ПРИМЕНЕНИЕ ТЕОРИИ ГРАФОВ К ОПИСАНИЮ СТАЦИОНАРНОЙ КИНЕТИКИ

ПРИМЕНЕНИЕ ТЕОРИИ ГРАФОВ К ОПИСАНИЮ СТАЦИОНАРНОЙ КИНЕТИКИ ФЕРМЕНТАТИВНЫХ РЕАКЦИЙ

Выражение для скорости реакции имеет вид дробно-рационального выражения, числитель которого содержит 8 слагаемых, а знаменатель - 32 слагаемых

путь (A D) = abc. а, b, c – ветви графа (дерева)

Параллельные ветви графа складываются (А B) = a +b

Ветви, направленные к одной базе из разных вершин, перемножаются ( B ) = a b

Общая формула для скорости ферментативной реакции в методе графов

Простейший случай одноцентровой реакции

k 1[S] E ES k-1 k 2 P

k 1[S] E ES k-1 k 2 P Базовые деревья BES = k 1[S], BE = k-1 + k 2

Делим числитель и знаменатель на k 1 k-3

Трехстадийная реакция с участием ацилферментного промежуточного соединения

Обработка схем стационарных ферментативных реакций в модификации Фромма

двухсубстратная ферментативная реакция с неупорядоченным присоединением субстратов

ветвь ЕА Е умножается на сумму величин ветвей, выходящих из вершин ЕВ и ЕАВ, ветвь ЕАВ Е умножается на сумму величин ветвей, выходящих из вершин ЕА и ЕВ, и т. д. ;

Упростив, получим

МЕТОД ДИАГРАММ ДЛЯ ОПИСАНИЯ СКОРОСТЕЙ ФЕРМЕНТАТИВНЫХ РЕАКЦИЙ С РАВНОВЕСНЫМИ СТАДИЯМИ

схема двухсубстратной необратимой ферментативной реакции с упорядоченным присоединением субстратов, в которой ингибитор конкурентно вытесняет второй субстрат В из комплекса с ферментом

вход k 3 выход если направление дуги соответствует присоединению реагента X, то ее величина равна Х/К; если отщеплению реагента - К/Х.