Dispositif INRA et partenaires d UMR en Santé Animale

Dispositif INRA et partenaires d’UMR en Santé Animale Réseau Français de Santé Animale Groupe miroir de la Technical Platform for Global Animal Health Alfort-Afssa 29 Octobre 2007 Une communauté scientifique pour la recherche en santé animale et santé publique vétérinaire Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 1

INRA et partenaires académiques et de formation un envionnement scientifique en structuration dans un contexte compétitif Évolution (lente) de l’organisation de la recherche en France • Concentration des organismes, identification des Instituts finalisés • Rapprochement Recherche / Formation supérieure • Agences (ANR, AERES, ANI) Préservation des missions et spécificité des structures • Au niveau des entités de recherches : les Unités Mixtes de Recherche • Au niveau régional, les pôles : PRES, pôles de compétitivité, pôles DGER • Au niveau national : les réseaux et la répartition des clusters • Au niveau international : Les outils européens dont les TP, Ne. O, etc. . • La tétrapartite (INRA, USDA-ARS, BBSRC, AAF Canada), • CGIAR et réseaux internationaux CIRAD, rapprochement INRA-CIRAD Domaine agronomique Des recherches finalisées, recherches d’amont et d’aval construites sur l’identification de demandes sociétales, et en partenariat académique, régalien et professionnel Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 2

Structuration de la recherche publique en santé animale en France 2008 Département Santé Animale (+MICA) Recherche 80 INRA Formation pour/à la recherche 180 ENVs 20 100 CIRAD AFSSA Surveillance et AST Evaluation du risque Développement Une répartition des mandats mais une communauté scientifique de plus en plus inter connectée en recherche Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 3

Les partenaires départements Principales tutelles Ministère de la Recherche, Ministère de l’Agriculture (ministère des affaires étrangères - CIRAD), ministère de la santé (Afssa) Les principaux acteurs et partenaires INRA (Départements SA, MICA), ENVs (DGER), CNRS, CIRAD, AFSSA, Universités, Hôpitaux Organismes dédiés à d’autres domaines concernant la Santé Animale : génétique, génomique, physiologie, systèmes de production, clinique, alimentation humaine, sécurité environnementale, économie Département Santé Animale et Microbiologie de la chaîne alimentaire Autres partenaires sur champs spécifiques : ENVs, CIRAD Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 4

Département INRA : une structure ouverte et un mode de fonctionnement partagé Département Santé Animale Un « Board » constitué de collègues différents organismes : INRA, ENVs, AFSSA (Aumont, Benmansour, Boireau, Toutain, Seegers), à terme CIRAD Un conseil scientifique (stratégie, recrutement, évaluation collective), où sont représentés de nombreux partenaires de différentes origines institutionnelle et géographique INRA (SA, MICA, PHASE, GA), ENVs (toutes) CIRAD, AFSSA, CNRS, Inserm, CEA, DGAl, DGER, CGV, GTVD, AFSSA, Universités, Hôpitaux Un staff scientifique très partagé entre différents organismes : Unités mixtes de Recherches, Unités sous contrats : ENV, CNRS, Universités, CIRAD, AFSSA Un GDR en maladies infectieuses animales INRA CIRAD Volonté d’ouverture et de transparence sur nos exigences scientifiques garantes de la flexibilité Une communauté scientifique pour la recherche en Santé Animale et la Santé Publique Vétérinaire Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 5

Répartition des scientifiques et ingénieurs en postes dans les unités pilotées par le DSA (+ MICA) Scientifiques et ingénieurs en postes : 360 ENVs (27%) INRA (51%) Universités AFSSA CIRAD : 4 % CNRS Autre Inserm Hôpitaux 30 ETP chercheurs en CDD 75 Doctorants (Ph. D) en postes Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 6

Agents permanents (en ETP) dans les unités pilotées par le DSA (+ MICA) 350 300 250 65 112 200 Non INRA 150 INRA 100 247 174 50 0 Scientifiques et ingénieurs 266 Techniciens & Administratifs 312 Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 7 Tous corps 578

