Oddelenie biofyziky Smery výskumu : Stabilita a funkcie biomakromolekúl -Konformačné prechody biomakromolekúl -Vplyv biologicky aktívnych látok na amyloidné štruktúry -Vývoj supramolekulárnych komplexov nanočastíc s biomolekulami Elektrostatické interakcie polyelektrolytov Obrazová analýza biologických objektov Molekulárne modelovanie 1
Projekty riešené na OBF VEGA: (5) Molekulárne mechanizmy konformačnej stability proteínov (M. Antalík) Agregácia proteínov a identifikácia inhibítorov agregácie (Z. Gažová) Molekulárne modelovanie interakcií dendrimérov s liečivami za účelom využitia týchto komplexov ako presných nanočastíc pre „drugdelivery“ systémy (T. Kožár) Interaktívne algoritmy segmentácie na báze aktívnych kontúr a ich uplatnenie pri meraní fyzikálnych vlastností biomedicínskych objektov (Z. Tomori) APVV: (3) 1 -Methoxyindolové fytoalexíny a ich analógy ako nový typ zlúčenín s protinádorovou aktivitou (T. Kožár) Vytvorenie virtuálneho laboratória na účinnú analýzu ligandov a ligand-receptor interakcií (T. Kožár) 2
Publikácie: CC: Výjdené: ANDRE, S. - KOŽÁR, T. - SCHUBERTH, R. - UNVERZAGT, C. - KOJIMA, S. - GABIUS, H. J. Substitutions in the N- Glycan Core as Regulators of Biorecognition: The Case of Core-Fucose and Bisecting Glc. NAc Moieties. Biochemistry. Vol. 46, no. 23 (2007), 6984 -6995. (IF 3. 63) TOMÁŠKOVÁ, N. - VARHAČ, R. – ŽOLDÁK, G. – OLEKŠÁKOVÁ, L. – SEDLÁKOVÁ, D. – SEDLÁK, E. Conformational stability and dynamics of cytochrome c affect its alkaline isomerization. J. Biol Inorg. Chem. 12, (2007), 257 -266. (3. 224 - IF) HEFFERAN, M. P. – KUCHAROVA, K. – KINJO, K. – KAKINOHANA, O. – SEKERKOVA, G. – NAKAMURA, S. – FUCHIGAMI, T. – TOMORI, Z. – YAKSH, T. L. – KURTZ, N. – MARSALA, M. Spinal Astrocyte Glutamate Receptor 1 Overexpression after Ischemic Insult Facilitates Behavioral Signs of Spasticity and Rigidity. J. Neurosci. 17, no. 27 (2007), 11179 -11191. (IF - 7. 45) KOŇÁK, Č. - SEDLÁK, M. p. H-Sensitive Micelles Formed by Interchain Hydrogen Bonding of Poly(methacrylic acid)-block. Poly(ethylene oxide) Copolymers. Macromolecular Chemistry and Physics. 208, (2007), 1893 -1899. (IF 2. 02) M. Pickhardt, Biernat J. , Khlistunova I. Wang Y. P. , Gazova Z. , Mandelkow E. M. , Mandelkow E. N-Phenylamine Derivatives as Aggregation Inhibitors in Cell Models of Tauopathy. Current Alzheimer Research, 4 (2007), 397 -402 – nie je uvedený ústav Zaslané: S. Poniková, M. Antalík, T. Hianik A CD spectroscopy study of the formation of guanine quadruplexes by DNA aptamers that selectively bind thrombin at different exosites. Effect of potassium and sodium ions. Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters J. Bágeľová, D. Fedunová, Z. Gažová, M. Antalík, Different effect of sorbitol and Na. Cl on native and acid unfolded cytochrome c” Biophysical Chemistry R. Varhač, M. Antalík Binding of cyanide to ferricytochrome c in acidic p. H region J. Biol. Inorg. Chemistry Z. Gazova, A. Bellova, J. Imrich, P. Kristian, Z. Daxnerova, J. Bagelova, D. Fedunova and M. Antalik Acridine derivatives inhibit lysozyme aggregation Europ. Biophys. J. 3
Pozvané prednášky: Z. Gažová – Amyloid structures, ISMN CNR Bologna, Taliansko – 13 -16 Február 2007 Z. Gažová – Amyloid structures, BIODOT Meeting, Budapest, Maďarsko, 7. -8. máj 2007 KOŽÁR, T. Clusters, Grids & Molecules: Virual Screening. In Grid for Pharmaceutical & Biomedical Challenges. EGEE Industry Day Bratislava, Slovakia, 19 September 2007 KOŽÁR, T. High-throughput computing in molecular modeling and design. In 3 rd International Workshop on Grid Computing for Complex Problems, Bratislava, Slovakia, October 22 -23, 2007 Konferenčné príspevky: 15 4
Organizácia konferencií: Medzinárodná konferencia 5. ročník - Štruktúra a stabilita biomakromolekúl (5 -8. 9. 2007 Košice) plus satelitná konferencia Moderné trendy vo výskume biomakromolekúl Pedagogika: PF UPJŠ v Košiciach M. Antalík (prednášky Biochémia I , Biofyzikálna chémia I a II ) Z. Gažová (prednášky Enzymológia ) FEI TU Z. Tomori (prednáška Počítačové videnie) Diplomové práce: 6 - (Z. Gažová, D. Fedunová, E. Valušová) 5
Supramolekulárne štruktúry- Nanočastice biomakromolekuly Cieľ: Vytvoriť metodický základ na syntézu a charakterizovanie nanočatíc tri základné typy nanočastíc : plasmónové ( Au, Ag, Cu) kvantové body ( Zn. O, Zn. S) biokeramické (hydroxyapatit) Dimenzionalita 0. , 1. , 2. , 3. D Rok 2007 sústredenie na prípravu a izoláciu Au a Ag nanočastíc pasivovaných s glutationom Vlastnosti nanočastíc sú výrazne ovplyvnené veľkosťou a tvarom. Pri syntéze vznikajú vždy rozdielne štruktúry nanočastíc. S využitím techník používaných pri izolácii biomakromolekúl je možné získať chemicky čisté veľkosťou a tvarom rovnaké nanočastice. 6
PAGE elektroforéza Ag-glutation (Au- glutation)nanočastíc syntetizovaných mokrou cestou v rôznych koncentračných pomeroch reaktantov- Tieto nanočastice vytvárajú komplexy s cytochrómom c pričom zvyšujú jeho stabilitu v okolí hemu. Zlaté nanočastice majú výrazne protiagregačné vlastnosti na amyloidné štruktúry V súčasnosti prebieha charakterizácia ich magnetických vlastností. 7
ďakujem za pozornosť 8
Скачать презентацию Oddelenie biofyziky Smery výskumu Stabilita a funkcie
790515a0f65635ff5435c319486b1bd0.ppt