ЛЕКЦИЯ 3 Биологическая номенклатура Номенклатура от лат

ЛЕКЦИЯ 3 Биологическая номенклатура

Номенклатура (от лат. перечень, список) — совокупность названий, употребляемых в какой-либо отрасли науки для обозначения объектов изучения. Также в понятие номенклатуры входят правила присвоения этих названий. Назначение названий – служить средством общения. Подобно шифрам любых кодов, названия могут эффективно выполнять эту функцию только в том случае, если они понятны и имеют один и тот же смысл для всех, кто ими пользуется (Джеффри, 1980). Джеффри Ч. Биологическая номенклатура. М. Мир. 1980.

Основной принцип номенклатуры – однозначность и универсальность названий. Тривиальные (народные) названия этому условию не удовлетворяют. Рыжик – Lactarius deliciosus (слева), Tricholoma focale (справа)

Boletus edulis Bull. = кулак, коровка, еловик, боровик, дорогой гриб, олений гриб, коровятник, медвежатник; а также cep, porcini, hongo, Cèpe de Bordeaux, Polonais, Edelpilz, Steinpilz, Herrenpilz Исландский мох (лишайник) Ирландский мох (водоросль)

Тривиальные названия имеются не у всех организмов. Научные названия: чтобы соблюсти принцип универсальности, научные названия должны быть • латинскими по форме, • написаны латинскими буквами • подчиняться правилам латинской грамматики, т. е. , быть латинскими или латинизированными. Слева направо: Колпачок нежный, Пилолистничек медвежий, Негниючник-колёсико – попытки русифицирования латинских названий

Для унификации названий необходимо добровольное соглашение учёных и создание общих правил – кодексов. В эпоху Возрождения кодексами называли иллюстрированные справочники. 1601 г. – первая монография о грибах Карла Клузиуса, позднее названная «Codex Clusianus» , содержащая описания 47 «родов» и 105 «видов» . Первый номенклатурный кодекс – кодекс Стрикленда, 1842 г. , British Association code (Strickland 1842), регулирующий названия и растений, и животных. Рекомендации очень краткие, но многие применяются до сих пор. Им заложено главное противоречие между зоологами и ботаниками: авторство за тем, кто впервые описал, вне зависимости от таксономических перестановок.

Альфонс Луи Пьер Пирамю Декандолль (1806 – 1893) швейцарский ботаник, сын и преемник Огюстена Декандолля Первый ботанический кодекс создан А. Декандоллем, в 1867 г. принят Международным ботаническим конгрессом. Это прообраз современного ICBN International Code of Botanical Nomenclature (до 2011 г. ) и ICN - International Code of Nomenclature for algae, fungi, and plants, принятого на конгрессе в Мельбурне в 2011 г. Существуют также кодексы зоологической номенклатуры, номенклатуры вирусов и бактерий. Цель: присвоить любому таксону единственное правильное название, под которым он должен быть известен.

Задачи кодексов: исключить или отвергнуть использование названий, приводящих к неясности. Кодексы принимаются на международных конгрессах, проходящих с определённой периодичностью, самые важные их черты совпадают. Новый кодекс отменяет предыдущий, но изменения обычно касаются деталей. Основное содержание: ряд пронумерованных правил (статей), иногда снабжённых рекомендациями (советами). Правила обязательны присвоении или использовании названий, рекомендации – указывают пути решения вспомогательных вопросов.

Соблюдение кодексов основано на добровольном соглашении, несоблюдение приводит к нестабильности номенклатуры. Санкции – неодобрение и игнорирование работ. Сейчас у ботаников, микологов и альгологов действует Мельбурнский кодекс 2011 г. : «Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений» (http: //www. iapt-taxon. org/nomen/main. php). В июле 2017 г. планируется XIX Международный ботанический конгресс в Китае (Шэньчжэнь) и подготовка нового кодекса. Основные принципы кодексов: опубликование (обнародование), типификация и приоритет названий.