Missions du Département SA (+ MICA) 1 – Connaissances pour des méthodes de prévention, de contrôle et d’estimation de l’impact des maladies des animaux d’élevage en vue d’améliorer la compétitivité des filières ; 2 - Contribuer à la santé des consommateurs et des populations par l’appréciation, puis la prévention des risques infectieux et toxiques, alimentaires et environnementaux ; 3 - Participer à l’analyse du risque et à l’appui à la décision publique dans le domaine de la santé publique vétérinaire ; 4 - Accroître la cohérence de l’ensemble du dispositif national de recherche en santé animale (comprenant en particulier la formation par/pour la recherche); Des recherches finalisées, sur le long terme, d’amont et d’aval construites sur l’identification de demandes sociétales, en partenariat académique, régalien, industriel et professionnel Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 8

« Guidelines » stratégiques ØExcellence scientifique basée sur de compétences disciplinaires coordonnées et regroupées dans des unités ou des équipes fondées sur des questions biologiques plus que des maladies. Le département assure coordination et transversalités ØThématiques sans limite de liste : maladies modèles mais aussi maladies pandémiques, réglementées, zoonotiques émergentes ou récurrentes. Choix « raisonné » et collectif sur la base de collaborations scientifiques (public, privé) et de pertinences scientifique et sanitaire ØOutils de la biologie moderne à haut débit, « *omics » et biologie structurale (à terme l’imagerie pour l’étude des processus infectieux et toxiques). Continuum allant de la biologie structurale à la modélisation épidémiologique ØMicrobiologie cellulaire, virologie, parasitologie moléculaire et cellulaire, immunologie générique, immunopathologie, génomique animale, pharmacologie, toxicologie des faibles doses et de la chronicité , épidémiologie et modélisation épidémiologique Méthodes de maîtrise variées : vaccins, pharmaceutique, résistance, systèmes d’information pour l’aide à la décision (épidémiologie) Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 9

Schéma Stratégique : actions Ø Renforcer des entités (têtes de réseau ou pôles) ayant une identité lisible et reconnue (Virologie francilienne, Pôle santé animale de Tours, pôle de Pharmacologie et toxicologie animale de Toulouse), structuration d’équipes Ø Équilibrer les collaborations avec l’AFSSA et le CIRAD, le CNRS et les universités tout en consolidant le partenariat consubstantiel avec la DGER Ø Renforcer les relations avec les gestionnaires du risque (DGAL, OIE), avec les partenaires de la société civile (filières) et industrie (innovation, R&D, Lyon biopôle) Ø Améliorer, mettre aux normes, ouvrir et partager nos dispositifs Ø Veille stratégique, communication, information (domaines embryonnaires de l’organisation des départements) Ø Politique plus construite à l’international (Global Animal Health, 7 ième PCRD, SCAR, ERA Net, labo bi-nationaux) Réseau français en santé Animale : une suite logique et naturelle de la stratégie déclinée depuis 7 années Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 10

Les compétences du DSA (+MICA) ( 01/01/08) Gestion Département SA INRA Non INRA Plate formes et logistiques Modèles animaux et pathologie comparée Pharmacologie Toxicologie Épidémiologie Maladies vectorisées par les arthropodes Parasitologie Immunologie Maladies bactériennes (hors ABD) Virologie (hors épidémiologie) Prions, TSE (hors épidémiologie) 0 10 20 30 40 Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 11 50 60 70 80 90

Les compétences du DSA (+MICA) ( 01/01/08) Immunologie Maladies bactériennes (hors ABD) Parasitologie Maladies vectorisées Épidémiologie Pharmacol. -Toxicol. Animaux modèles & pathologie comparée Virologie (hors épidémiologie) Prions, TSE (hors épidémiologie) Plate formes & logstique Gestion Animal Health Division Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 12

Périmètre des recherches de l’INRA et de ses partenaires d’UMR ØTous les agents infectieux et toxiques, xénobiotiques d’intérêt en santé animale, troubles locomoteurs des chevaux ØTous animaux de production (comprenant les poissons et les chevaux) Ø Animaux de compagnie avec les ENVs uniquement dans des problématiques de santé publique (toxicologie, zoonoses) ØAnimaux modèles : biologie fondamentale, modèles de pathologie humaine (en général étudié avec les ENVs) : myopathie, cancers, maladies de la pléthore et de la longévité (diabète, artériosclérose, dégénérescence maculaire, etc…) ØMéthodes de contrôle : innovation en diagnostic, vaccins, méthodes de prévention, thérapeutiques et usage des médicaments ØBien être et souffrance : Département PHASE Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 13

