Скачать презентацию Поиск химической информации МПХИ_2013 1 Методология
лекция1_2013.ppt
- Количество слайдов: 84
Поиск химической информации МПХИ_2013 1
«Методология поиска химической информации» «Введение в поиск химической информации» ØЛекции – 5 занятий Øпрактикум (5 занятий у каждой группы) с 19 февраля Методическое пособие «Поиск химической информации в Интернетпространстве» на сайте интернет-класса химфака, библиотека ПГУ http: //ic-gw. chemistry. psu. ru: 8888/moodle Найти логины и пароли! МПХИ_2013 2
MOODLE -модульная объектноориентированная динамическая учебная среда (module object oriented dynamic learning environment) — свободная система управления обучением (LMS), распространяющаяся по лицензии GNU GPL - General Public License иногда переводят, как, например, Универсальная общественная лицензия GNU, GNU - свободная UNIX-подобная операционная система «GNU is Not Unix» Рекурсивный акроним МПХИ_2013 http: //ic-gw. chemistry. psu. ru: 8888/moodle 3
q. Классификация и примеры основных несетевых справочных и реферативных изданий по химии. q. Возможности работы с ними и их расположение в Интернете q. Химические издания (книги, учебники, справочники и т. п. ) в Интернете qструктура Интернета qпоисковые сервисы q. Каталоги qпоисковые системы (ПС) qпоисковые запросы q. Основные правила поиска в ПС: Yandex, Google, Scholar Google, Scirus q. Применение для поиска УДК, DOI, ISSN, ISBN q. Система SMILES, In. Chi кодов q. Поиск сокращений и по сокращениям q. Основные химические журналы и издательства. q. Поиск по структурным формулам q. Химические базы данных (библиографические, спектральные и др. )- Sci. Finder, Scopus, Web Of Science, Reaxys q. Использование социальных сайтов. МПХИ_2013 4
«синдром информационной усталости» 1998 г. – количество web-сайтов – 2013 г. - web-сайтов – около 1 миллиона около 630 миллионов (декабрь, 2012, Netcraft) 1, 2 триллиона запросов Google на 146 языках за 2012 год МПХИ_2013 5
http: //erpnews. ru/details. php? image_id=1764 Совокупный объем цифровой информации в 2006 году составил 161 миллиардов гигабайт (161 экзабайт). Это приблизительно в 3 миллиона раз больше объема информации, содержащейся во всех когда-либо написанных книгах. Если годовой объем информации, созданной человечеством, перевести в формат книг, то получится 12 стопок, каждая из которых превышает расстояние от Земли до Солнца -150 млн. км. МПХИ_2013 6
«Мы утратили мудрость ради знаний, знания мы потеряли в потоке информации, а информацию — в данных» , — констатация, начатая Т. С. Элиотом (нобелевским лауреатом 1948 г. по литературе) и продолженная А. Кливлендом, как нельзя лучше отражает объективную ситуацию: информационный поток поддается контролю всё с большим и большим трудом МПХИ_2013 7
«В жизни, как правило, преуспевает больше других тот, кто располагает лучшей информацией» ( Бенджамин Дизраэли) МПХИ_2013 8
Неинформированность – сразу означает отставание (Джеймс Уотсон) Информация – 1) сообщение о чем-либо; 2) сведения, являющиеся объектом хранения, переработки и передачи; 3) в математике, кибернетике – количественная мера устранения неопределенности (энтропии), мера организации системы. Чаще всего под термином «химическая информация» понимается совокупность данных, касающихся синтетических и природных химических веществ: -их строение, состав, химические и физико-химические свойства, -биологическая активность, -нахождение в природе, -получение, выделение, очистка, анализ; - их взаимодействие между собой и с другими объектами (физическими и биологическими). Свойства информации – достоверность, полнота, актуальность, ясность, ценность Любую информацию нужно уметь: находить, использовать, хранить. МПХИ_2013 9
