Инбридинг.ppt
- Количество слайдов: 12
Отклонение от случайного скрещивания Инбридинг
Ассортативное скрещивание – при образовании брачных пар предпочтение оказывается особям сходного фенотипа (генотипа) противоположного фенотипа (генотипа) положительное отрицательное В популяции увеличивается доля особей с родительским генотипом В генотипе потомства представлены новые сочетания аллелей
Инбридинг – образование брачных пар на основе родства Ведет к повышению частоты гомозигот в популяции Рост числа больных рецессивными наследственными болезнями Способствует большей концентрации определенных генов. Лучшая адаптация популяции к конкретной среде
Кровное родство родителей рецессивных гомозигот (по W. T. Bodmer, L. L. Cavalli-Sforza, 1976) Высота столбиков означает частоту браков между двоюродными братьями и сестрами среди европейского населения в целом и среди родителей, дети которых страдают указанными заболеваниями
Частота родственных браков в трех европейских популяциях
Коэффициент инбридинга F (индивидуума) – это вероятность того, что два аллеля в данном локусе идентичны по происхождению Результаты самоопыления в популяции, исходно состоящей из одних гетерозигот Аа
Вычисление коэффициента инбридинга Пусть А и В – не состоящие в родстве родители, из гамет которых образуются зиготы С и D. Зигота Е возникает при слиянии гамет от С и D (от сибсов). А – а 1 а 2 В – а 3 а 4 P: g: ½ a 1 ½ a 2 Ах. В ½ a 3 ½ a 4 F 1: ¼ (а 1 а 3), ¼ (а 1 а 4), ¼ (а 2 а 3), ¼ (а 2 а 4) Q (a 1 a 1) - ? Вероятность того, что Е получит аллель а 1 от А через С = ½ х ½ = ¼ Вероятность того, что Е получит этот аллель от А через D = ½ х ½ = ¼ Вероятность того, что Е получит этот аллель от обоих родителей = ¼ х ¼ =1/16 F = 1/16 x 4 = 1/4
Метод коэффициента путей (анализа путей) основан на подсчете числа стрелок в родословной, образующих замкнутые циклы, включающие анализируемую особь и всех предков, общих для обоих родителей. А, В – предки, общие для родителей К. Два пути: K–J–G–C–A–D–H–K и K–J–G–C–B–D–H–K 7 этапов в каждом F = k · (1/2)n Родословная потомства от брака между двоюродными дядей (теткой) и племянницей (племянником) n – число этапов минус 1, k – число путей. F = 2 · (1/2) 6 = 1/32
Увеличение коэффициента инбридинга в ряду поколений при различных типах родственных скрещиваний
Уровень инбридинга в популяции Средняя степень кровного родства (К) учитывает все типы имеющихся в ней кровнородственных браков: K = Σ Fi Mi Fi – коэффициент инбридинга Мi – относительная частота i-го типа кровнородственного брака.
Уровень инбридинга в популяции Изонимный метод (Crow, 1980) Тотальная величина инбридинга (коэффициент инбридинга особи относительно целой популяции): Fit = I /4 N I – число изонимных браков, N – общее число проанализированных браков. Случайная составляющая инбридинга (коэффициент инбридинга субпопуляции относительно всей популяции): Fst = (Σ piqi) / 4 Неслучайная составляющая инбридинга (коэффициент инбридинга особи относительно его субпопуляции): F is = (Fit – Fst) / (1 – Fst) p, q – частоты встречаемости изонимных фамилий у супругов
Закон Харди-Вайнберга для инбредной популяции Рассмотрим популяцию с инбридингом как состоящую из двух частей, одна из которых полностью инбредна, другая – полностью панмиксна. При панмиксии вероятность объединения двух гамет А (AA) – р2. При инбридинге вероятность объединения двух гамет А – р2 + е , двух гамет а – q 2 + e, а вероятность объединения А с а – 2 pq – e При генетическом равновесии F = коэффициенту корреляции между объединяющимися гаметами F = e / pq, e = Fpq АА p 2 + pq. F Аа 2 pq – 2 pq. F аа q 2 + pq. F
Инбридинг.ppt