Structures: 3 UR, 12 UMR, 3 USC, 1 UG, 01/01/08 Nat. Vet. Sch. Alfort Animal Health Centre, Tours JRU BIPAR (Univ, AFSSA, NVS, INRA) helminths, protozoa, fungi, arthropod borne disease JRU Virology (AFSSA, NVS, INRA) emerging and zoonotic vrus JRU BPLC (INRA NVS) : Equine Locomotors Pathology RU IASP: Virus, prions, bacteria, parasites, Zoonoses, immunology, infection & immunity, pathology JRU IPV (Univ) : Immunology, vaccine, Toxoplasma Jouy en Josas Nat. Vet. Sch. Nantes JRU BIOEPAR (INRA-NVS) -GSA : epidemiology, economy - CAE : antibiotics & aqua Env. Nantes - IHPM: parasites, ticks, ABD JRU IECM : Diabet & immunity JRU DPTM : Geno-therapy, myopathy, anatomy and pathology Alfort Jouy-Gif Tours JRU GDPP (BCU SA) Univ INRA Mycoplasms of man & animals Nat. Vet. Sch. Toulouse RU Phlebotomes (Univ), vector of Leishmanii LYON, Gerland, N. V. Sch. Bordeaux Theix Bordeaux Reims RU VIM : Mol virology, immunol. , prions, fish pathology UMR 1157 VMS (INRA CNRS) : Structural virology Lyon Montpellier Toulouse JRU RPC (Univ, INRA, NVS, EPHE): Lentivirus JRU MTCX (NVS, INRA): Mycotoxins , rodenticids Theix RU Epi. A: Epidemiology, emerging dis. RU Mic (MICA): Dig. bacteria, E coli Montpellier CIRAD BCU-UR 5: Tropical infectious Centre of toxicology diseases, arthropod borne disease RU PT: pharmacology, toxicology, mycotoxins JRU PTE (INRA NVS): Pk/Pd, Physio- Tox JRU IHAP (INRA, NVS): Infection and immunity, TSE, Virus(pox), Mycoplasm, parasites, E coli Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 14

Virus et maladies virales, thématiques Jouy en Ile de France Coordination par tête de réseau. Josas, INRA immunology RU VIM : Mol virology, Nat. Vet. Sch. Alfort JRU Virology (AFSSA, NVS, INRA) Respiratory Virus (RSVB, IA) Birnavirus, Viruses of fish, Integrative virology of PRV réponses de l’hôte, Structural biology of viruses INRA AFSSA CIRAD Adenovirus, vaccine vectors Emerging and zoonotic virus (Borna virus, hep E) National reference lab (SVD, FMDV, BTV, WNV, aussi Influenza aviaire, comprenant … programme agro vétérinaire DGAl Gif. Yvette, CNRS Lentivirus, Cae. V, Vm. V, JSRV, IAEV. RU VMS (Univ) Structural virology (rhabdo, alph, a Phage) Alfort Herpes virus : Mareck VD, Aujesky Virus, simplex virus Rotavirus, herpes virus Jouy Gif Maladies virales émergentes (FMD, Borna. Methodology in structure Virus, West Nile Animal Health Centre, Tours RU Hepatite E, avec AFSSA) IASP LYON, Gerland Avian Virology (MDV, IA) JRU RPC (Univ, INRA, NVS, EPHE): Rotavirus, flavivirus Lentivirus, WNV Lyon international network Virologie structurale (rhabdovirus, bacteriophage, VSV, on Lentivirus etc. . ) Montpellier Nat. Vet. Sch. Toulouse RSV, BTV : vaccinologie JRU IHAP (INRA, NVS): Toulouse Pox virus, vaccine vectors virus, vectorologie Adenovirus, pox Montpellier CIRAD Emerging viruses in web footed Virus from the souths Maladies virales des poissons : NHI (Rhabdovirose), SHV, ASF IA, PPRV, paramyxovirus, Maladie du sommeil et maladie pancréatique Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 15

