КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ КОНСЕРВАТИВНОСТИ АЛЬТЕРНАТИВНОГО СПЛАЙСИНГА В ОРТОЛОГИЧНЫХ ГЕНАХ

КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ КОНСЕРВАТИВНОСТИ АЛЬТЕРНАТИВНОГО СПЛАЙСИНГА В ОРТОЛОГИЧНЫХ ГЕНАХ Государственный научно-исследовательский институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов (Гос. НИИгенетика)

GENE organism 1 organism 2

GENE organism 1 organism 2

GENE exon 1 exon 2 exon 3 События в ортологичном гене : 1. консервация экзона 2. интронная вставка в экзон 3. делеция интрона 4. делеция экзона exon 4 … exon m-1 exon m

Классификация альтернатив 1. удержанный интрон GENE isoform 1 isoform 2

Классификация альтернатив 1. удержанный интрон 2. альтернативный донорный сайт GENE isoform 1 isoform 2

Классификация альтернатив 1. удержанный интрон 2. альтернативный донорный сайт 3. альтернативный акцепторный сайт GENE isoform 1 isoform 2

Классификация альтернатив 1. удержанный интрон 2. альтернативный донорный сайт 3. альтернативный акцепторный сайт 4. кассетный экзон GENE isoform 1 isoform 2

Классификация альтернатив Классификация экзонов и кодирующих сегментов 1. удержанный интрон 2. альтернативный донорный сайт 1. внутренний 3. альтернативный акцепторный сайт внешний 3. 4. кассетный экзон 5. чередующийся экзон GENE isoform 1 1 isoform 2 2 isoform

GENE coding segment 1 coding segment 2 coding segment 3 coding segment 4 coding segment 5 coding segment 6 isoform 1 isoform 2 coding segment 1 3 segment 2 isoform coding segment 3 coding segment 4 … coding segment n-1 coding segment n isoform 4 exon 1 exon 2 exon 3 … exon 4 isoform 1 isoform 2 … isoform k-1 exon m-1 isoform k exon m

Dme, Dps Aga

Dme, Dps Aga

Dme Dps Aga

stop Dme, Dps Aga (combined with acceptor site)

Dme, Dps Aga i ii iv

Evolution of the exon-intron structure and alternative splicing in fruit flies and malarial mosquito genomes D. B. Malko, V. J. Makeev, A. A. Mironov, M. S. Gelfand Genome Research, 2006 Apr; 16(4): 505 -509. Epub 2006 Mar 6.