Порядок использования и присвоения научного названия Названия видов – бином, видовой эпитет, прилагательное, согласованное в роде с родовым названием, существительное как дополнение или в родительном падеже. После первого упоминания полного названия в тексте – род сокращается до первой буквы, если это не вносит неясностей. Внутривидовые таксоны: подвид, разновидность (вариетет), форма и др. триномиальные названия. Mycena epipterygia var. viscosa (Secr. ex Maire) Ricken

Ранг таксона Группа организмов растения водоросли грибы отдел/phylum, divisio - phyta - phycota mycota подотдел/ subphylum, subdivisio - phytina - phycotina - mycotina класс/classis - phyceae - mycetes подкласс/ subclassis - phycidae - mycetidae порядок/ordo - ales семейство/ familia - aceae род/genus вид/species* * биномиальное название; прочие - униномиальные

Порядок использования и присвоения научного названия Названия видов не обязательно отражают их свойства, хотя негласно это правило в основном соблюдают. Нестабильность номенклатуры: название таксона указывает на его ранг, поэтому таксономические изменения требуют изменения названий. Многие таксоны были известны одновременно или в разное время под двумя или более названиями. Затруднения: непрерывные изменения в систематике. Для ранга таксонов нет критериев. Разграничение проводится так, чтобы все члены таксона были более сходны друг с другом, чем с членами любого другого таксона того же ранга.

Порядок использования и присвоения научного названия Названия видов не обязательно отражают их свойства, хотя негласно это правило в основном соблюдают. Нестабильность номенклатуры: название таксона указывает на его ранг, поэтому таксономические изменения требуют изменения названий. Многие таксоны были известны одновременно или в разное время под двумя или более названиями. Затруднения: непрерывные изменения в систематике. Для ранга таксонов нет критериев. Разграничение проводится так, чтобы все члены таксона были более сходны друг с другом, чем с членами любого другого таксона того же ранга. Установление сходства также представляет проблему.

Распространение рогатикопдобных плодовых тел среди 14 основных клад Agaricomycetes – иллюстрация конвергенции жизненных форм Trechisporales Thelephorales Sebacinales Russulales Polyporales Phallomycetidae Hymenochaetales Gloeophyllales Corticiales Cantharellales Boletales Auriculariales Atheliales Agaricales (Hibbett, 2007)

Как выделить единственно верное научное название Опубликование (обнародование). Из-за подвижности систем возникает необходимость проверить, какие именно организм имел в виду автор, впервые использовавший данное название. Правильное по форме название может приобрести статус в номенклатуре только после опубликования (обнародования) способом, соответствующим кодексу, и при наличии описания, соответствующим кодексу. Agaricus: сейчас (слева) и в античном понимании (справа)

Как выделить единственно верное научное название Nomen nudum ( «голое название» ) – название без описания, которое не должно учитываться. Протолог – вся информация, связанная с первоописанием. Суть опубликования: средство опубликования должно быть достаточно долговечным и широко доступным для всех заинтересованных лиц. Если имеется описание (или его признанный эквивалент) и соблюдены другие требования кодекса, название становится (Б) действительным (valid). С этого момента название должно учитываться в биологической номенклатуре. С 1 января 2012 г. возможно эффективное опубликование в электронном источнике. С 1 января 2013 г. необходима регистрация таксонов в публичных базах.

Основные номенклатурные базы: Algae. Base, Index Fungorum, Myco Bank http: //www. algaebase. org/search/species/

База данных «Index Fungorum» http: //www. indexfungorum. org/Names. asp

База данных «Myco. Bank» http: //www. mycobank. org/Names. asp

База данных «Myco. Bank» http: //www. mycobank. org/Names. asp Для многих видов существует возможность просмотра описаний и иллюстраций. По вопросам систематического положения объекта и трактовки объема таксона встречаются значительные расхождения с Index Fungorum, поэтому при составлении списков необходимо пользоваться одной базой для всех таксонов.

Как выделить единственно верное научное название Опубликование также должно быть валидным (законным) – не соответствующие названия (nomen invalidum, illegitimum) должны быть отвергнуты. Большинство журналов и открытых баз в настоящее время требует приведения молекулярных данных, подтверждающих статус нового вида, опубликованных в открытом источнике. https: //www. ncbi. nlm. nih. gov/genbank/

Как выделить единственно верное научное название Типификация – процесс обозначения номенклатурного типа. Опубликование вводит название в биол. номенклатуру. Типификация связывает название с таксоном. Соотнесение названия с определённым таксоном через тип – во всех кодексах. Благодаря наличию типа правильное применение названий таксонов определяется независимо от систематических изменений. Тип – элемент, на котором было основано описание, связанное с первоначальным опубликованием названия. Б: тип названия семейства – род, тип названия рода – вид, тип названия вида – экземпляр (иногда описание или рисунок) Тип – понятие сугубо номенклатурное, он не обязан быть «типичным» . Описание оказалось связано с данными экземплярами случайно и тип может находиться в одной из крайних точек ряда изменчивости.

