Номенклатура и классификация ферментов
Два типа названия ферментов: n рабочее или тривиальное название субстрата + тип катализируемой реакции + « -аза» . Например: Лактат + дегидрогенизация + аза = лактатдегидрогеназа
n систематическое названия субстратов химической реакции +тип каталитического превращения + «аза» . Например: L-лактат + НАД+ + Оксидоредуктаза = L-лактат- НАД+ - оксидоредуктаза
Все ферменты разделены на шесть классов, каждый из которых имеет строго определенный номер n Название класса указывает на тип химической реакции !!! n Подкласс уточняет действие фермента, указывает природу химической группы субстрата!! n Подподкласс конкретизирует действие фермента, уточняя природу атакуемой связи субстрата или природу акцептора!
Шифр фермента, состоящий из четырех кодовых чисел, разделенных точками: Например: Лактатдегидрогеназа имеет шифр : 1. 1. 1. 27
Классификация ферментов 1. Оксидоредуктазы 2. Трансферазы 3. Гидролазы 4. Лиазы 5. Изомеразы 6. Лигазы (синтетазы)
I класс - ОКСИДОРЕДУКТАЗЫ Кофакторы оксидорекдуктаз: Тиаминпирофосфат (ТПФ) –включает витамин В 1 Флавинмононуклеотид (ФМН) - витамин В 2 Флафинадениндинуклеотид (ФАД) - витамин В 2 Никотинамидадениндинуклеотид (НАД) - витамин PP Металлы (железо, медь, магний, марганец и др. ).
I класс - ОКСИДОРЕДУКТАЗЫ 1. 1. ДЕГИДРОГЕНАЗЫ (или реже редуктазы).
n 1. 2. ОКСИГЕНАЗЫ. n 1. 2. 1. Монооксигеназы.
n 1. 2. 2. Диоксигеназы.
2. Трансферазы Катализируют реакции переноса различных групп от молекулы донора к молекуле акцептору Типы трансфераз и их кофакторы:
Гидролазы n Гидролитическое(с участием воды ) расщепление связей. Гидролазы расщепляют связи, как правило, без кофермента. Субстрат(аза) не всегда узкоспецифичны. Например: пептидазы - пепсин, трипсин -амилаза нуклеазы - ДНК-аза, РНК-аза липиза, фосфолипаза ферменты лизосом узкоспецифичные пептидазы сигнальных пептидов
Лиазы Расщепление связей способом отличным от гидролиза или окисления Например: альдолаза, карбоангидраза цитратсинтаза, аденилатсинтаза, фумаратгидратаза
Изомеразы Взаимопревращение различных изомеров n например:
Лигазы (синтетазы) Образование связи в реакции конденсации двух различных соединений (используется энергия АТФ) Например:
Витамины - кофакторы ферментов
Строение фермента - сложного белка Коферменты витаминные невитаминные
Тиамин (витамин В 1) пиримидин тиазол Входит в состав ферментов окислительного декарбоксилирования -кетокислот, а также является коферментом транскетолазы
Флавиновые коферменты относится к производным изоаллоксизана, входит в состав ФАД
Никотинамид. Производное витамина РР
НИКОТИНАМИДНЫЕ ДЕГИДРОГЕНАЗЫ Амид никотиновой кислоты Аденин Рибоза Фосфат = НАДФ
Пиридоксиновые коферменты Кофактор аминотрансфераз
Фолиевая кислота Кофактор метилтрансфераз
n Липоевая кислота –витамин N