Предшественники химических справочных изданий Плиний Старший (23 -79)– (гибель Помпеи, 24 авг. 79 н. э. ) «Естественная история» , 37 томов Джабир ибн Хайян , Гебер (арабский алхимик) Абу-Бакр Муххамед, ибн Закария Ар-Рази (алхимик) Альберт Великий "Книга семидесяти" изложены химико-металлургические знания того времени "Книга тайн" "Книга тайны тайн" Первая попытка классифицировать все "Книга об алхимии" известные к тому периоду вещества. Первые энциклопедии В. Бирингуччо Г. Агрикола (Бауэр) А. Либавий "О пиротехнии" (1540) "О горном деле и металлургии" (1556) "Алхимия" (1597). МПХИ_2013 10
Словарь — это вселенная в алфавитном порядке Вольтер Первые химические словари (17 - 18 вв. ), 1 -2 -томные издания, материал располагался по алфавиту: ØRuland М , Lexicon Alchemiae, Francofurti, 1612; ØJоhnson W. , Lexicon chymicum, v. 1 -2, L. , 1652 - 53; ØМасquеr Р. , Dictionnaire dе chymie. . . , v. 1 - 2, Р. , 1766 (русские переводы многих статей с некоторыми изменениями опубликованы в 1788 - 90 г. в журнале Н. И. Новикова "Магазин натуральной истории, физики и химии". ч. 1 - 10) и др. ØВ. М. Севергин (начало 19 века ) издал сочинение Ш. Каде (Ch. Cadet) "Словарь химический, содержащий в себе теорию и практику химии с приложением ее к естественной истории и искусствам, обработанный на российском языке трудами Василия Севергина" (ч. 1 -4, СПБ, 1810 - 13). Словарь (диксионариус), «Собрание слов» , 1225 г. , латынь, Джон Гарланд 11 МПХИ_2013
ОСНОВНАЯ СПРАВОЧНАЯ ЛИТЕРАТУРА Формульные справочники – 1) M. Richter “Lexicon der Kohlenstoffverbindungen”, 2) R. Stelzner “Literatur-Register der Organischen Chemie”, 3) формульные указатели к реферативным журналам «Chemical Abstracts» , «Химия» . Алфавитные справочники – 1) словари (например, «Словарь органических соединений» под ред. Хейльброна и Бэнбера, ИЛ, 1949 – перевод издания «Dictionary of Organic Compounds» , London, 1946), 2) энциклопедии (например, «Химическая энциклопедия» «Энциклопедия полимеров» ), 3) химический энциклопедический словарь !! 4) предметные указатели к реферативным журналам «Chemical Abstracts» , «Химия» . http: //www. chemport. ru/data/#top Справочники, построенные по определенной системе, например, по классам соединений и другим признакам, например, 1)справочник Бейльштейна (Beilsteins Handbuch der Organischen Chemie). 2) справочное руководство «Химия» (изд. «Химия» , Лен. отд. , 1975 г. ). МПХИ_2013 12
Handbuch der organischen Chemie Первое издание справочника на немецком языке, подготовленное Бейльштейном в одиночку в бытность его профессором Петербургского технологического института, появилось в Лейпциге в 1881 году в двух томах: на 2200 страницах оно содержало информацию о 1500 соединениях. В настоящий момент справочник представляет собой электронную базу данных, содержащую описание свыше 10 млн структур и около 11 млн химических реакций. C 2009 года электронный контент продвигается компанией Elsevier под торговым именем Reaxys Фёдорович (Фридрих Конрад) Бейльштейн Friedrich Konrad Beilstein 17. 02. 1838, Санкт-Петербург — 18. 10. 1906, там же МПХИ_2013 13
