MAGIC-5 2009 -2011 Medical Applications on a Grid

MAGIC-5 (2009 -2011) (Medical Applications on a Grid Infrastructure Connection) M. E. Fantacci Linee di ricerca: CAD polmonare, analisi di neuroimmagini. Sezioni INFN: Bari, Genova, Lecce, Napoli, Pisa, Torino. Contatti e collaborazioni: Ospedali [Genova (neuro, S. Martino), Lecce (lung, oncologico), Pisa (lung, AOUP e UNI), Roma (lung, Fatebenefratelli IT), Bracco Imaging Sp. A (Pisa, INFNMED, lung), IMAGO 7 (Pisa, neuro)].

OUTLINE • 2010 – LUNG: • introduzione • upgrades e test del VBNACAD • composizione CAM-RGVP-VBNACAD • news dal mondo radiologico: lung CAD, Osiri. X • sviluppi preliminari Osiri. X • evoluzione INFNMED – NEURO: • studio di fattibilita’ di analisi di immagini MRI per la discriminazione del morbo di Alzheimer • 2011 – Programma scientifico, milestones, manpower, richieste

Introduzione

VBNACAD development: structure CAD input CADI CADJP VBNACAD architecture: 1. Lung segmentation ROI 2. ROI identification ROI 3. ROI classification CAD output z-1 z z z+1

Risultati del VBNACAD sui diversi DB I. A. Cunningham, World Congress AAPM

Upgrades e test del VBNACAD • Riduzione “selettiva” di falsi positivi applicata al VBNA CAD per l’individuazione di noduli pleurici: – suddivisione dei FP in categorie – allenamento di un classificatore esperto per ogni categoria che sia in grado di distinguere i FP della sua categoria dai noduli

Upgrades e test del ( VBNACAD @SPIE 2010)

COMPOSIZIONE CAM-RGVP-VBNACAD

COMPOSIZIONE CAM-RGVP-VBNACAD

News dal mondo radiologico: lung CAD • Presentati entusiasticamente a RSNA 2009 ed ECR 2010 i risultati di primi test CAD+RAD effettuati con lung CAD dalle prestazioni “alone” dichiarate ben peggiori dei nostri. • Stazionaria la situazione sull’efficacia dello screening per la riduzione effettiva della mortalita’ per lung cancer (e di conseguenza le prospettive di utilizzo dei CAD in questo ambito). • In rapidissima e positiva evoluzione le prospettive di uso dei CAD per i controlli oncologici (“screening” di metastasi polmonari, dose piena, possibilita’ di strato sottile). • Lavoro sui CAD della collaborazione MAGIC-5: menzione d’onore al congresso SIRM 2010.

News dal mondo radiologico: Osiri. X • http: //www. osirix-viewer. com/ • Pisa: intensivo uso di Osiri. X presso il Dipartimento di Radiologia Diagnostica ed Interventistica, stretti contatti con gli sviluppatori, ampia rappresentanza in Euro. PACS, contatto con Osman Ratib @ ECR 2010 (PG & ME)

Sviluppi preliminari Osiri. X Rad findings manager; Save/Retrieve rad findings; Cad findings import with probability selection; Cad findings manager; Hide/Show cad findings during rad annotation;

Sviluppi preliminari Osiri. X ESEMPIO

SVILUPPI INFNMED • MAGIC-5 lung CAD Ø Very good scientific results Ø VBNA: 1° in the ANODE 09 competition, poster award CARS 09 and honorary mention SPIE 2010 Ø MAGIC-5 -lung “radiological work”: honorary mention SPIE 2010 Ø Synergies between the different approaches (ANODE 09 analysis) • INFN-MED Requests (Bracco Imaging Sp. A: march 2009, im 3 d april 2009) Ø OK from INFNMED committee: may 2009 Ø Preliminary invitation letter (to 12 industries): february 2010 Ø 3 positive answers (Bio. Digital Valley, BRACCO Imaging Sp. A, MEDICAD: march 2010 Ø Planned: individual meetings with P. Cerello, R. Batistoni, A. Vacchi

MAGIC-5 -neuro@Pisa • MAGIC-5_neuro activities: analysis of MRI images to discriminate Alzheimer’s Diseases subjects. • @Pisa: VBM (Voxel Based Morphometry) analysis of AD (Alzheimer’s Disease), MCI (Mild Cognitive Impairment), HC (Healthy Controls) subjects to identify significant local GM (Grey Matter) differences by means of a SPM (Statistical Parametric Map).

Neuroimages analysis

Neuroimages analysis: preliminary results

Programma scientifico 2011 • LUNG – – Implementazione MAGIC-5 -lung CAD e ottimizzazioni Test CAD+RAD Plugin Osiri. X Collaborazione con INFNMED • NEURO – Estensione dell’analisi VBM con SPM alle immagini MRI strutturali del DB MAGIC-5 – Analisi whole brain – Sinergia con IMAGO 7 per l’analisi di immagini con differenti caratteristiche

Manpower e richieste 2011 @ PISA • 4 FTE “ortodossi”: – – – M. Barattini (spec. UNIPI) 100% N. Camarlinghi (dott. UNIPI) 100% S. Delle Canne (Fis. San. fbf-it) 100% M. E. Fantacci (ric. UNIPI) 70% A. Retico (ric. INFN) 30% • Collaboratori (più o meno “sulle spese”): – I. Gori (Bracco Imaging Sp. A) – A. De Liperi, F. Falaschi (U. O. Radiodiagnostica 2 AOUP) – S. Angeli, D. Caramella, E. Neri, U. Tani, M. Zangani (dip. radiologia UNIPI) • Richieste 2011: • MI: 12 keuro (riunioni di collaborazione, ospedali ed esperti per test clinici, 2 congressi nazionali). • • • ME: 10 keuro (tutorial e contatti Osiri. X, 2 congressi internazionali). • Spazio: per noi e per i nostri computers. Servizi: calcolo (a livello ticket). Consumo: 3 keuro (metabolismo). Inventariabile: 4 keuro (1 fisso e 1 portatile Apple per sviluppi Osirix e test clinici).