Prions, maladies à prions Jouy en Josas, INRA RU VIM : Mol virology, immunology Nat. Vet. Sch. Alfort JRU Virology (AFSSA, NVS, INRA) Prions strain diversity Cell models, transgenic animal models Maintenir la vigilance Physiopathology Strain diversity Biophysic and structural biology of Pr. P BSE, tremblantes, cas atypique Alfort Animal Health Centre, Tours Jouy Déterminants structuraux et moléculaires Genetic basis and physiopathologic impact Tours Physiopathologie Theix, BSE, scrapies RU Epid. A) Animal experimentation Epidemiology Épidémiologie Theix RU IASPETIC Nat. Vet. Sch. Toulouse JRU IHAP (INRA, NVS): Physiopathology Impact of Genetic selection Scrapies in sheep and goat Diagnostic Toulouse Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 16

Bactéries, maladies bactériennes, thématiques Animal Health Centre, Tours Résistance aux antibiotiques, génomique RU IASP: Nat. Vet. Sch. Alfort Salmonella (carriage), E coli (avian) Mycobacterium avium paratuberculosis Antibiotic resistance Mammites (staphylococcus) Coxiella, chlamydia, Brucella, Listeria E coli (EPEC, EHEC, . . ), EJRU BIPAR (Univ, AFSSA, NVS, INRA) Bartonella coli aviaires Jouy en Josas Mycobacterium avium paratuberculosis (réponse RU VIM immune, diversité, virulence) Flavobacterium, bactérioses des poissons Alfort Bartonella (virulence, diversité), Ehrlishia Nat. Vet. Sch. Nantes Jouy-Gif Reims JRU (INRA-NVS) BIOEPAR Nantes Tours Salmonella (portage, virulence) Antibiotic resistance, epidemiology Theix JRU (INRA-NVS) SECALIM RU Mic (MICA): Dig. bacteria, E coli Mammites (staphylococcus) Campylobacger resistance Montpellier CIRAD Mycoplasmes (diversité, virulence, génomique) INRA Bordeaux Theix Lyon BCU-UR 5: CIRAD Bordeaux AFSSSA ENVs Erhlischia, arthropod borne disease Montpellier JRU GDPP (BCU SA) Univ INRA Mycoplasms of man & animals Maladies bactériennes. Toulouse des poissons, génomique Nat. Vet. Sch. Toulouse Centre of toxicology Flavobacterium JRU PTE (INRA NVS): antibiotic resisitance JRU IHAP (historique) Listeria, Brucella, Coxiella, Chlamydia(INRA, NVS): Infection & immunity, Mycoplasm, E coli Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 17

Immunologie, immunopathologie Animal Health Centre, Tours RU IASP, JRU IPV Nat. Vet. Sch. Alfort JRU Virology (AFSSA, NVS, INRA), JRU BIPAR • porcs, poule-palmipèdes, Espèces cibles : ruminants, Vaccine responses (adenovirus vectors, BTV, Trichinella) poisson … • Avian immunology ( IA) • Swine immunology • Immunology of the young • Digestive mucosal immunity • Immunopathology of mastitis • Immunopathology of MAP • Vaccine against Toxoplasma • Vaccine against different bacteria (Brucella, Coxiella) Jouy en Josas, INRA RU VIM : Mol virology, immunology response to virus Inflammation et immuno-pathologie • Systemic immunity (respiratory) • Mucosal Alfort • Fish immunity Jouy Immunologie comparée et modèles (souris, Zebra) • Comparative immunity Tours Immunologie des muqueuses (digestives et respiratoires) Immunologie de la mamelle Immunologie du jeune Montpellier Nat. Vet. Sch. Toulouse JRU IHAP (INRA, NVS): Immuno-modulation : probiotiques, arthropodes Montpellier CIRAD • Pox virus, vaccine (BTV) Toulouse Immunomodulation response to • Genetic variability of animal Vaccinologie, induction, vectorisation, délivrance by arthropod pathogen tansmitted response to mastitis & nematodes Vaccine PPCB, PPR Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 18

