Основные семейства бактериофагов Семейство Myoviridae Bacteria Archaea Siphoviridae

Основные семейства бактериофагов Семейство Myoviridae Bacteria Archaea Siphoviridae Bacteria Archaea Podoviridae Firmicutes, Proteobacteria Tectiviridae Строение Геном Представители Изометрическая головка; сократимый, длинный хвостовой отросток Линейная, дн ДНК 39 169 тыс. п. н. Ox 2, T 4, P 1, P 2 P 4, M 1, µ Изометрическая головка; жесткий, длинный хвостовой отросток Линейная, дн ДНК 22 121 тыс. п. н. Линейная, дн ДНК 19 44 тыс. п. н. Линейная, дн ДНК 15 тыс. п. н. T 5, λ Икосаэдрический капсид Циклическая, он ДНК 4 - 6 тыс. п. н. φX 174 Нитевидный капсид Циклическая, он ДНК 5 - 9 тыс. п. н. M 13 Икосаэдрический капсид Линейная, он РНК (+) 5 - 9 тыс. п. н. MS 2 Оболочечный Сегментированная, дн РНК 13 тыс. п. н. Φ 6 Изометрическая головка; жесткий, короткий хвостовой отросток Двуслойный изометрический капсид энтеробактерии Microviridae Энтеробактерии, хламидии, микоплазмы Inoviridae Энтеробактерии, микоплазмы Leviviridae Энтеробактерии Cystoviridae Pseudomonas T 7, P 22, φ29 PRD 1

Проникновение PRD 1 T 4

Ранние этапы мультипликации Подавление активности рестриктаз белками фагов (T 7, T 3, P 1) Потеря сайтов узнавания (SPO 1, phi 29) Метилирование Т 2, Т 4 –собственной метилазой Dam Lambda – Ral белок активирует рестриктазы – метилазы хозяина Eco. K и Eco. B Замена нуклеотидов

А 5 -гидроксиметилурацил; Б гликозилированный и фосфоглюкуронилированный 5 гидроксиметилурацил; В гликозилированный 5 -гидроксиметилцитозин; Г 7 -метилгуанин; Д 6 -ацетамидаденин.

Microviridae Икосаэдрический Энтеробактерии капсид хламидии, микоплазмы Цикличе φX 174 ская, он ДНК

1 геномная ss. ДНК фага, одетая хозяйскими стабилизирующими белками SSB; 2 3 образование шпильки, возле которой собирается праймасома, начинается переход к dsинтермедиату; ds-интермедиат; 4 5 Репликативные интермедиаты φX 174 переход к репликации по механизму «катящегося кольца» ; образование геномных копий.

Воспроизведение двунитевой ДНК Репликация «вращающееся колесо» Воспроизведение однонитевой ДНК

Inoviridae Палочковидный Пили общего или нитевидный назначения капсид Циклическая, он ДНК М 13 Вириона и геном бактериофага Enterobacteria phage М 13. 3, 6, 7, 8 и 9 гены структурных белков; 1, 2, 4 и 5 гены белков, участвующих в репликации; ori сайт начала репликации; g 3 p, g 6 p g 7 p, g 8 p, g 9 p структурные белки.

g 8 p, g 7 p, g 9 p g 2 p ДНК-g 5 p g 2 p g 7 p, g 9 p g 4 p g 1 p

Репликация бактериофагов с дн ДНК

Siphoviridae Proteobacteria Изометрическая головка; Линейная T 5, λ жесткий, длинный дн ДНК хвостовой отросток

Podoviridae Изометрическая Firmicutes, головка; жесткий, энтеробактерии короткий хвостовой отросток Линейная, T 7, P 22, дн ДНК φ29

Геном Т 7 Model of the bacteriophage T 7 replication fork Johnson D. E. et. al. PNAS 2007; 104: 5312 -5317

Myoviridae Cyanobacteria, Proteobacteria, Firmicutes Изометрическая головка; Линейная, Ox 2, T 4, сократимый, длинный дн ДНК P 1, P 2 -P 4, хвостовой отросток M 1, µ

169000 по

Рекомбинационно-зависимая репликация Т 4

Enterobacteria phage Mu

Серовар Typhi CT 18 O 157: H 7 Sakai O 157: H 7 EDL 933 Серовар Typhimurium LT 2 K-12 CFT 073 M 3 8325 M 18 MW 2 N 315 M 1 Mu 50 S. pyogenes M 1, M 18, M 3; S. aureus Mu 50, N 315, MW 2, 8325; E. coli O 157: H 7 Sakai, O 157: H 7 EDL 933, K-12 – лабораторный штамм, CFT 073 – уропатогенный; S. enterica сер. Typhimurium LT 2, сер. Typhi CT 18.

Бактерии Заболевание Фаг Фактор вирулентности Фенотипические проявления Escherichia coli STECштаммы Острая пищевая инфекция H-19 B Шига-токсин Геморрадическая диарея Pseudomonas aeruginosa Гнойные воспаления Р 2 -подобный Бактериоцины Успешная конкуренция патогена с нормальной микрофлорой Гнойные воспаления CTXφподобный Порообразующий цитотоксин Некроз тканей Salmonella enterica серовар Typhi Брюшной тиф CT 18 -02 Энтерогемолизин Интоксикация, гемолитический уремический синдром Shigella flexneri Дизентирия λ-подобные Шига-токсин Геморрадическая диарея Vibrio cholerae Холера CTXφ Холерный токсин Обезвоживание организма, диаррея VPIφ Белок пилей адсорбции Колонизация тонкого кишечника патогеном Corynebacterium diphtheriae Дифтерия Фаг Дифтерийный токсин Блокировка трансляции клеток, отек горла, поражения сердца и почек Clostridium botulinum Ботулизм Фаг C 1 Нейротоксин Блокировка синапсической передачи, которая приводит к параличу дыхания Staphylococcus aureus Острая кишечная инфекция φPVL Лейкоцидин Некроз тканей, лейкоцитоз, воспаление, токсический шок

Siphoviridae Proteobacteria Изометрическая головка; Линейная T 5, λ жесткий, длинный дн ДНК хвостовой отросток

Интеграция (integration) Эксцизия (excision)

Enterobacteria phage P 22 Паковка по механизму head-full

Leviviridae Носители плазмиды конъюгации Икосаэдрический капсид Линейная, MS 2 он РНК (+) белок лизиса Белок А; белок капсида; репликаза;

Репликативные интермедиаты MS 2 Цикл размножения фага MS 2 1 адсорбция на пили; 2 проникновение; 3 трансляция; 4 репликация; 5 сборка вириона; 6 выход из клетки.