Формульные справочники: система Рихтера и система Хилла. Система Рихтера ØВ брутто-формуле соединения основные элементы располагают в следующем порядке – C, H, O, N, F, Cl, Br, I, S, P ( «химический алфавит» ). ØОстальные элементы располагают в порядке латинского алфавита от A до Z. ØПо формуле выводят химический индекс, который записывают двумя цифрами: первая (арабская) показывает количество атомов углерода в соединении, вторая (римская) – число других элементов в соединении, кроме углерода С 3 H 7 ОN 3 III С 3 H 7 NО С 7 H 4 OСl. Br 7 IV С 7 H 4 Br. Cl. O Система Хилла Все элементы соединения расположены в порядке латинского алфавита, исключением являются соединения углерода, то есть органические соединения. В них на первом месте стоит углерод, на втором - водород и лишь после этого располагаются все остальные углерод элементы в алфавитном порядке (латинский алфавит). При размещении в справочнике брутто-формул по системе Хилла вначале учитывается число атомов углерода, затем - число атомов водорода и уже после число атомов других элементов в молекуле. МПХИ_2013 14
Каталоги коммерческих фирм, “Lancaster” (research chemicals, http: //www. alfa. com) поглощен фирмой“Alfa Aesar” – реактивы для научных исследований, Великобритания; Германия, работают оба сайта “Aldrich” (Catalogue Handbook of fine chemicals) –химические реактивы и оборудование “Sigma” – реактивы для биохимии и исследований в области естественных наук; “Supelco” – хроматографические продукты для анализа и очистки, хроматографическое оборудование, США; (http: //www. sigmaaldrich. com) “Merk” – реактивы, диагностика, химикаты; Германия (http: //www. merck. de и http: //www. merck. com); “Fluka” – Laboratory chemicals and analytical research; Германия (http: //www. sigmaaldrich. com) , research chemicals, metals and materials – органические и неорганические соединения, металлы, материалы; (); “Strem” – metals, inorganic and organometallic for research – металлы, неорганические и металлоорганические реагенты для исследований, США (http: //www. strem. com). «Reference Book of Fine Organics» (Acros Organics) – органические реагенты для научных исследований (www. acros. com и www. acrus. ru ) Систематизированы по: алфавитному признаку брутто-формулам (система Хилла) CAS – регистрационные номера (CAS registry number, Chemical Abstracts) Ссылки на справочник Бейльштейна МПХИ_2013 15
http: //www. sigmaaldrich. com МПХИ_2013 16
МПХИ_2013 17
МПХИ_2013 18
МПХИ_2013 19
http: //www. alfa. com/ru/gp 170 w. pgm МПХИ_2013 Структурный поиск 20
МПХИ_2013 21
http: //www. merck. com http: //www. merck-chemicals. com МПХИ_2013 22
Алфавитные справочники Краткая химическая энциклопедия. Пять томов, главный редактор И. Л. Кнунянц, изд-во «Советская энциклопедия» , I том вышел в 1961 году. Химическая энциклопедия - переиздание «Краткой химической энциклопедии» . I том вышел в 1988 году; изд-во «Советская энциклопедия» , состоит из 5 томов. Химический энциклопедический словарь. Содержит краткие сведения о большом количестве химических соединений, процессов, реакций. Практически каждая статья сопровождается библиографической ссылкой. Вышла в 1982 году под ред. И. Л. Кнунянца, изд-во «СЭ» . Справочник химика. Состоит из 6 основных томов и одним дополнительным томом. 2 -е изд. – М. – Л. изд. «Химия» , 1962 – 1968 (под ред. Б. П. Никольского). Enkyklopaidea – круг знаний (греч. ) Т. 1. Общие сведения строение вещества. Т. 5. Сырье и продукты промышленности Свойства важнейших веществ. Лабораторная неорганических веществ. Процессы и аппараты. техника. Коррозия. Гальванотехника. Т. 2. Основные свойства неорганических и органических соединений. Т. 6. Сырье и продукты промышленности органических веществ. Т. 3. Химическое равновесие и кинетика. Свойства растворов. Электродные процессы. Т. 4. Аналитическая химия. Спектральный анализ. Показатели преломления. Т. 7. (Дополнительный) Номенклатура органических соединений. Техника безопасности. Сводный предметный указатель. МПХИ_2013 23