Pinus L. : P. sylvestris, P. pinea, P. taeda, P. cembra, P. strobus, P. cedrus, P. larix, P. picea, P. balsamea, P. abies 1. 2. 3. 4. 5. P. cedrus ―› род Cedrus P. larix ―› род Larix P. abies ―› род Picea P. picea, P. balsamea ―› род Abies P. sylvestris, P. pinea, P. taeda, P. cembra, P. strobus ―› род Pinus

Категории типов Номенклатурный тип (typus) — элемент, с которым постоянно связано название таксона, не зависимо от того, правильное оно или синоним. Голотип – единственный элемент, использованный автором названия, или один из элементов. Синтип – один из элементов, использованных автором как тип, не указавшим голотип, или обозначившим одновременно более одного типа. Лектотип – выбирается из синтипа, чтобы служить номенклатурным типом впоследствии. Неотип – выбирается в случае утраты предшествующего. Если типификацию провести невозможно из-за отсутствия данных, утраты типа или разнородности его элементов – название отвергается.

Приоритет -преимущество старейшего из пригодных названия, это название «правильное» . Необходимо помнить о точках отсчёта (исходных датах): ограничения приоритета. Также не учитываются при определении приоритета названия, не соответствующие кодексу. Отвергаются омонимы (одинаковые по написанию названия, основанные на разных типах). Отвергаются широко и постоянно употребляемые ошибочно названия. Сохранение и отвержение названий (Б) – от рода до семейства.

Синонимика -все, как правило, более поздние (младшие синонимы) названия «правильного» . Важно различать действительные и недействительные синонимы. Номенклатурные синонимы – основанные на том же типе (абсолютные – облигатные, гомотипные). Таксономические синонимы – основаны на разных типах, эта синонимия может измениться (гетеротипные, субъективные).

Все названия ОПУБЛИКОВАНИЕ (ОБНАРОДОВАНИЕ) Неопубликованные названия (отвергнутые) Опубликованные названия ФОРМА Правильные по форме названия Неправильные по форме названия (отвергнутые) ТИПИФИКАЦИЯ Применимые к данному таксону названия Неприменимые к данному таксону названия (применимые к другому или не применимые ни к какому) [ЗАКОННОСТЬ] Неучитываемые при определении приоритета названия (синонимы) Учитываемые при определении приоритета названия ПРИОРИТЕТ Название, под которым таксон должен быть известен (правильное название) Другие названия этого же таксона (младшие синонимы)

«Ботанический» и зоологический кодексы: сходство • Один таксон – одно научное название, латинское по форме, написанное латинскими буквами и соответствующее латинской грамматике. • Правила опубликования новых названий и определение, приемлемы ли предыдущие опубликованные. • Точная документация и датировка названий. • Каждое название должно быть привязано к типу (образцу или таксону). • Изменение названий в соответствии с типом при таксономических перестановках. • Временные «точки отсчёта» названий, названия, опубликованные до них не учитываются. • Система управления кодексами (ботанический комитет, зоологическая комиссия по номенклатуре).

«Ботанический» и зоологический кодексы: различия Кодексы независимы, одно и то же название может быть дано животному и растению. Pieris – растение из Вересковых и бабочка белянка Б – кодифицируются ранги таксонов от отдела до подформы. З - кодифицируются ранги таксонов от надсемейства до подвида.

«Ботанический» и зоологический кодексы: различия • Различаются стартовые точки (в Б их больше). • Ранее в Б требовался латинский диагноз, с 2011 г. – может быть заменён английским. • Тавтонимы (вид и род с одинаковым названием) допустимы только в З. • Законность в Б – если название не соответствует правилам, оно не учитывается в установлении приоритета. • Избыточные названия в Б – название, применённое к таксону, включающему тип другого названия. • Приоритет в Б действует в отношении современного сочетания видового и родового названий. Bubo bubo

«Ботанический» и зоологический кодексы: различия Порядок Подпорядок Надсемейство Семейство Подсемейство Триба • • • ICBN -ales -ineae* -aceae -oideae -eae ICZN (-oidea) рекоменд. -idae -inae (-ini) рекоменд. Суффикс –oides (подобие): ж в Б и м в З. Различны правила отвержения названий. Различны правила номенклатуры ископаемых форм. Различны правила типификации. Различны термины, применяемые к одним и тем же номенклатурным концепциям.

Основные отличия Мельбурнского кодекса от предыдущих • Изменено название. • Возможность электронного действительного и эффективного обнародования. • Описание и диагноз могут быть не только на латыни , но и на английском языке. • Один гриб – одно название. • Регистрация названий грибов в базах для действительного опубликования. • Электронное приложение к кодексу.