Скачать презентацию ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ДАННЫЕ И КОМПЛЕКСНАЯ РЕКОНСТРУКЦИЯ ИСТОРИИ ЧЕЛОВЕЧЕСТВА Светлана Скачать презентацию ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ДАННЫЕ И КОМПЛЕКСНАЯ РЕКОНСТРУКЦИЯ ИСТОРИИ ЧЕЛОВЕЧЕСТВА Светлана

61815b6348a3dd99305163010557fa46.ppt

  • Количество слайдов: 55

ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ДАННЫЕ И КОМПЛЕКСНАЯ РЕКОНСТРУКЦИЯ ИСТОРИИ ЧЕЛОВЕЧЕСТВА Светлана Боринская Институт общей генетики им. Н. ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ДАННЫЕ И КОМПЛЕКСНАЯ РЕКОНСТРУКЦИЯ ИСТОРИИ ЧЕЛОВЕЧЕСТВА Светлана Боринская Институт общей генетики им. Н. И. Вавиловва РАН Клуб «Антропогенез» 30 апреля 2011

РЕКОНСТРУКЦИЯ ГЛОБАЛЬНЫХ И РЕГИОНАЛЬНЫХ МИГРАЦИЙ ПО РАЗНООБРАЗИЮ ЛИНИЙ ДНК РЕКОНСТРУКЦИЯ ГЛОБАЛЬНЫХ И РЕГИОНАЛЬНЫХ МИГРАЦИЙ ПО РАЗНООБРАЗИЮ ЛИНИЙ ДНК

ДАВНЫМ ДАВНО (~150 000 лет назад) ЖИЛИ БЫЛИ В АФРИКЕ АДАМЫ И ЕВЫ (популяция ДАВНЫМ ДАВНО (~150 000 лет назад) ЖИЛИ БЫЛИ В АФРИКЕ АДАМЫ И ЕВЫ (популяция Ne~ 5000)

логарифмическая шкала Население мира ОНИ ПЛОДИЛИСЬ И РАЗМНОЖАЛИСЬ Peter Turchin, 2002 логарифмическая шкала Население мира ОНИ ПЛОДИЛИСЬ И РАЗМНОЖАЛИСЬ Peter Turchin, 2002

25 - 15 тыс. лет назад их потомки заселили почти всю Землю (50 о 25 - 15 тыс. лет назад их потомки заселили почти всю Землю (50 о ю. ш. - 70 о с. ш. )

Древо линий Y хромосомы человека Каждая линия соответствует появлению мутации Даты, тыс. лет назад, Древо линий Y хромосомы человека Каждая линия соответствует появлению мутации Даты, тыс. лет назад, указывают распространение этих мутаций (и маркированных ими линий) в популяциях. A>100000 BP - ancestral for all men E - step to Eurasia 50000 BP N 3 - N Eurasia, <10000 BP

Относительные частоты европейских и азиатских линий у народов европейской части России Относительные частоты европейских и азиатских линий у народов европейской части России

Нужны 3 -мерные карты Пути распространения генетических линий проходят через популяции, а не через Нужны 3 -мерные карты Пути распространения генетических линий проходят через популяции, а не через горы и долины. Чтобы «привязать» линии к географическим точкам, необходимо исследовать ДНК из древних останков.

Пути распространения генетических линий проходят через популяции, а не через горы и долины. Чтобы Пути распространения генетических линий проходят через популяции, а не через горы и долины. Чтобы «привязать» линии к географическим точкам, необходимо исследовать ДНК из древних останков.

мт. ДНК гаплогруппа N 1 a - у 25% земледельцев LBK - у 0. мт. ДНК гаплогруппа N 1 a - у 25% земледельцев LBK - у 0. 2% современного населения той же территории Haak et al. , Science 2005

Ц. Азия В Центральной Азии N 1 a живет не менее 2500 лет, так Ц. Азия В Центральной Азии N 1 a живет не менее 2500 лет, так как найдена в скифо-сибирском захоронении на Алтае Европа (Ricaut et al. , 2004) Африка и Ю. Азия мт. ДНК Медианная сеть для гаплогруппы N 1 a Haak et al. , Science 2005

Созданы и интенсивно развиваются глобальные генетические базы Созданы и интенсивно развиваются глобальные генетические базы

