Скачать презентацию Популяционно-статистический метод используется при изучении распространения наследственных Скачать презентацию Популяционно-статистический метод используется при изучении распространения наследственных

07 ПОПУЛЯЦИЯ ДНК АНАЛИЗ.ppt

  • Количество слайдов: 31

Популяционно-статистический метод используется: • при изучении распространения наследственных болезней, • для прогноза их частоты Популяционно-статистический метод используется: • при изучении распространения наследственных болезней, • для прогноза их частоты в последующих поколениях, • частоты нормальных к и патологических генов, генотипов и фенотипов в популяциях, • закономерностей мутационного процесса, • роли наследственности и среды в возникновении болезней с наследственной предрасположенностью. Принцип генетического равновесия Харди и Вайнберга 1908 г. В популяции соотношение частоты доминантных гомозигот (АА), гетерозигот (Аа) и рецессивных гомозигот (аа) сохраняется постоянным из поколения в поколение, если никакие факторы среды не нарушают это равновесие. Соблюдаться в идеальной популяции: • большая численность, • свободное скрещивание, • отсутствие отбора и мутационного процесса, • отсутствие миграций в популяцию и из нее.

Частота аллелей в генофонде - p+q =1 Частота генотипов - p 2 + 2 Частота аллелей в генофонде - p+q =1 Частота генотипов - p 2 + 2 pq + q 2 =1 где • р — частота A, • q — а, • р2 — АА , • q 2 — аа, • 2 pq – Аа. Пример. В одном из городов при обследовании на резус-фактор: • 16 % людей оказалась Rh – • 84 % — Rh + Носители Rh + имеют генотипы СС или Сс. тогда р2 СС + 2 pq Сс + q 2 cc = 1 Если сс оставляют 16% или 0, 16; отсюда q (с) = √ 0, 16 = 0, 40 или 40 %. р (С)= 1 — 0, 40 = 0, 60 или 60 %. Гомозиготы СС = р2 = (0, 60)2= 0, 36 или 36%; Гетерозиготы Сс = 2 pq = или 2 х 0, 60 х 0, 40 = 0, 48 или 48 %.

Цитогенетический метод Цитогенетическое исследование, применяется: • для диагностики хромосомных болезней, • составления генетических карт Цитогенетический метод Цитогенетическое исследование, применяется: • для диагностики хромосомных болезней, • составления генетических карт хромосом, • изучения мутационного процесса и других проблем генетики человека. В 1960 г. в г. Денвере (США) была разработана первая международная классификация хромосом человека. В ее основу легли размеры хромосом и положение первичной перетяжки — центромеры.

Группа хромосом Номер по кариотипу Размер, Характеристика хромосом мкм А(1) 1, 2, 3 11 Группа хромосом Номер по кариотипу Размер, Характеристика хромосом мкм А(1) 1, 2, 3 11 -8, 3 1 и 3 - метацентрические, 2 - крупная субметацентрическая В(И) 4, 5 7, 7 Крупные субметацентрические С(Ш) 6 -12 7, 2 -5, 7 Средние субметацентрические D(IV) 13 -15 4, 2 Средние акроцентрические E(V) 16 -18 3, 6 -3, 2 Мелкие субметацентрические F(VI) 19 -20 2, 3 -2, 8 Самые мелкие метацентрические Х-хромосома (относится к группе III) 23 Средняя

В 1971 г. на IV Парижской конференции были представлены результаты дифференциальной окраски хромосом. В 1971 г. на IV Парижской конференции были представлены результаты дифференциальной окраски хромосом.

Метод флюоресцентной гибридизации in situ (FISH). Метод флюоресцентной гибридизации in situ (FISH).

Метод генетики соматических клеток Метод генетики соматических клеток

Биохимический метод Биохимический метод

ДНК-технологии ДНК-технологии

Этапы молекулярно-генетического анализа ДНК: • получение образцов ДНК или РНК, • амплифицикация с пользованием Этапы молекулярно-генетического анализа ДНК: • получение образцов ДНК или РНК, • амплифицикация с пользованием ЦПР

 • расщепление молекул ДНК (рестрикция) • расщепление молекул ДНК (рестрикция)

 • анализ фрагментов рестрикции и построение рестрикционной карты. • анализ фрагментов рестрикции и построение рестрикционной карты.

