотипа наблюдалось у 53% (8 из 15 образцов). Встречаемость патологического генотипа составляет 20% (3 из 15 образцов) (рисунк 3. 1. 1. 1). • Таким образом цитохром 2 E 1, также как и другие ферменты суперсемейства P 450 в зависимости от того или иного полиморфного варианта кодирующего гена влияют на физиологические и метаболитические процессы организма и нередко приводят к возникновению патологического процесса. Слайд 11
• В ходе выполнения работы нами были изучены: 1. Структура гена CYP 2 E 1, его строение, локализация в хромосоме. Было показано, что данный ген находится в хромосоме 10, в локусе 10 q 24. 3–qter и кодирует фермент, который имеет молекулярную массу 56 к. Д. Наличие полиморфизмов в гене CYP 2 E 1, связанно с высоким риском развития алкогольной болезни печени, гипертонической болезни у людей злоупотребляющих алкоголем. • Вариант T полиморфизма Rsa. I (Rsa. I c 2) характеризуется повышенной транскрипционной активностью и был ассоциирован с алкогольной болезнью печени в то время как вариант С полиморфизма Pst. I (Pst. I+) соответсвует повышенному риску развития онкологических заболеваний. Вариант C полиморфизма Dra. I также является онкологическим маркером. • 2. Проведен анализ данных по частоте встречаемости полиморфизмов гена CYP 2 E 1 в различных популяциях. В исследуемой нами группе людей было выявлено для полиморфизма с1/с2 в гене CYP 2 E 1, согласно полученным данным, частота нормального гомозиготного генотипа 27% (4 из 15 образцов). Встречаемость гетерозиготного генотипа наблюдалось у 53% (8 из 15 образцов). Встречаемость патологического генотипа составляет 20% (3 из 15 образцов) • Слайд 12