Новый справочник химика и технолога. Основные свойства органических, неорганических и элементоорганических соединений I том Интеллектуальная собственность. Математический аппарат специалиста. Популярные пакеты прикладных программ. Общие сведения. Строение вещества. Свойства важнейших веществ. Лабораторная техника. II том - Основные свойства органических, неорганических и элементоорганических соединений. III том – Химическое равновесие и кинетика. Свойства растворов. Электродные процессы. Коррозия. 4 приложения. IV том – Аналитическая химия. Часть I и II (дополнительный 1 и 2). V том – Сырье и продукты промышленности неорганических и органических веществ. Часть 1. Сырье и продукт промышленности неорганических веществ. Часть 2 (дополнительный) Сырье и продукты промышленности органических веществ. VI том – Процессы и аппараты химических технологий. Часть 1 и 2 (дополнительный). VII том – Вредные химические вещества. Радиоактивные вещества. В настоящее время издано 12 томов Справочник издается в виде твердой копии и на компакт-диске АНО НПО «Профессионал» , изд. НПО «Мир и семья» , Санкт-Петербург. www. naukaspb. ru ИТХ Ур. О РАН МПХИ_2013 24
http: //fptl. ru/biblioteka/spravo 4 niki. html СПХФА. Факультет промышленной технологии лекарств. (неофициальный сайт) химическая библиотека, справочные таблица по химии, 25 МПХИ_2013 учебные материалы по химии, ТБ
Google djvu: поисковый термин pdf: поисковый термин portable – портативный переносной КНИГИ В ФОРМАТЕ DJVU или PDF djvu - déjà vu – видел раньше Pdf - portable document format http: //www. nehudlit. ru http: //sci-lib. com http: //chemexpress. fatal. ru http: //www. rushim. ru http: //www. rapidsharebooks. com http: //lib. homelinux. org http: //onlinefreebooks. blogspot. com http: //www. chemport. ru http: //lib. prometey. org http: //www. poiskknig. ru – в строке поиска можно задавать http: //moya-shkola. info фамилию автора книги, часть ее названия, как в русской, так и в (аналитическая химия) английской транскрипции. !!! Описание электронных библиотек, а также программ для их использования и создания – на сайте – http: //www. djvu-inf. narod. ru МПХИ_2013 26
Химия во всех проявлениях – химический портал Сhem. Port. ru www. chemport. ru библиотека site: www. chemport. ru МПХИ_2013 www. chemport. ru/? cid=44 27
РЕФЕРАТИВНЫЕ ЖУРНАЛЫ ПО ХИМИИ (вторичные источники информации) Chemical Abstracts (http: //www. cas. org) Chemical Abstracts Service 1907 Американское химическое общество (American Chemical Society) Сокращения CA, Chem. Abstr. Периодичность издания: до 1962 года журнал выходил 2 раза в месяц, в год 24 журнала, составляющих один том. С 1962 года – выходит 26 журналов в год, объединенных в два тома по 13 номеров в каждом. Каждый реферат имеет порядковый номер, на этот номер даются теперь ссылки в указателях. 57656 m Nucleophilic aromatic substitution in the pyrrole ring Doddi, Giancarlo; Mencarelli, Paolo; Stegel, Franco (Cent. Stud. Месс. Reazione, Univ. Rоmа, Rome, Italy). J. Chem. Soc. , Chem. Соmmun. 1975, (8), 273 4 (Eng). 2, 5 - Dinitro-1 -methylpyrrole (I) underwent nucleophilic arom. substitution with piperidine and Me. O- to give II and III resp. The ease of these reactions lies in the fact that I bears an N - Ме group rather than N - Н atom which avoids N - Н ionization with strong bases and consequent 28 МПХИ_2013 lowering of the ring reactivity.