Parasites, maladies parasitaires, thématiques Thématique en « renaissance » Nat Vet Sch. Alfort • Ecology and genomics of nematodes, JRU BIPAR limitation du nombre de modèles virulence, anthelmintic resistance Animal health Centre, Tours RU IASP, JRU IPV • Metabolism of anthelmintics in parasites • Genomics of Eimeria • Interactions Poultry - Eimeria and control • Vaccine control of Toxopasma Protozoaires • Diagnostic, diversity, virulence of parasites of interest for food and water safety (Trichinella, Toxoplasma, Cryptosporidum) • Physiopathology of Aspergillosis Coccidioses aviaires Reims Alfort Tours Toxoplasma gondii Nantes Histomonas (en fermeture) Theix Lyon Protozoonoses hydriques et alimentaires : Gardia, Cryptosporidia, Trichinella, avec AFSSA Toulouse transmises par les tiques) Babesia (avec maladies Montpellier Toulouse, résistance Trichostrongylidae : génomique, virulence, Nat. Vet. Sch. Toulouse JRU PTE (INRA, NVS), RU PT • Pk/Pd, Metabolism of génétique, résistance aux anthelminthiques anthelmintics, and resistance Aspergillose aviaire Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 19

Maladies transmises par les arthropodes Nat Vet Sch. Alfort JRU BIPAR Thématique nouvelle, base essentielle des liens avec le • Tick transmission competence • Bartonella Montpellier) CIRAD (réseau • Biology and genetics of Babesia INRA ENVs, vectopôle genomics Nat. Vet. Sch. Nantes, INRA JRU BIOEPAR (previously IHPM) • Population dynamics and ecology of tick population (Ixodes Tours Maladies transmise par les Alfort Reims tiques Ixodes, amblyoma, Bartonella, Babesia, Ehrlishia Nantes Theix University of Strasbourg and Reims Génomique vecteur, génomique agents pathogène • Phlebotoms ecology and populations dynamics INRA transmis, écologie, épidémiologie RU, Epi A • Epidemiology of arthropod Fièvre catharale Borne disease (Ticks, Chik, BTV) ovine : Entomologie, épidémiologie, Toulouse Montpellier virologie, vaccinologie, insecticide, Montpellier CIRAD (USC CIRA/INRA) Arthopod Borne disease (cowdriosis) Toulouse, Nat. Vet. Sch. Toulouse Phlébotomes BTV JRU PTE (INRA, NVS), RU PT • Insecticides Immunomodulation of host responses Dynamics of arthropod populations Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 20

Pharmacologie et toxicologie Pharmacologie vétérinaire (Pk/Pd) contaminant de la chaîne alimentaire, faibles. Vet Sch. Lyoncontamination Nat doses, Nat. Vet. Sch. Nantes, INRA chronique, contamination JRU MTCX multiple JRU BIOEPAR (previously CAE) • Pk/Pd of antibiotics in fish • . Spreading antibiotics in the environments • Mycotoxins transport in tissue and cell • Ecotoxicology (rodenticides and genetic resistance of rodents to AVKs Résistance aux antibiotiques et antiparasitaires, pharmacologie Endectocides : relation devenir / efficacité / résidus / déterminants de la pharmacocinétique (transporteurs, lipoprotéines) chez petits ruminants Nantes Fipronil : devenir et perturbation endocrinienne chez le rat et le mouton, transcriptomique chez la souris INRA Toulouse • Nat. Vet. Sch. Toulouse réponse du nuisible, résistance génétique Rodenticides : UR PT • JRU PTE (INRA, NVS): • Anthelmintics pharmacology and Lyon • Modelling in pharmacology, Pk metabolism Fumonisine B 1, Penicillium, Zéaralénone : devenir et impacts chez le Pd • Mycotoxins : metabolism, distribution porc • Pharmacology an antibiotics and impacts resistance • Trichothécènes (DON) : réponse immunitaire du. Food contaminants, endocrine porc, • Insecticides disruptors transports • Food contaminants, endocrine transmembranaires Toulouse • Integrative toxicology : molecular and metabolism, endocrine disruptors cellular impacts of contaminants Patuline et toxines d’A. fumigatus : toxinogenèse moléculaire INRA Human Nutrition Division Perturbateurs endocriniens ou métaboliques contaminants de la chaîne alimentaire : mycotoxines, plastifiant, bisphénol A, polybromés Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 21

