ОСНОВНЫЕ КЛАССЫ МЕМБРАННЫХ ЛИПИДОВ МЕМБРАННЫЕ БЕЛКИ Периферические

ОСНОВНЫЕ КЛАССЫ МЕМБРАННЫХ ЛИПИДОВ

МЕМБРАННЫЕ БЕЛКИ Периферические Интегральные

Аминокислотная последовательность гликофорина (интегральный белок мембраны эритроцита)

ТИПЫ ИНТЕГРАЛЬНЫХ БЕЛКОВ Снаружи Внутри

СУПЕРВТОРИЧНЫЕ СТРУКТУРЫ ИНТЕГРАЛЬНЫХ БЕЛКОВ

Нарушения α-спиральной конформации в мембранных белках π-спираль в Gцепи бактериородоп сина Расплетание цепи АТФазы саркоплазмати ческого ретикуллума Пролиновый кинк в С-цепи бактериородоп сина

АМИНОКИСЛОТНЫЙ СОСТАВ ТРАНСМЕМБРАННЫХ СПИРАЛЕЙ БАКТЕРИОРОДОПСИНА Полярные а. к. о. составляют менее 5% в ТМ доменах (до 22% - в водорастворимых) водородные связи

J. A. Killian and G. von Heijne

СПЕЦИФИЧЕСКОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ТЕТРАМЕРА АКВАПОРИНА-0 С ЛИПИДАМИ 1, 2 -dimyristoyl-rac-glycero-3 Phosphocholine (DAG)

Специфическое взаимодествие субъединицы III цитохромоксидазы С с липидами

ЛИПИДЫ, КОВАЛЕНТНО СВЯЗАННЫЕ С БЕЛКАМИ Гликозилфосфатидилинозитол-связанные белки (GPI-linked proteins) – Встречаются у всех Eukaryotа, но особенно в больших количествах представлены у паразитических одноклеточных; – Локализованы на внешней стороне цитоплазматической мембраны

Примеры GPI-связанных белков Гликопротеин вируса везикулярного стоматита ацетилхолинэстераза тиреоглобулин Гликолипид А

Ацилированные белки Экстраклеточная сторона С-концевой cys С-концевой gly N-миристинилирование (С 14) S-пальмитинилирование (C 16) Цитоплазматическая сторона

Пренилированные белки фарнезилирование Геранилгеранилирование

ЛИПИДНЫЕ МИКРОДОМЕНЫ “LIPIDS RAFTS” Динамические области плазматической мембраны, обогащенные холестеролом, сфинголипидами, GPI-заякоренными белками (от 50 до 200 нм) - Сигналлинг ( «сигналосомы» ) - Проникновение и выпочковывание вирусов; связывание токсинов

Схема организации липидного микродомена

Визуализация микродоменов Меченный флуоресцином GPIзаякоренный белок (Thy 1) в монослое мембраны почечного эпителия

Модель плазматической мембраны

СТРУКТУРА НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ • Азотистые основания, • нуклеозиды, • нуклеотиды

Азотистые основания пурины NH 2 N Аденин N A N N 6 7 5 9 4 8 N 3 N H 1 N O 2 N N Гуанин NH G N H N NH 2

Азотистые основания пиримидины Тимин O H 3 C NH N 4 3 5 2 N O H 6 1 T NH 2 N N Цитозин C N H O

Азотистые основания урацил O 4 3 5 2 N NH 6 1 N N H U O

Кето-енольная таутомерия азотистых оснований Кето-таутомер Енол-таутомер

Рибоза – углеводный компонент нуклеотидов Линейная форма β-фураноза

Углеводные компоненты нуклеотидов HOCH 2 OH O Рибоза 5’ HOCH 2 O OH 4’ OH 1’ 3’ 2’ HOCH 2 OH O Дезоксирибоза OH H

Стабильные конформации углеводов

Нуклеозиды β-N 1 -гликозидная связь в пиримидиновых нуклеотидах β-N 9 -гликозидная связь в пуриновых нуклеотидах

Минорные нуклеозиды в ДНК 5 -метилцитидин N 2 -метилгуанозин N 6 -метиладенозин 5 -гидроксиметилцитидин

Пирофосфат

Фосфатная группа O O P O X O O O P O O O P O O CH 2

Нуклеозид Нуклеотид (монофосфат)

Дезоксинуклеотидмонофосфат г 4 3 2 O O P O O 1 N 5’ C O 4’ 1’ 3’ OH 2’ 5 N 6

основание нуклеозид нуклеотид НК Аденин Аденозин (А) Адениловая кислота (АMP) ДНК, РНК Гуанин Гуанозин (G) Цитидин (С) Гуаниловая кислота (GMP) ДНК, РНК Цитидиловая кислота (CMP) ДНК, РНК Цитозин Тимин Урацил Дезокситимидин Дезокситимидиловая кислота (Т) (TMP) Уридин Уридиловая кислота (U) (UMP) ДНК РНК

Нуклеозид: дезоксиаденозин Нуклеотид: дезоксиаденилат (дезоксиаденозин-5’-монофосфат) Обозначения: A, d. AMP дезоксигуанозин дезоксигуанилат (дезоксигуанозин-5’-монофосфат) G, d. GMP

Нуклеозид: дезокситимидин Нуклеотид: дезокситимидилат (дезокситимидин-5’-монофосфат) Обозначения: T, d. TMP дезоксицитидин дезоксицитидилат (дезоксиуридин-5’-монофосфат) C, d. CMP

Нуклеозид: Нуклеотид: аденозин аденилат (аденозин-5’-монофосфат) Обозначения: A, AMP гуанозин гуанилат (гуанозин-5’-монофосфат) G, GMP

Нуклеозид: уридин Нуклеотид: уридилат (уридин-5’-монофосфат) Обозначения: U, UMP цитидин цитидилат (цитидин-5’-монофосфат) C, CMP

аденозин-5’-монофосфат аденозин-3’-монофосфат аденозин-2’-монофосфат циклический аденозин-2’-3’монофосфат

Структура аденозиндифосфорной кислоты

Структура аденозинтрифосфорной кислоты

Возможные конформации азотистых оснований в нуклеозидах

Рибофлавин, В 2 Аденозинмонофосфат (AMP) Флавинмононуклеотид FMN Флавинадениндинуклеотид FAD

Кофермент никотинамидадениндинуклеотид (НАД, NADH) Н Аденозинмонофосфат (AMP)

Кофермент А Аденозинмонофосфат (AMP) Ацетил-Ко. А