Скачать презентацию ПАРАРЕТРОВИРУСЫ класс VII Вирус гепатита В Hepadnaviridae Вирус Скачать презентацию ПАРАРЕТРОВИРУСЫ класс VII Вирус гепатита В Hepadnaviridae Вирус

Lect6_hepB_+RNA.ppt

  • Количество слайдов: 74

ПАРАРЕТРОВИРУСЫ (класс VII) Вирус гепатита В (Hepadnaviridae) Вирус мозаики цветной капусты (Сaulimoviridae) ПАРАРЕТРОВИРУСЫ (класс VII) Вирус гепатита В (Hepadnaviridae) Вирус мозаики цветной капусты (Сaulimoviridae)

Электронная микрофотография и схема структуры гепаднавирусов Электронная микрофотография и схема структуры гепаднавирусов

Репликативный цикл HBV Репликативный цикл HBV

Организация генома гепаднавирусов 0/3221 2854 2456 2304 833 1838 1814 1621 ORF X 1374 Организация генома гепаднавирусов 0/3221 2854 2456 2304 833 1838 1814 1621 ORF X 1374

Образование ccc. DNA Образование ccc. DNA

Регуляторные элементы генома HBV (1, 2 генома) U 5 -like TATAA GRE Регуляторные элементы генома HBV (1, 2 генома) U 5 -like TATAA GRE

Линейная карта продуктов гена Р HBV и DHBV 90 k. D Линейная карта продуктов гена Р HBV и DHBV 90 k. D

Образование 3 -х форм оболочечного белка HBV Образование 3 -х форм оболочечного белка HBV

Модель трехмерной структуры HBs. Ag 1 – 4 трансмембранные домены Модель трехмерной структуры HBs. Ag 1 – 4 трансмембранные домены

Клеточные факторы и процессы, на которые влияет HBx Клеточные факторы и процессы, на которые влияет HBx

Возможная роль HBx в репликации генома HBV Возможная роль HBx в репликации генома HBV

Схема прегеномной РНК гепаднавирусов Схема прегеномной РНК гепаднавирусов

Структура ε-участков HBV и DНBV Структура ε-участков HBV и DНBV

Центральная роль Р-ε взаимодействия при инициации транскрипции Φ ω Центральная роль Р-ε взаимодействия при инициации транскрипции Φ ω

Основные этапы обратной транскрипции гепаднавирусов (1 – 4) Основные этапы обратной транскрипции гепаднавирусов (1 – 4)

Возможная схема переключения матрицы Возможная схема переключения матрицы

Основные этапы обратной транскрипции гепаднавирусов (5 – 6) Основные этапы обратной транскрипции гепаднавирусов (5 – 6)

Синтез +цепи ДНК вируса гепатита В Синтез +цепи ДНК вируса гепатита В

Cхема генома каулимовирусов Cхема генома каулимовирусов

Репликационный цикл каулимовирусов Репликационный цикл каулимовирусов

Особенности стратегии РНК-содержащих вирусов Особенности стратегии РНК-содержащих вирусов

РНК-зависимая репликация РНК РНК-зависимая репликация РНК

РНК-зависимая РНК-полимераза A. Инициация de novo (праймернезависимая) B. 1. 3’-терминальная инициация C. 2. Внутренняя РНК-зависимая РНК-полимераза A. Инициация de novo (праймернезависимая) B. 1. 3’-терминальная инициация C. 2. Внутренняя инициация D. B. Праймер-зависимая инициация 3. Олигонуклеотидный, белковый, кэп-праймеры 4. Самопраймирование (back-priming)

Трехмерная структура Rd. Rp HCV Трехмерная структура Rd. Rp HCV

Распределение электростатического потенциала по поверхности молекулы Rd. Rp HCV Положительный и отрицательный заряд показаны Распределение электростатического потенциала по поверхности молекулы Rd. Rp HCV Положительный и отрицательный заряд показаны синим и красным цветом, соответственно

Распределение консервативных аминокислотных остатков по поверхности молекулы Rd. Rp шести серотипов HCV RT HIV Распределение консервативных аминокислотных остатков по поверхности молекулы Rd. Rp шести серотипов HCV RT HIV Наиболее консервативные участки показаны темно-оранжевым, наименее – белым цветом

Структура тоннеля, связывающего матрицу, с РНКолигомером Структура тоннеля, связывающего матрицу, с РНКолигомером

Структура Rd. Rp полиовируса (ленточная диаграмма) Структура Rd. Rp полиовируса (ленточная диаграмма)

Вирусные RDRP Риновирус HRV 16 Вирус гепатита С HCV Калицивирус RHDV Флавивирус BVDV Вирусные RDRP Риновирус HRV 16 Вирус гепатита С HCV Калицивирус RHDV Флавивирус BVDV

Возможные вторичные структуры вирусных РНК Возможные вторичные структуры вирусных РНК

Схема образования и третичная структура псевдоузла (pseudoknot) Схема образования и третичная структура псевдоузла (pseudoknot)

