Скачать презентацию Evidence of non-random mutation rates suggests evolutionary Скачать презентацию Evidence of non-random mutation rates suggests evolutionary

Non-random mutation rate.ppt

  • Количество слайдов: 10

 «Evidence of non-random mutation rates suggests evolutionary risk management strategy» (Доказательство неслучайного уровня «Evidence of non-random mutation rates suggests evolutionary risk management strategy» (Доказательство неслучайного уровня мутаций позволяет предположить эволюционную стратегию риск-менеджмента) I. Martincorena et al. , Nature, 2012

Управление рисками, рискменеджмент (англ. risk management) — процесс принятия и выполнения управленческих решений, направленных Управление рисками, рискменеджмент (англ. risk management) — процесс принятия и выполнения управленческих решений, направленных на снижение вероятности возникновения неблагоприятного результата и минимизацию возможных потерь, вызванных его реализацией. 2

§ § § >120. 000 SNP 34 штамма E. coli 3. 420 генов-ортологов (BLAST-hit) § § § >120. 000 SNP 34 штамма E. coli 3. 420 генов-ортологов (BLAST-hit) 1. Multiple alignment 2. Multiple phylogenetic filters § 2. 930 генов 3. θs values θs – within-species synonymous diversity 3

θs – within-species synonymous diversity 4 θs – within-species synonymous diversity 4

На θs могут влиять: § Частота мутаций § Отсекающий (отрицательный) отбор – предпочтительное использование На θs могут влиять: § Частота мутаций § Отсекающий (отрицательный) отбор – предпочтительное использование кодонов 5

CUB – codon usage bias (предпочтительное использование кодонов) γ – коэффициент отбора 6 CUB – codon usage bias (предпочтительное использование кодонов) γ – коэффициент отбора 6

На θs могут влиять: § Частота мутаций § Отсекающий (отрицательный) отбор – предпочтительное использование На θs могут влиять: § Частота мутаций § Отсекающий (отрицательный) отбор – предпочтительное использование кодонов § Стабильность фолдинга м. РНК на 5’концах генов 7

8 8

9 9

10 10