Nukleinsäuren
Nukleinsäuren Berg et al. „Stryer“ Biochemistry, 2003
Der Zucker - Ribose
Nukleoside (Zucker + Base)
Nukleotidstrukturen (Zucker+Base+Phosphat)
Absorptionspektren von Nukleotiden Konzentrationsbestimmung von Nukleinsäuren durch Messung eines UV-Spektrums
Nukleotide als Träger chemischer Energie
Nukleotide als Träger chemischer Energie
Nukleotide als Bestandteil von NAD+ und FAD
Phosphodiesterbrücken im kovalenten Rückrat von DNA und RNA
RNA-Hydrolyse unter alkalischen Bedingungen
Wasserstoffbrücken bei der Basenpaarung nach Watson und Crick
Watson-Crick Basenpaare sind isomorph Kool, Annu. Rev. Biochem. 2002. 71: 191– 219
Active Site von Polymerasen sind für Consensus-Form der Watson-Crick Basenpaare optimiert
A-, B- und Z-Form der DNA
DNA-Denaturierung Elektronenmikroskopie
DNA-Denaturierung Hyperchrome Effekt- "Schmelzpunkt" 50 % denaturiert
Basenpaarungen auch in einzelsträngigen Nukleinsäuren Bsp: Haarnadelstrukturen
DNA-Strukturen mit 4 Strängen (z. B. Telomere)
RNA - Sekundärstruktur
RNA-Strukturen in 3 -D ¡ t. RNA
3 -D RNA-Strukturen ¡ ¡ t. RNA Hammerhead. Ribozym
3 -D RNA-Strukturen ¡ ¡ ¡ t. RNA Hammerhead. Ribozym Teil einer m. RNA
3 -D RNA-Strukturen ¡ ¡ t. RNA Hammerhead. Ribozym Teil einer m. RNA Ribosom
Voet Biochemistry 3 e Page 1311 © 2004 John Wiley & Sons, Inc. Ribosomale RNA (Sekundärstruktur)
Ribosomale RNA (Tertiärstruktur) Voet Biochemistry 3 e Page 1314 © 2004 John Wiley & Sons, Inc. 16 S r. RNA von T. thermophilus
Ribosomale RNA (Tertiärstruktur) Voet Biochemistry 3 e Page 1314 © 2004 John Wiley & Sons, Inc. 3 OS Untereinheit von T. thermophilus
DNA-Synthese
Terminatoren Didesoxynukleotidtriphosphate H
DNA-Sequenzierung nach Sanger 2‘, 3‘-Didesoxynukleotide als Terminatoren
Automatische DNA-Sequenzierung Fluorophor-markierte Terminatoren
DNA-Synthese erfolgt in 5‘-3‘-Richtung leading und lagging strand
Voet Biochemistry 3 e Page 1139 © 2004 John Wiley & Sons, Inc. Replikations-“auge“
Synthese der Okazaki-Fragmente
Voet Biochemistry 3 e Page 100 © 2004 John Wiley & Sons, Inc. Replikation von E. coli DNA
Voet Biochemistry 3 e Page 114 © 2004 John Wiley & Sons, Inc. Polymerase. Kettenreaktion (PCR)
Voet Biochemistry 3 e Page 114 © 2004 John Wiley & Sons, Inc. Polymerase. Kettenreaktion (PCR)
Voet Biochemistry 3 e Page 114 © 2004 John Wiley & Sons, Inc. Polymerase. Kettenreaktion (PCR)
DNA-Replikation versus PCR ¡ Template-DNA ¡ Primer = 3‘-Ende der DNA (leading strand) bzw. RNA -Primer (lagging strand) ¡ Primer = synthetische Oligodesoxynukleodtide ¡ d. NTPs (d. ATP, d. GTP, d. CTP, d. TTP) ¡ z. B. Taq-DNA-Polymerase ¡ thermische Denaturierung des DNA-Doppelstranges ¡ DNA-Polymerase ¡ ATP-abhängige. DNAHelikase entwindet Doppelstrang
Struktur der DNA-Polymerase Elektrostatisches Potential
Nukleinsäuren und PCR Praktischer Teil ¡ ¡ Amplifikation des Gens eines DNAReparaturproteins mittels PCR Abhängigkeit der Produktmenge von l l ¡ Zyklenzahl der Anwesenheit einer Kompetitors (verkürzte Variante des Gens) Analyse der PCR-Produkte mittels Agarosegelelektrophorese
Nukleinsäuren und PCR Lernziele ¡ ¡ Nukleinsäure (Chemie und Struktur) DNA-Replikation Polymerase-Ketten-Reaktion (PCR) DNA-Sequenzierung
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