The Genographic Project, launched on April 13, 2005 by the National Geographic Society and The Genographic Project, launched on April 13, 2005 by the National Geographic Society and IBM, is a multi-year genetic anthropology study that aims to map historical human migration patterns by collecting and analyzing DNA samples from hundreds of thousands of people from around the world. Сайт «Генофонд. ру» российских участников проекта «Генографик» (О. П. и Е. В. Балановские)

Одна из крупнейших баз данны по разнообразию гаплогрупп мт. ДНК и Y-хромосомы создана в Одна из крупнейших баз данны по разнообразию гаплогрупп мт. ДНК и Y-хромосомы создана в Тарту под руководством Рихарда Виллемса

Чтобы сравнивать генетические и археологические данные нужны электронные атласы и базы данных, описывающие первичные Чтобы сравнивать генетические и археологические данные нужны электронные атласы и базы данных, описывающие первичные археологические данные и их обобщения. Такие атласы пока только начали создаваться

Peter N. Peregrine Atlas of Cultural Evolution 2003 World Cultures 14(1): 2 -88 Department Peter N. Peregrine Atlas of Cultural Evolution 2003 World Cultures 14(1): 2 -88 Department of Anthropology, Lawrence University, Appleton, WI

Peter N. Peregrine Atlas of Cultural Evolution 2003 World Cultures 14(1): 2 -88 Department Peter N. Peregrine Atlas of Cultural Evolution 2003 World Cultures 14(1): 2 -88 Department of Anthropology, Lawrence University, Appleton, WI

Peter N. Peregrine Atlas of Cultural Evolution 2003 World Cultures 14(1): 2 -88 Department Peter N. Peregrine Atlas of Cultural Evolution 2003 World Cultures 14(1): 2 -88 Department of Anthropology, Lawrence University, Appleton, WI

Peter N. Peregrine Atlas of Cultural Evolution 2003 World Cultures 14(1): 2 -88 Department Peter N. Peregrine Atlas of Cultural Evolution 2003 World Cultures 14(1): 2 -88 Department of Anthropology, Lawrence University, Appleton, WI

в Месопотамии появились исторические записи Peter N. Peregrine Atlas of Cultural Evolution 2003 World в Месопотамии появились исторические записи Peter N. Peregrine Atlas of Cultural Evolution 2003 World Cultures 14(1): 2 -88 Department of Anthropology, Lawrence University, Appleton, WI

письменная культура в Греко-Романском мире и Китае Peter N. Peregrine Atlas of Cultural Evolution письменная культура в Греко-Романском мире и Китае Peter N. Peregrine Atlas of Cultural Evolution 2003 World Cultures 14(1): 2 -88 Department of Anthropology, Lawrence University, Appleton, WI

письменность распространена почти во всей Евразии Peter N. Peregrine Atlas of Cultural Evolution 2003 письменность распространена почти во всей Евразии Peter N. Peregrine Atlas of Cultural Evolution 2003 World Cultures 14(1): 2 -88 Department of Anthropology, Lawrence University, Appleton, WI

Частый пример: сравнение распространения определенной гаплогруппы Y-хромосомы и определенного типа расписной керамики R. King, Частый пример: сравнение распространения определенной гаплогруппы Y-хромосомы и определенного типа расписной керамики R. King, P. Underhill Antiquity 2002 76: 707 -714

ГЛОБАЛЬНОЕ СОПОСТАВЛЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИХ И АРХЕОЛОГИЧЕСКИХ ДАННЫХ: базы данных, генетические и арехологические атласы и программы ГЛОБАЛЬНОЕ СОПОСТАВЛЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИХ И АРХЕОЛОГИЧЕСКИХ ДАННЫХ: базы данных, генетические и арехологические атласы и программы картирования могут быть решены вопросы о распространении культур с установленными по генетическим данным волнам расселения, о связи отдаленных арехеологических культур, получены данные закономерностях межпоколенной передачи особенностей культуры. Генетики могу получить более надежные «реперные точки» для своих датировок.

СОПОСТАВЛЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИХ И ЛИНВИСТИЧЕСКИХ ДАННЫХ: история и закономерности распространения языков СОПОСТАВЛЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИХ И ЛИНВИСТИЧЕСКИХ ДАННЫХ: история и закономерности распространения языков

. . . . . .