Указатели к Chemical Abstracts (http: //www. chem. msu. su/rus/jlib/cas_index. html) Важнейшей составной частью СА является широко развитая система указателей. По числу страниц указатели занимают более половины объема издания. Поскольку указатели ради экономии места печатаются очень мелким шрифтом, их действительный объем превосходит объем текста самого СА: на каждые 1000 знаков текста приходится около 3500 знаков в указателях. Общие указатели: Keyword Index - указатель ключевых слов; Patent Index - указатель патентов; Author Index - авторский указатель Указатели к каждому тому: Subject Index - предметный указатель; Chemical Substance Index - указатель химических названий; Author Index - авторский указатель; Patent Index - указатель патентов, Formula Index - формульный указатель. Вспомогательные указатели помогают обеспечить поиск по разным признакам и максимально облегчить нахождение нужной информации тем читателям, которые не знакомы со всеми тонкостями терминологии и номенклатуры, применяемой в СА. Указатель циклических систем (Index of Ring System) Путеводитель к указателям (Index Guide) МПХИ_2013 29
http: //www. chem. msu. su/rus/jlib/cas_index. html#3 МПХИ_2013 30
http: //www. cas. org/ МПХИ_2013 31
CAS – СИСТЕМНЫЙ РЕГИСТРАТОР (CAS REGISTRY) CAS системный регистратор - всемирная база данных веществ. http: //www. cas. org/content/counter На 22. 01. 13 МПХИ_2013 32
Korean Intellectual Property office CAS Registry Number 1411769 -41 -9 N-[[5 -(2 -methylpropyl)-1 -phenyl-1 H-pyrazol-3 -yl]methyl]- 4 -[3 -(trifluoromethyl)benzoyl]1 -piperazineacetamide KIPO November 14, 2012. Эпилепсия, болезнь Паркинсона Деменция и др. заболевания МПХИ_2013 33
Формула Маркуша (Евгений Маркуш, 1923, США) (Markush claim) http: //www. chem. msu. su/rus/books/chempat/chel 12. html http: //rbis. su/article. php? article=130 Эти формулы сами по себе не соответствует никакому конкретному соединению, они просто являются удобным способом обозначения химических структур в обобщенном виде. На практике ей может соответствовать большое число конкретных соединений. Формула Маркуша включает один или несколько вариантов заместителей, объединяемых в группу альтернативных структур. Me. X Так 700, 000 структур Маркуша представляют 250, 000 отдельных соединений. Применяется в патентоведении. МПХИ_2013 34
Уникальный цифровой идентификатор - CAS Registry Number (CAS RN) Øон приписан только одному единственному веществу Øон не несет химической информации Øэто мостик к информации об данном конкретном химическом соединении CAS Registry Number содержит до десяти цифр, которые разбиты тире на три группы: Правая группа может содержать до 7 цифр вторая часть – две третья – одну. Последняя правая цифра – проверочная цифра, которая используется для проверки правильности и уникальности номера. Например, 58 -08 -2 это CAS Registry номер для кофеина 110 -91 -8 – морфолин запрос в Google
МПХИ_2013 36
Как можно найти этот номер (CAS number или Registry Number - RN)? Не имея под рукой каталогов Chemical Abstracts, можно воспользоваться услугами Google. Например, при выполнении запросов:
http: //lb. chemie. uni-hamburg. de МПХИ_2013 38
МПХИ_2013 А. Рагойша 39
МПХИ_2013 40 А. Рагойша
http: //www. commonchemistry. org/ запрос МПХИ_2013 41
МПХИ_2013 42
А. Рагойша МПХИ_2013 43
ID – identification number МПХИ_2013 44 А. Рагойша
МПХИ_2013 45 А. Рагойша
http: //www. cdc. gov/niosh/npgdrtec. html NIOSH Home NIOSH Pocket Guide to Chemical Hazards МПХИ_2013 46
МПХИ_2013 47
МПХИ_2013 48 А. Рагойша
МПХИ_2013 49
