Памяти Александра Семёновича Саенко посвящается Принципиальная схема

Памяти Александра Семёновича Саенко посвящается

Принципиальная схема Уотсона-Крика

Джон Кэйрнс

Белки, участвующие в репликации ДНК, и функциональные связи между ними

Схема репликации ДНК

Схема репликации ДНК

B I Sinzinis, G B Smirnov, A S Saenko Repair deficiency in Escherichia coli UV-sensitive mutator strain uvr 502. Biochemical and Biophysical Research Communications 08/1973; 53(1): 309 -16. Synzynys BI, Il'ina TP, Smirnov G. B. , Saenko AS Degradation, synthesis and reparation of the DNA in cells of E. coli UVR 502 following UV irradiation. Radiobiologiia 1974 Jan-Feb; 14(1): 13 -20

Saenko AS, Synzynys BI, Smirnov GB Study of the ability of a DNA polymerase mutant E. coli K 12 pol A 1 for elimination of single-stranded breaks in DNA caused by methyl methanesulfonate. Mol Biol 1972 Sep. Oct; 6(5): 526 -32

Smirnov GB, Filkova EV, Skavronskaya AG, Saenko AS, Sinzinis BI. Loss and restoration of viability of E. coli due to combinations of mutations affecting DNA polymerase I and repair activities. Mol Genet. 1973 Mar 1; 121(2): 139 -50.

Доменная с труктура ДНК-полимеразы I E. coli. A – взаимное расположение доменов. I – 5’-нуклеазный домен, II – (3’ 5’)-экзонуклеазный домен, III – ДНК-полимеразный домен. Стрелка соответствует кленовскому фрагменту ДНК-полимеразы I. B – мотивы полимеразного домена, консервативные среди бактериальных ДНК-полимераз I. Эти мотивы имеют следующие консенсусные последовательности: 699 hhhh. Dhhx. Ehx 712 (A), 754 Rpxx. Kxxxh. Ghh. Y 766 (B) и 876 hhxh. HDЕhxx. Е 888 (С) - , где h – гидрофобный остаток, х – произвольный остаток, р – преимущественно R (нумерация остатков ДНК-полимеразы I E. coli)

1. Определить сравнительную чувствительность мутанта и дикого типа к новобиоцину. 2. Определить возможность и частоту мутаций устойчивости к новобиоцину у бактерий мутанта и дикого типа. 3. Сравнить локализацию мутаций к новобиоцинустойчивости в бактериях мутанта и дикого типа.

E. сoli K 12 AB 1157 дикий тип

E. сoli K 12 AB 2463 rec. A 13 (мутант АВ 1157)

Дикий тип Крупн. Мелк. rec. A Кривые УФ-инактивации Nov. R мутантов rec. A мутанта АВ 2463

1. Какое отношение имеет АТФ-аза, обслуживающая субъединицу А ДНКгиразы, к жизнеспособности мутанта rec. A? и 2. Как может мутация к Nov. R повлиять на репарацию, точнее на её отсутствие в мутанте rec. A?

AB 1157 дикий тип, диск - налидиксовая кислота 100 мкг/мл

АВ 2463 rec. A 13, диск - налидиксовая кислота 100 мкг/мл

АВ 2463 Nov. R , диск - налидиксовая кислота 100 мкг/мл

Налидиксовая кислота

Белок Rec. A

Rec. A – The Evolution Gene Об эволюции: «It is a process that happens because various proteins interact with the DNA to recombine it. And in this regard, Rec. A is the star. » Mike Gene

Оценивая частоты использования механизма гомологичной рекомбинации клеткой для реактивации остановившихся репликационных вилок, Сох установил, что именно эта функция рекомбинации является основной. Почти каждая репликационная вилка бактериальной клетки, растущей в обычных аэробных условиях, останавливается из-за столкновения с повреждением ДНК. Причем это происходит не только в условиях стресса, например, при облучении ультрафиолетом, а в нормальных условиях аэробного роста, когда SOS-функции клетки не индуцируются. Вот почему белок Rec. A является столь важным для клетки.

Into the life and death: Rec. A a WISE factor working to integrate survival and evolution in Escherichia coli

Спасибо за внимание