Мировое древо языков. Древо составлено А. Ю. Милитаревым по результатам подсчетов и представлений группы Мировое древо языков. Древо составлено А. Ю. Милитаревым по результатам подсчетов и представлений группы С. А. Старостина на сегодняшний день. http: //www. ng. ru/science/2007 -05 -23/14_yazyk. html

Сергей Анатольевич СТАРОСТИН 1953 -2005 Сергей Анатольевич СТАРОСТИН 1953 -2005

ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИСТОРИЯ ЧЕЛОВЕЧЕСТВА не только история расселения, но и история изменения частот аллелей генов, ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИСТОРИЯ ЧЕЛОВЕЧЕСТВА не только история расселения, но и история изменения частот аллелей генов, важных для адаптации

15 000 лет назад население мира: 10 млн охотники-собиратели: 100% 1500 н. э. население 15 000 лет назад население мира: 10 млн охотники-собиратели: 100% 1500 н. э. население мира: 350 млн охотники-собиратели: 1% 1960 население мира: 3 000 млн охотники-собиратели: 0. 001% From: Times Atlas of Archaeology, p. 78

Земледельцы перешли к оседлому образу жизни Снижение продолжительности жизни , роста, показателей здоровья СМЕНА Земледельцы перешли к оседлому образу жизни Снижение продолжительности жизни , роста, показателей здоровья СМЕНА ТИПА ПИТАНИЯ РОСТ ЧАСТОТЫ ИНФЕКЦИОННЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ: рост плотности населения; новые источники инфекций при одомашнивании животных, развитии технологий хранения продуктов Реконструкция ближневосточного раннеземледельческого поселения Чаттал. Хеюк, 7000 лет до н. э. Çatal Hüyük Times Atlas of Archaeology, p. 82

Пример из учебника –усвоение молока Хозяйственно-культурные особенности Отражение развития молочного животноводства в генах людей Пример из учебника –усвоение молока Хозяйственно-культурные особенности Отражение развития молочного животноводства в генах людей и коров

НЕПЕРЕНОСИМОСТЬ МОЛОКА И АКТИВНОСТЬ ГЕНА ЛАКТАЗЫ 100% 85% Активность лактазы 2% Подростки Финны Взрослые НЕПЕРЕНОСИМОСТЬ МОЛОКА И АКТИВНОСТЬ ГЕНА ЛАКТАЗЫ 100% 85% Активность лактазы 2% Подростки Финны Взрослые Японцы

ЧАСТОТА НЕПЕРЕНОСИМОСТИ МОЛОЧОГО САХАРА (АЛЛЕЛЬ ГЕНА ЛАКТАЗЫ LAC*R) Русские 30 -50% Голландцы, датчане <5% ЧАСТОТА НЕПЕРЕНОСИМОСТИ МОЛОЧОГО САХАРА (АЛЛЕЛЬ ГЕНА ЛАКТАЗЫ LAC*R) Русские 30 -50% Голландцы, датчане <5% Народы Сибири > 70% Южная Европа и Ближний Восток 60 -80% Козлов А. И. , Балановски О. П. , Нурбаев С. Д. , Балановская Е. В.

Самое большое разнообразие казеинов молока у коров (т. е. где их интенсивно разводили) там Самое большое разнообразие казеинов молока у коров (т. е. где их интенсивно разводили) там же, где самая высокая частота персистенции лактазы у людей. PC 1 – разнообразие казеинов молока у коров Ранние неолит. животноводы Beja-Pereira et al. , Gene-culture coevolution between cattle milk protein genes and human lactase genes // Nature Genetics 35, 311 - 313 (2003)

НЕОЛИТИЧЕСКИ СКЕЛЕТЫ: судя по анализам ДНК, их обладатели молоко пить не могли J. Burger, НЕОЛИТИЧЕСКИ СКЕЛЕТЫ: судя по анализам ДНК, их обладатели молоко пить не могли J. Burger, M. Kirchner, B. Bramanti, W. Haak, M. G. Thomas. Absence of the lactasepersistence-associated allele in early Neolithic Europeans PNAS 2007 104: 3736 -41 Оценка возраста аллеля С/T 13910 7 450 - 12 300 (по другим данным 2 188 - 20 650) Скотоводство в Европе 7000 - 6500 лет назад

