Молекулярная эпидемиология вирусного гепатита В в Северо-Западном федеральном

Молекулярная эпидемиология вирусного гепатита В в Северо-Западном федеральном округе Эсауленко Е. В. , Сухорук А. А. , Иванова Н. В. ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера

Динамика заболеваемости ОГВ в РФ и СЗФО Вирусные гепатиты в Российской Федерации. Аналитический обзор. Выпуск 10. Под ред. В. И. Покровского, А. А. Тотоляна. СПб. : ФБУН НИИЭМ им. Пастера, 2016 – 152 с .

Число случаев ОГВ в субъектах СЗФО в 2015 – 2016 гг. (n = 177) Вирусные гепатиты в Российской Федерации. Аналитический обзор. Выпуск 10. Под ред. В. И. Покровского, А. А. Тотоляна. СПб. : ФБУН НИИЭМ им. Пастера, 2016 – 152 с .

Динамика заболеваемости ХГВ в РФ и СЗФО Вирусные гепатиты в Российской Федерации. Аналитический обзор. Выпуск 10. Под ред. В. И. Покровского, А. А. Тотоляна. СПб. : ФБУН НИИЭМ им. Пастера, 2016 – 152 с .

Вирус гепатита В обладает высокой генетической вариабельностью классифицирован по различным генотипам и субгенотипам, которые значительно отличаются в отношении: *географического распределения *путей передачи *перинатального инфицирования *клинического течения заболевания *развития тяжелых форм *ответа на противовирусную терапию или вакцинацию *клинических исходов: летальных, хронизации, прогрессирования патологического процесса в печени вплоть до цирроза печени * малигнизации (гепатокарцинома)

Филогенетическое дерево до и после реклассификации До после

Распространение генотипов ВГВ в мире D А А D G G D С F H D А D E А F H В С I В I С С J F В С • Сверхупрощенное распределение – популяции не статичны From: J Virol. 2009 October; 83(20): 10538– 10547. Published online 2009 July 29. doi: 10. 1128/JVI. 00462 -09

Comparison of clinical and virological features among hepatitis B virus genotypes ND: No data available; HBs. Ag: Hepatitis B surface antigen; HBe. Ag: Hepatitis B e antigen; L Сравнение клинических и вирусологических особенностей генотипов ВГВ Клин. хар-ки B Пути передачи Вертикальн Горизонт. Хронизация Низкая Высокая ND HBe. Ag + Низкая Высокая ND Клин. исходы Благоприят Тяжелый ный Благопри ятный Тяжелый ND Ответ на ИФН Высокий Низкий ND Ответ на НА C A Низкий D Нет различий между А и D E-J ND Уровень HBV DNA Низкий Высокий ND ND ND Частота pre. S мутаций Низкая Высокая ND ND ND . World J Gastroenterol. 2014 May 14; 20(18): 5427– 5434.

Цель исследования Изучить геторогенность вируса гепатита В (генотип/субгенотип), циркулирующего на территории Северо-Западного федерального округа у пациентов с острым гепатитом В

Санкт-Петербургский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера Лаборатория иммунологии и вирусологии ВИЧинфекции Лаборатория вирусных гепатитов Лен. Обл. Ненецкий Авт. округ Сыктывкар

Число случаев ОГВ в субъектах СЗФО в 2015 – 2016 гг. (n = 177) Вирусные гепатиты в Российской Федерации. Аналитический обзор. Выпуск 10. Под ред. В. И. Покровского, А. А. Тотоляна. СПб. : ФБУН НИИЭМ им. Пастера, 2016 – 152 с .

Число образцов плазмы крови больных ОГВ, полученных из субъектов СЗФО Наименование субъекта 2015 год 2016 год 2017 год (8 мес. ) Всего Архангельская область 3 4 4 11 Вологодская область 1 4 6 11 Калининградская область 3 8 3 14 Ленинградская область 2 0 0 2 Мурманская область 2 2 3 7 Новгородская область 0 0 Псковская область 1 0 0 1 Город Санкт-Петербург 12 2 6 20 Ненецкий автономный округ 0 0 Республика Коми 2 5 0 7 Республика Карелия 3 4 0 7 Всего 29 29 22 80

Методы исследования • Этиологическая принадлежность заболевания подтверждена маркерами вируса гепатита В: Hbs. Ag, Hbcor. Ab, HBe. Ag методом ИФА и DNA HBV методом PCR; • Маркеры других гепатотропных вирусов (А, С, D, Е) и ВИЧ – инфекции отсутствовали; • Генотипирование проведено методом «гнездовой» амплификации с последующим секвенированием, на втором этапе ПЦР с использованием пары праймеров, фланкирующих четыре региона генома вируса, в том числе рекомендованный для субгенотипирования ВГВ регион Pre-S 1/Pre-S 2/S область 2848 -3182. . . 1 -835 нт. , согласно представленному в международной базе данных Gen. Bank изоляту Mart-B 47 (HE 974377. 1); • Мутации генома ВГВ определялись при помощи тест-системы INNO-LIPA HBV Pre-core В методом транскрипционной амплификации.

Генотипы вируса гепатита В в России 24% 76% 47% 50% 94% 16% 84% Генотип 56% 44% A D C Чуланов В П. , 2008

Распределение генотипов вируса гепатита В в различных регионах 100% 80% D C B A 60% 40% 20% 0% St. Petersburg Petrozavodsk 2001 -2007 2008 -2010 Perm' Kazan' Hanoi

Временная линия установления и обозначения субгенотипов вируса гепатита В A 1 Ba, Bj A 3 A 7 B 9 D 11, C 12 D 8 B 8 C 7 A 6 D 9 1997 2001 2002 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 A 1, A 2 FⅠFⅡFⅡ B 1, B 2 C 1, C 2, C 3, C 4 D 1, D 2, D 3, D 4 FⅢ A 4, A 5 B 5 C 5 D 5 F 1, F 2, F 3, F 4 B 7 C 6 D 6 I 1, I 2 A 6 C 8, C 9, C 10 D 7 C 13, C 14 Pourkarim MR et al. Hepatitis B virus classification. World J Gastroenterol. , 2014. , № 20(23): 7152 -7168

Распространение субтипов ВГВ в мире

Распределение субтипов ВГВ в регионах мира M. R. Pourkarim, S. Amini-Bavil-Olyaee, F. Kurbanov, M. Van Ranst, F. Tacke. Molecular identification of hepatitis B virus genotypes/subgenotypes: Revised classification hurdles and updated resolutions. World J Gastroenterol 2014 June 21; 20(23): 7152 -7168

Распространение субгенотипов ВГВ в СЗФО (n = 71) D 3 D 2 D 3 А 2 D 1 D 3 А 2 D 3 D 2 ? D 3 D 1 D 2 D 3 ? D 3 D 1 D 3

Дендрограмма, характеризующая филогенетические отношения изолятов ВГВ, выделенных от пациентов с ОГВ в СЗФО

Структура субгенотипов вируса гепатита В в СЗФО (n = 71)

Распределение субтипов ВГВ и частота встречаемости мутаций в pre-core области генома вируса при тяжелом течении ОГВ n = 27

Вирусная нагрузка при ХГВ в Санкт-Петербурге и Ленинградской области (генотип D) N= 255 Эсауленко Е. В.

Заключение На территории Северо-Западного федерального округа циркулируют два генотипа вируса гепатита В – D и A, при доминировании D как при хроническом, так и при остром течение заболевания Среди субтипов ВГВ наиболее часто встречается D 2 и A 2 При тяжелом течении острого гепатита В, преобладают пациенты инфицированные ВГВ субтипа D 2