ВИРУСЫ, СОДЕРЖАЩИЕ +РНК (класс IV) ВИРУСЫ, СОДЕРЖАЩИЕ +РНК (класс IV)

Структура капсида MS 2 Структура капсида MS 2

Схема генома бактериофага МS 2 Схема генома бактериофага МS 2

Схема генома бактериофага Qbeta (4700 n) 1. Coat (12 K), 180 копий на вирион Схема генома бактериофага Qbeta (4700 n) 1. Coat (12 K), 180 копий на вирион 2. "Maturation" или tail protein (40 K) -1 копия на вирион 3. RNA replicase (63 K) – 1 вирусная субединица объединяется с 3 -мя хозяйскими 4. Lysis protein (8 K) – рамка считывания перекрывается с coat protein gene in R 17. 5. "Readthrough" protein – только в Qβ , образуется за счет проскакивания терминального кодона coat protein (UGA);

Вторичная структура репликазного домена фага Qbeta Вторичная структура репликазного домена фага Qbeta

Вторичная структура 3’-концевого домена фага Qbeta Вторичная структура 3’-концевого домена фага Qbeta

Синтез белков бактериофага MS 2 в течение инфекции Синтез белков бактериофага MS 2 в течение инфекции

Контроль трансляции с помощью фолдинга РНК MS 2 Контроль трансляции с помощью фолдинга РНК MS 2

Регуляция на уровне трансляции фага Qbeta Регуляция на уровне трансляции фага Qbeta

Flavivirus + - + +- + - - Flavivirus + - + +- + - -

Экспрессия геномов вирусов с (+)РНК Экспрессия геномов вирусов с (+)РНК

Структура полиовируса Структура полиовируса

Схема генома полиовируса (7440 п. н. ) Схема генома полиовируса (7440 п. н. )

Протеолиз полипротеина Протеолиз полипротеина

Схема РНК полиовируса, присоединенной к VPg Схема РНК полиовируса, присоединенной к VPg

3 AB – мембраносвязанный белокпредшественник VPg 3 AB – мембраносвязанный белокпредшественник VPg

Инициация синтеза РНК полиовируса Инициация синтеза РНК полиовируса

Flaviviruses • Оболочечные; очень плотный капсид из 180 с/ед. , образующих димеры; связаны с Flaviviruses • Оболочечные; очень плотный капсид из 180 с/ед. , образующих димеры; связаны с внутренним капсидным белком • Геном: +РНК, на 5’ –конце имеется кэп; поли-А хвоста нет • Вирусные белки транслируются в виде полипротеина, который потом протеолитически расщепляется

Схема генома вируса гепатита С (HCV) Схема генома вируса гепатита С (HCV)

Экспрессия геномов вирусов с (+)РНК Экспрессия геномов вирусов с (+)РНК

Схемы генома и вириона вируса Синдбис (Альфавирусы) Схемы генома и вириона вируса Синдбис (Альфавирусы)

Репликация и трансляция РНК вируса Синдбис Репликация и трансляция РНК вируса Синдбис

Экспрессия генома нидовирусов (артери и корона) Схема вириона Equine arteritis virus (EAV) Экспрессия генома нидовирусов (артери и корона) Схема вириона Equine arteritis virus (EAV)

Схематическая диаграмма организации генома и экспрессии артеривирусов Сдвиг ORF Схематическая диаграмма организации генома и экспрессии артеривирусов Сдвиг ORF

Cхема протеазного расщепления продукта трансляции 5’субгеномного фрагмента EAV 3 -мерная структура NSP 4 Cхема протеазного расщепления продукта трансляции 5’субгеномного фрагмента EAV 3 -мерная структура NSP 4

Образование субгеномных 3’-м. РНК Образование субгеномных 3’-м. РНК

Структура лидерной последовательности TRS артеривируса. Модель синтеза «гнездовых» м. РНК m. RNA Структура лидерной последовательности TRS артеривируса. Модель синтеза «гнездовых» м. РНК m. RNA

Синтез полноразмерной геномной РНК (репликация) Синтез полноразмерной геномной РНК (репликация)

Схема генома вируса саркомы Рауса μψ Схема генома вируса саркомы Рауса μψ

Схема генома ретровирусов и связывание праймера pbs Схема генома ретровирусов и связывание праймера pbs

Cтруктура обратной транскриптазы HIV-1 Cтруктура обратной транскриптазы HIV-1

Модель связывания ДНК-РНК гибрида с RT HIV-1 Модель связывания ДНК-РНК гибрида с RT HIV-1

Этапы обратной транскрипции (1 – 5) Этапы обратной транскрипции (1 – 5)

Этапы обратной транскрипции (6 – 9) LTR Этапы обратной транскрипции (6 – 9) LTR

Основные этапы интеграции ДНК ретровирусов Основные этапы интеграции ДНК ретровирусов

Нуклеотидные последовательности концов ретровирусной ДНК Линейная схема интегразы HIV-1 Нуклеотидные последовательности концов ретровирусной ДНК Линейная схема интегразы HIV-1