Генетический анализ с/х животных и растений позволяет установить время и регионы одомашнивания и пути Генетический анализ с/х животных и растений позволяет установить время и регионы одомашнивания и пути распространения связанных с этим хозяйственно-культурных инноваций. Сопоставление результатов с волнами миграций человека позволяет выявить способы распространения культурных инноваций

ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИСТОРИЯ ЧЕЛОВЕЧЕСТВА не только история расселения, но и история изменения частот аллелей генов, ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИСТОРИЯ ЧЕЛОВЕЧЕСТВА не только история расселения, но и история изменения частот аллелей генов, важных для адаптации

В реконструкции популяционнодемографической истории человека и его миграций генетики используют нейтральные признаки, различающие популяции. В реконструкции популяционнодемографической истории человека и его миграций генетики используют нейтральные признаки, различающие популяции. Приспособление к природной и антропогенной среде ведет к дивергенции популяций по адаптивным признакам

СПОСОБ ИССЛЕДОВАНИЯ: • Сравнительный анализ генетических характеристик представителей современных обществ разных типов • Исследования СПОСОБ ИССЛЕДОВАНИЯ: • Сравнительный анализ генетических характеристик представителей современных обществ разных типов • Исследования древней ДНК ОЖИДАЕМЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ: Понимание взаимодействия генов и среды, в том числе антропогенной Выявление изменения адаптивной ценности аллелей в разных условиях среды и при разных жизненных стилях Выработка рекомендаций по подбору оптимальных условий среды для конкретных генотипов => профилактика мультифакторных заболеваний

НЕОБХОДИМО ДЛЯ ИССЛЕДОВАНИЯ: • Базы данных частот аллелей и генотипов • Детальные характеристики среды, НЕОБХОДИМО ДЛЯ ИССЛЕДОВАНИЯ: • Базы данных частот аллелей и генотипов • Детальные характеристики среды, характера питания и жизненного стиля (этнографические описания)

Генетические базы данных частот аллелей есть и интенсивно развиваются Генетические базы данных частот аллелей есть и интенсивно развиваются

А КАК ОБСТОИТ ДЕЛО С ЭТНОГРАФИЧЕСКИМИ ДАННЫМИ? А КАК ОБСТОИТ ДЕЛО С ЭТНОГРАФИЧЕСКИМИ ДАННЫМИ?

Encyclopedia of World Cultures Народы и религии мира David Levinson (Ed. ) Encyclopedia of World Cultures Народы и религии мира David Levinson (Ed. ) "Большая Российская энциклопедия", М. , 1999 Гл. ред. В. А. Тишков. Mac. Millan Reference Books 1991, 2002 3855 с. (10 томов) -Тексты- 928 с. 1250 статей о народах 1500 народов Электронная база данных Ethnographic Atlas George Peter Murdock Ethnology, 1962 -1980 1267 народов по 100 параметрам файл SPSS ~ 800 к. Б

Map of 1267 societies in Murdock's Ethnographic Atlas. 30 societies of former Soviet Union Map of 1267 societies in Murdock's Ethnographic Atlas. 30 societies of former Soviet Union are presented among them. Мы добавили описания еще 60 обществ - народы СССР в Аласе - народы в данном проекте - другие народы Коротаев, Боринская и др.

Примеры описания переменных в Этнографическом атласе Мердока Variable description in Murdock’s Ethnographic Atlas Gathering Примеры описания переменных в Этнографическом атласе Мердока Variable description in Murdock’s Ethnographic Atlas Gathering Marital Composition All variables are presented in coded form and can be used for statistic analysis

Пример корреляционного анализа популяционно-генетических и этнографических данных У охотников-собирателей редко встречаются нарушения цветового зрения Пример корреляционного анализа популяционно-генетических и этнографических данных У охотников-собирателей редко встречаются нарушения цветового зрения Вклад охоты в питание 2 >15% Baga Koryak Zulu 1 >5% Hunting Data from Murdock’s Ethnographic Atlas Chukchee Yakuts Japanese Russians Druze 0 Популяционная частота нарушений цветового зрения (19 этнических групп, по Рычков и др. , 2000)

