Скачать презентацию КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ КОНСЕРВАТИВНОСТИ АЛЬТЕРНАТИВНОГО СПЛАЙСИНГА В ОРТОЛОГИЧНЫХ ГЕНАХ Скачать презентацию КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ КОНСЕРВАТИВНОСТИ АЛЬТЕРНАТИВНОГО СПЛАЙСИНГА В ОРТОЛОГИЧНЫХ ГЕНАХ

9309585f8dd4e09d54f0f39454bd89c2.ppt

  • Количество слайдов: 16

КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ КОНСЕРВАТИВНОСТИ АЛЬТЕРНАТИВНОГО СПЛАЙСИНГА В ОРТОЛОГИЧНЫХ ГЕНАХ Государственный научно-исследовательский институт генетики и селекции КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ КОНСЕРВАТИВНОСТИ АЛЬТЕРНАТИВНОГО СПЛАЙСИНГА В ОРТОЛОГИЧНЫХ ГЕНАХ Государственный научно-исследовательский институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов (Гос. НИИгенетика)

GENE organism 1 organism 2 GENE organism 1 organism 2

GENE organism 1 organism 2 GENE organism 1 organism 2

GENE exon 1 exon 2 exon 3 События в ортологичном гене : 1. консервация GENE exon 1 exon 2 exon 3 События в ортологичном гене : 1. консервация экзона 2. интронная вставка в экзон 3. делеция интрона 4. делеция экзона exon 4 … exon m-1 exon m

Классификация альтернатив 1. удержанный интрон GENE isoform 1 isoform 2 Классификация альтернатив 1. удержанный интрон GENE isoform 1 isoform 2

Классификация альтернатив 1. удержанный интрон 2. альтернативный донорный сайт GENE isoform 1 isoform 2 Классификация альтернатив 1. удержанный интрон 2. альтернативный донорный сайт GENE isoform 1 isoform 2

Классификация альтернатив 1. удержанный интрон 2. альтернативный донорный сайт 3. альтернативный акцепторный сайт GENE Классификация альтернатив 1. удержанный интрон 2. альтернативный донорный сайт 3. альтернативный акцепторный сайт GENE isoform 1 isoform 2

Классификация альтернатив 1. удержанный интрон 2. альтернативный донорный сайт 3. альтернативный акцепторный сайт 4. Классификация альтернатив 1. удержанный интрон 2. альтернативный донорный сайт 3. альтернативный акцепторный сайт 4. кассетный экзон GENE isoform 1 isoform 2

Классификация альтернатив Классификация экзонов и кодирующих сегментов 1. удержанный интрон 2. альтернативный донорный сайт Классификация альтернатив Классификация экзонов и кодирующих сегментов 1. удержанный интрон 2. альтернативный донорный сайт 1. внутренний 3. альтернативный акцепторный сайт внешний 3. 4. кассетный экзон 5. чередующийся экзон GENE isoform 1 1 isoform 2 2 isoform

GENE coding segment 1 coding segment 2 coding segment 3 coding segment 4 coding GENE coding segment 1 coding segment 2 coding segment 3 coding segment 4 coding segment 5 coding segment 6 isoform 1 isoform 2 coding segment 1 3 segment 2 isoform coding segment 3 coding segment 4 … coding segment n-1 coding segment n isoform 4 exon 1 exon 2 exon 3 … exon 4 isoform 1 isoform 2 … isoform k-1 exon m-1 isoform k exon m

Dme, Dps Aga Dme, Dps Aga

Dme, Dps Aga Dme, Dps Aga

Dme Dps Aga Dme Dps Aga

stop Dme, Dps Aga (combined with acceptor site) stop Dme, Dps Aga (combined with acceptor site)

Dme, Dps Aga i ii iv Dme, Dps Aga i ii iv

Evolution of the exon-intron structure and alternative splicing in fruit flies and malarial mosquito Evolution of the exon-intron structure and alternative splicing in fruit flies and malarial mosquito genomes D. B. Malko, V. J. Makeev, A. A. Mironov, M. S. Gelfand Genome Research, 2006 Apr; 16(4): 505 -509. Epub 2006 Mar 6.