Нуклеиновые кислоты как лиганды
Нуклеиновые кислоты Передача генетической информации Репликация Транскрипция ДНК Трансляция м. РНК Белок (линейная последовательность аминокислот) кодируется ДНК (линейной последовательностью нуклеотидов)
Сахара (рибоза, 2 -дезоксирибоза) Азотистые основания (пурины, пиримидины) Нуклеозиды Фосфат Нуклеотиды Нуклеиновые кислоты (ДНК, РНК)
Сохранение, считывание и использование информации Нуклеиновые кислоты Субъединицы, которые повторяются Нуклеотиды Информационное содержание Привязка Азотистые основания (пурины, пиримидины) Рибоза + Фосфат
Пуриновые основания Пурин (9 Н-пурин) Аденин 3 Гуанин Содержатся как в ДНК, так и в РНК
4 3 5 6 2 Пиримидиновые основания 1 Цитозин (ДНК & РНК) Тимин (только ДНК) Урацил (только РНК)
Нуклеотидные пентозы 5’ 5’ 4’ 1’ 3’ 2’ D-рибоза (в РНК) 1’ 4’ 3’ 2’ 2 -дезокси-D-рибоза (в ДНК) Отличие: 2'-OH вместо 2'-H Это отличие влияет на: – вторичную структуру РНК & ДНК – стабильность РНК и ДНК
Нуклеозиды = основание+пентоза Ura 1 Основания соединяются гликозидными связями Ade Сахара повышают гидрофильность нуклеозидов по сравнению со “свободными” основаниями 9 рибоза
Нуклеотид = нуклеозид + фосфат Нуклеотиды – многоосновные кислоты (Aденозин 5’-мoнoфoсфат AMФ)
Соединение нуклеотидов за счет 5’-3’ фосфодиэфирных связей 3’ 5’ +H 2 O
Нуклеиновые кислоты: линейные полимеры нуклеотидов 5’ • Цепочка образована фосфодиэфирными связями между положениями 5’ и 3’ соседних сахаров • Последовательность всегда читается от 5' дo 3' (в протеинах от N дo C) 5’-GACA-3’ 3’
Двойная спираль ДНК Стабилизирована водородными связями “Пары оснований" являются следствием Н-связей: Ade одной цепочки соединяются с Thy другой цепочки, Gua соединяются с Cyt
Денатурация ДНК
Нуклеиновые кислоты как лиганды
Участки связывания металлов в нуклеиновых основаниях
Pb Pb Pt Примеры структур РНК со связанными ионами металлов: (а) комплекс Pb(II), который промотирует разрыв цепи РНК; (b) комплекс, который образует транс-[Pt(NH 3)2 Cl 2]
Примеры ковалентных связей и нековалентных взаимодействий металлов с ДНК: (А) схематическое изображение координации металлов с нуклеиновым основанием (N 7 гуанина), углеводом (ОН группами рибозы), и фосфатом (электростатическое взаимодействие Mg(H 2 O)62+ и гуанозинфосфатом); (В) образование стэкинг-структур при интеркаляции комплекса Pt(II) (над и под парами нуклеотидов); под 3+ и гуанином и фосфатом). (С) водородная связь (между лигандами комплекса Со(NH 3)6
Co Cd G
Интеркаляция в ДНК Связывание с ДНК Примеры комплексов металлов, которые связываются с ДНК за счет нековалентных взаимодействий (интеркаляция в ДНК)