Еще волнующий пример Гены ADH 1 B и ALDH 2, кодирующе ферменты метаболизма алкоголя, Еще волнующий пример Гены ADH 1 B и ALDH 2, кодирующе ферменты метаболизма алкоголя, полиморфны. Вариант ADH 1 B*48 His кодирует высокоактивный фермент. ALDH 2*504 Lys кодирует каталитически неактивную субъединицу Алкогольдегидрогеназа Альдегидрогеназа ALDH 2*504 Glu ADH 1 B*48 Arg Европа: Восточная Азия: ADH 1 B*48 His ALDH 2*504 Lys Географическое распределение частот аллелей ADH 1 B*48 His ALDH 2*504 Lys Borinskaya et al. , AJHG 2009 Li, Borinskaya et al. , AHG 2009

волнующий пример Предполагается, что частота аллеля ADH 1 B*48 His выросла в популяциях Юго. волнующий пример Предполагается, что частота аллеля ADH 1 B*48 His выросла в популяциях Юго. Восточной Азии под действием отбора • Анализ гаплотипов Han et al. , Evidence of Positive Selection on a Class I ADH Locus. AJHG 2007 Fst и long-range haplotype (LRH, тест, показывающий быстрое увеличение частоты гаплотипа, которое может быть результатом недавнего в эволюционных масштабах позитивного отбора) • В одних и тех же популяциях возросли частоты производных аллелей генов, находящихся на разных хромососмах и контролирующих один этап метаболизма – накопление ацетальдегида при оксилении алкоголя ADH 1 B (4 q 22) и ALDH 2 (12 q 24), • Факторы отбора не известны

Генетический анализ распространения патогенов человека – чем болели в прошлом Генетический анализ распространения патогенов человека – чем болели в прошлом

Устойчивость к инфекциям: Частота варианта гена CCR 5 delta 32 в Европе от 3000 Устойчивость к инфекциям: Частота варианта гена CCR 5 delta 32 в Европе от 3000 лет назад до современности Bronze Age (17) Modern Germany (346) Modern Italy (100)

Cultural variation in Africa: role of mechanisms of transmission and adaptation. PNAS 1995 92(16): Cultural variation in Africa: role of mechanisms of transmission and adaptation. PNAS 1995 92(16): 7585 -9. Guglielmino CR, Viganotti C, Hewlett B, Cavalli-Sforza LL. Лингвистическое родство использовали как маркер родства по происхождению, что не для всех случаев верно. Генетические данные по исследованным группам были недоступны ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ДАННЫХ В ИССЛЕДОВАНИИ ЗАКОНОМЕРНОСТЕЙ КУЛЬТУРНОЙ ЭВОЛЮЦИИ: какие характеристики общества наследуются от предков, какие зависят от экологических условий, какие передаются при контактах с соседями Cultural inheritance can be considered as a mechanism of adaptation made possible by communication, which has reached its greatest development in humans and can allow longterm conservation or rapid change of culturally transmissible traits depending on circumstances and needs. Conservativeness/flexibility is largely modulated by mechanisms of sociocultural transmission. An analysis was carried out by testing the fit of three models to 47 cultural traits (classified in six groups) in 277 African societies. Model A (demic diffusion) is conservation over generations, as shown by correlations of cultural traits with language, used as a measure of historical connection. Model B (environmental adaptation) is measured by correlation to the natural environment. Model C (cultural diffusion) is the spread to neighbors by social contact in an epidemic-like fashion and was tested by measuring the tightness of geographic clustering of the traits. Most traits examined, in particular those affecting family structure and kinship, showed great conservation over generations, as shown by the fit of model A. They are most probably transmitted by family members. This is in agreement with theoretical demonstration that cultural transmission in the family (vertical) is the most conservative one. Some traits show environmental effects, indicating the importance of adaptation to physical environment. Only a few of the 47 traits showed tight geographic clustering indicating that their spread to nearest neighbors follows model C, as is usually the case for transmission among unrelated people (called horizontal transmission).

Человечество участвует в двух эволюциях - биологической и культурной. И они не независимы, а Человечество участвует в двух эволюциях - биологической и культурной. И они не независимы, а взаимозависимы. Они могут быть поняты только как компоненты единой системы. Ф. Добжанский Theodore Dobzhansky Mankind Evolving (1962)

СПАСИБО, ЧТО ТАК ТЕРПЕЛИВО МЕНЯ СЛУШАЛИ ! СПАСИБО, ЧТО ТАК ТЕРПЕЛИВО МЕНЯ СЛУШАЛИ !