Для выявления специфических фрагментов ДНК, используют блот-гибридизацию по Э. Саузерну (1975): • Образцы ДНК Для выявления специфических фрагментов ДНК, используют блот-гибридизацию по Э. Саузерну (1975): • Образцы ДНК смешивают с ферментами рестрикции и получают рестрикционные фрагменты; • Рестрикционные фрагменты ДНК разделяют в зависимости от длины при помощи электрофореза; • агарозный гель с рестрикционными фрагментами ДНК помещают на фильтровальную бумагу, смоченную концентрированным солевым раствором; • на гель накладывают нитроцеллюлезный фильтр, а сверху помещают сухую фильтровальную бумагу, в которую впитывается солевой раствор, • за счет капиллярности фрагменты ДНК переносится вместе с раствором и задерживается фильтром (блотом); • чтобы выявить нужные фрагменты, проводят гибридизацию ДНК с радиактивным ДНК-зондом; • результат гибридизации радиоактивного ДНК-зонда и фрагмента ДНК обнаруживают с помощью радиоавтографии:

С помощью метода Саузерна можно составить: • рестрикционную карту участков исследуемого гена • и С помощью метода Саузерна можно составить: • рестрикционную карту участков исследуемого гена • и установить, несет ли данный ген какие-либо дефекты. Различия сайтов рестрикции гомологичных хромосом выявляются в виде различных образцов рестрикционных фрагментов, что получило название - полиморфизм длины рестрикционных фрагментов (RFLPs). Разнообразие форм рестрикционных фрагментов наследуется и является генетическим маркером локусов в геноме, что позволяет идентифицировать мутантные аллели. Геном человека может быть картирован на уровне ДНК. Проект «Геном Человека» имел свое начало в 1990 г. и к 2003 г. большинство нуклеотидных последовательностей ДНК хромосом человека было установлено. Картирование генома включало три стадии: • генетическое картирование сцепленных генов; • физическое картирование; • секвенирование ДНК (определение нуклеотидных последовательностей).

Секвенирование ДНК. Обычно используют методику, разработанную Ф. Сэнгером (F. Sanger): • ДНК денатурируют, • Секвенирование ДНК. Обычно используют методику, разработанную Ф. Сэнгером (F. Sanger): • ДНК денатурируют, • далее цепь ДНК инкубируют с праймером, ДНК-полимеразой, дезоксирибонуклеотидами и дидезоксирибонуклеотидами, меченными разными красителями; • синтез каждой новой цепи начинается с 3’ конца праймера и продолжается до включения дидезоксирибонуклеотида; • в результате синтезируются разные по длине цепи с разными по цвету последними нуклеотидами, • смесь меченных цепей ДНК помещают в капиллярную трубку с полиакриламидным гелем и разделяют в зависимости от длины, • флуоресцентный детектор считывает цвет нуклеотидов; цепи, различающиеся на один нуклеотид идентифицируются, • результаты печатаются в виде спектрограммы, что позволяет определить комплементарную матрице последовательность нуклеотидов. Секвенирование дает возможность выявить замены оснований, делеции и вставки в изучаемом фрагменте.

Методы пренатальной диагностики Показания. 1). Наличие в семье точно установленного наследственного заболевания. 2). Наличие Методы пренатальной диагностики Показания. 1). Наличие в семье точно установленного наследственного заболевания. 2). Наличие в семье заболевания, сцепленного с полом. 3). Возраст будущей матери от 35 лет, а отца — от 40 лет. 4). Гетерозиготность обоих родителей по одной паре аллелей при аутосомно-рецессивиом заболевании 5). Наличие структурных перестроек хромосом у одного из родителей. 6). Наличие в анамнезе беременной, длительной работы на вредных для здоровья производствах, проживание в зонах с повышенным радиационным фоном и др.

К основным методам пренатальной диагностики относятся: 1. Определение альфа-фетопротеина. 2. Ультразвуковое исследование плода (УЗИ). К основным методам пренатальной диагностики относятся: 1. Определение альфа-фетопротеина. 2. Ультразвуковое исследование плода (УЗИ). 3. Биопсия хориона и плаценты. 4. Амниоцентез (прокол плодного пузыря для получения околоплодной жидкости). 5. Кордоцентез (взятие крови из пуповины). 6. Фетоскопия (введение зонда и осмотр плода). Показания к дородовой диагностике: 1). Наследственное заболевание в семье. 4). Гетерозиготность родителей. 2). Возраст будущей матери от 35 лет, а отца — от 40 лет. 5). Наличие структурных перестроек хромосом (особенно транслокаций и инверсий) у одного из родителей. 6). Наличие в анамнезе беременной длительной работы на вредных для здоровья производствах, проживание в зонах с повышенным радиационным фоном и др.

Ультразвуковое исследование (УЗИ) Оптимальные сроки проведения — 17 -23 недели беременности. С помощью УЗИ Ультразвуковое исследование (УЗИ) Оптимальные сроки проведения — 17 -23 недели беременности. С помощью УЗИ можно исследовать строение плода. Биопсия хориона и плаценты Проводится на 7 -9 недели. С помощью цитологических, биохимических, молекулярногенетических методов исследуют клетки ворсинок. Характерна относительно высокая частота спонтанных абортов. Амниоцентез Проводится на 15 -18 -й неделе беременности. Риск осложнения ее течения незначителен (0, 2%). Кордоцентез Проводится на 18 -22 -й неделе беременности. Фетоскопия Проводится на 18 -23 -й неделе беременности. Фетоскопия используется редко и только при особых показаниях, может вызвать осложнение беременности.