Epidemiologie Domaine en émergence depuis 6 ans INRA Clermont - Theix Modélisation épidémiologique, vers l’économie • Assessment of health (food borne pathogen carriage) RU Epi. A Nat. Vet. Sch. Nantes, INRA JRU BIOEPAR (previously GSA) status and risk in farm animal populations. • Modelling of transmissible pathogens spread and of health disorders occurrence in farm animal populations • Economic evaluation of impacts of health disorders & economic assessment of control strategies in farm • Detection and analytical epidemiology of emerging diseases (EMERG) • Epidemiology and modelling of TSE and arthropod borne diseases • Methods in epidemiology and statistics Scrapie , BSE Arthropod borne diseases (Bartonella, WNV, BTV, CHIKV) Maldies d’élevage : BDVD, syndromes repiratoires Nantes Portage Salmonelles, Camplylobacter en filière porcine et Tours aviaire LYON, Gerland, RTRA, Nat vet Sch. Lyon Theix • Wild animals and epidemiology • Ecology and emerging diseases Résistance aux antibiotiques, diffusion dans l'environnement Lyon Zoonoses (Inf Aviaire, Coxiella, Trichinelloses, MAP) Nat. Observatoires du vivants, maladies émergentes, liens avec Vet. Sch. Toulouse JRU PTE (INRA, NVS): Montpellier Toulouse • Skills in modelling & probability faune sauvage Montpellier CIRAD • Spatio Qualification sanitaire de région ou de filièretemporal modelling Souths • Emerging diseases from the Économie de la santé (en construction) Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 22

Une politique d’ouverture des plateaux et plateformes, accès aux plateaux des «pôles» Plate forme d’expertise et de formation en anatomie pathologique Adossé à DTPTM à ENV Nantes et board européen Outils d’imagerie et de chirurgie des pôles et centres Outils « omic » des pôles INRA et génopôles (recrutement d’ingénieurs) Unités expérimentales Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 23

Dispositif expérimental: 4 UE, une connexion avec les dispositifs partenaires Centre Animal Health, Tours Nat. Vet. Sch. Alfort EU 1277 PFIE : A 2, A 3, isolators JRUs Vir-BIPAR (AFSSA-NVS), rodent, cats, dogs, A 3, A 2 All size animals (from rodent to horses JRU BPLC, CIRALE, Exp facilities of AFSSA / cattle), except pets, fish & primates INPREST National. Spécialisation et professionnalisation des UE shared plat form Jouy en Josas European (lignées tous formats, infectiologie A 2 -A 3 -Isolateurs) Network of Experimental EU UEP: fish (trout) A 2, (A 3), SPF contained capacities EU UEAR: rodents, SPF, A 2, A 3 Des investissements financiers (18 Meuros) et humains GMO, transgenesis capacities Caen Alfort Nat. Vet. Sch. Nantes aux Centre of. Restructuration et mise Jouy normes, INPREST, medical biotherapy A 2, A 3, dogs, cats, rodent recrutement et redéploiement en cadres A Tours primate Nat. Vet. Sch. Lyon Nantes Magneraud Fish experimental facilities Réseau national (Hub) pour les UE INRA JRU MTCX : wild rats, vivarium de Tours Jouy (medium-size fish) NVS Lyon “Institut Bourgelat” Ouverture à la communauté nationale et européenne Mild size animals, A 2 Bordeaux Theix Lyon Magneraud EU EASMOuverture public (PHASE Div) Alternative farming, poultry, rabbit et privé, respect de la confidentialité Projet européen des Toulouse « experimental capacities » Toulouse Tournefeuille associant l’AFSSA Nat. Vet. Sch. Toulouse JRU IHAP : Rodent, mild size animals, A 2, A 3, JRU PTE : A 1, dogs, cats, horses, insectarium, RU PT : rodents, medium-sized animals, A 2, SPF Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 24