РЕФЕРАТИВНЫЙ ЖУРНАЛ ХИМИЯ (РЖ ХИМИЯ) Долгое время на русском языке не было единого реферативного справочника. 1874 - 1914 гг. отдельные рефераты помещались в специальном отделе при журнале Русского физико-химического общества. 1931 -1935 гг. выпускался «Химический реферативный журнал» , но реферирование было не полным. В 1938 году Академия наук СССР начала выпускать «Химический реферативный журнал» , но в нем реферировались только отечественные публикации. В 1941 году журнал прекратил свое существование. В 1950 году выпускался сборник «Химия и химическая технология» , где публиковались рефераты из иностранных журналов. С 1953 года началось регулярное реферирование по всем областям химии и стал издаваться реферативный журнал «Химия» (сокращенно РЖХим). Издатель – Всесоюзный институт научной и технической информации Академии наук СССР (ВИНИТИ). ВИНИТИ отражает около одного 1000000 документов ежегодно, среди которых более 30% поступает из российских источников. Все выпуски РЖ издаются ежемесячно, кроме выпусков по химии и химической технологии (периодичность 2 раза в месяц). Все выпуски РЖ имеют годовые и/или пономерные указатели: авторский, предметный, патентный, указатели источников и специализированные указатели (в некоторых выпусках). МПХИ_2013 50
Основные сокращения, применяемые в РЖ Д — диссертация, ДП - депонированная рукопись, К — книга, КР — рецензия на книгу, Р — рецензия А — Общие вопросы химии. Б — Физическая химия. В — Неорганическая химия. Комплексные соединения. Г — Аналитическая химия. Д — Оборудование лабораторий Е — Природные органические соединения и их синтетические аналоги Ж — Органическая химия И — Общие вопросы химической технологии Л — Технология неорганических веществ М — Силикатные материалы Н — Технология органических веществ О — Технология органических лекарственных веществ, ветеринарных препаратов и пестицидов. П — Химия и переработка древесины, горючих ископаемых и природных газов Р — Химия и технология пищевых продуктов, поверхностно-активных материалов и душистых веществ С — Химия высокомолекулярных соединений Т — Технология полимерных материалов. У — Технология полимерных материалов. (Бензин, лакокрасочные материалы и органические покрытия. Вспомогательные материалы для производства полимеров и изделий из них. ) Ф — Технология полимерных материалов (Природные ВМС. Химические МПХИ_2013 волокна, текстильные материалы. Бумага, Кожа. Мех). 51
Вид реферата в РЖХимия МПХИ_2013 52
http: //e-library. ru Пермский университет МПХИ_2013 Имя пользователя и 53 пароль
Каталог журналов МПХИ_2013 54
РЖ 19 Г Реферативный журнал «Аналитическая химия» РЖ 19 ГД Реферативный журнал «Аналитическая химия. Оборудование лабораторий» МПХИ_2013 55
МПХИ_2013 56
МПХИ_2013 57
Доступ к публикации год РЖ Химия 06. 24 -19 Г. 9 том Номер реферата Аналитическая химия МПХИ_2013 58
МПХИ_2013 59
МПХИ_2013 60
МПХИ_2013 61
МПХИ_2013 62
http: //elibrary. ru/author_profile. asp? id=40831 МПХИ_2013 63
РЖХимия в Интернете: Воронежский госуниверситет http: //www. lib. vsu. ru ) Электронные каталоги www. lib. vsu. ru электронные каталоги реферативные журналы химия МПХИ_2013 64
Год, том, номер МПХИ_2013 65
МПХИ_2013 66
МПХИ_2013 67
МПХИ_2013 68
Детальная информация МПХИ_2013 69
РЖХимия в Интернете: http: //www. samsu. ru/ (Самарский государственный университет) МПХИ_2013 70
http: //weblib. samsu. полнотекстовые БД реферативный журнал ВИНИТИ «ОТКРЫТЬ» МПХИ_2013 71
http: //weblib. samsu. ru/Local. Src/RJ/Section. RJ. php МПХИ_2013 72
МПХИ_2013 73
07. 24 -19 Ж. 433 Бабенышева А. В. , Лисовская Н. А. , Масливец А. Н. МПХИ_2013 74
Принцип телефонного Справочника!!! МПХИ_2013 75
1) Ctrl + F 2) Бабенышева МПХИ_2013 76
http: //weblib. samsu. ru/Local. Src/RJ/Section. RJ. php МПХИ_2013 77
МПХИ_2013 78
http: //weblib. ssu. samara. ru/Dlib/RJ/Catalog. RJ. php МПХИ_2013 79
МПХИ_2013 80
МПХИ_2013 81
МПХИ_2013 82
МПХИ_2013 83
МПХИ_2013 84