Directoire opérationnel GIS AGENAE : ean-François BAROILLER Patrick CHARDON Claude CHEVALET Catherine CHRISTOPHE Madelaine DOUAIRE Yann GUIGUEN INRA François HATEY Patrice MARTIN Philippe MONGET Yves ROGER-MACHART Pierre SELLIER Marine LEVADOUX Bernard COUDURIER Konenraad DUHEM Bernard GUERIN Jacques LUCBERT Alain MALAFOSSE Jean-Claude MOCQUOT Michel SOURDIOUX Anne LACOSTE Jean CHAMPAGNE Thierry SIMON CIRAD-EMVT INRA-GA INRA-MIA INRA-GA PHASE INRA-GA INRA-PHASE INRA-DSAPA CIPA SYSAAF CNIEL UNCEIA IE GENE+ ITP ITAVI UNCEIA Objectifs : partenariat filières recherche • Exploiter les génomes et la génomique • Mobiliser les ressources de Bioinformatique, génomique comparée, biotechnologie • Soutiens aux programmes finalisés et génériques (ANR -Genanimal) Quelques programmes et projets • Stress chronique et pathogène en aquaculture • Sélection intense et émergence de nouveaux pathogènes (porcs) • Résistance génétique au mammites • Résistance aux maladies virales chez la truite • Gene-aviflu : réponse au vaccins • Vaccinologie contre la Blue Tongue Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 25

Le réseau AGRI-bien-être animal www. tours. inra. fr/bien-etre Ø Créé par l'INRA en 1998, regroupe les chercheurs en bien-être animal, soit – 78 INRA: dépts PHASE, GA, ALIMH, SAE 2 – 58 non INRA: universités, grandes écoles, Instituts techniques, , … Ø Objectifs – Construire une culture commune (3 séminaires/an) – Harmoniser les approches, coordonner les recherches (au départ financement de projets). –Thématiques prioritaires : comprendre les attentes sociétales, identifier les émotions des animaux, préciser les outils d'évaluation du bien-être, identifier les facteurs de variation (génétique, expérientiels), mettre au point des solutions permettant de concilier bien-être et production. – Améliorer la visibilité des recherches françaises (projets européens) – Renforcer la formation (interactions avec écoles/univ. ), le transfert des connaissances (contribution à des expertises), le dialogue sciencesociété (ouverture des séminaires) Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 26

Veterinary Research (3. 152 ) Un journal soutenu par le Département Santé Animale 3. 5 (2/128) 3. 0 Impact factor 2. 5 2. 0 (2/129) (4/123) (4/129) (6/120) (3/128) (10/127) 1. 5 1. 0 0. 5 (59/87) (33/139 (41/103) ) (24/129) 0. 0 1996 1997 1998 Veterinary Research 1999 2000 2001 Veterinary Immunology and Immunopathology Veterinary Microbiology Vaccine 2002 2003 2004 2005 2006 American Journal of Veterinary Research Veterinary Parasitology Preventive Veterinary Medicine Vet. Res. : A journal on animal infection & epidemiology Un nouveau projet d’édition basée sur l’open access et un partenariat mixte en 2009 Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 27

Un bureau de veille stratégique et scientifique Objectif Meilleure connaissance de la demande sociétale et formalisation des questions Développement du partenariat d’orientation Communication sur les produits scientifiques du Département SA (in WOS) Et autres produits de développement et de support technique Principes Définition de cibles, et construction d’outils Web spécifiques et dédiés (RSS flux) , élaboration et entretien de bases de données par des veilleurs et modérateurs Web Sites en production VERSA : veille réglementaire en expérimentation animale bio confinée, éthique Visa : outil intranet veille industrielle, l’intelligence économique et PI en santé animale et santé publique vétérinaire (brevets, , licences, entreprises, etc…) Veli. SA : Littérature francophone technique en santé animale (internet) @genda : Veille événementielle pour la recherche en santé animale Free-Archives for Veterinary Research Web sites en développement Datanet : Références d’expertises du département Santé Animale (inranet) Produits du département Santé Animale (internet) Port. SA: Portail de la santé animale en France pour le partenariat d’orientation Réseau Français en Santé Animale, 29/10/07, 28