Cистематика вирусов безпозвоночных
Alphatetraviridae Род Betatetravirus Nudaurelia capensis beta virus (NBETAV) Род Omegatetravirus Nudaurelia capensis omega virus (NOMEGAV) Хозяева – моли и бабочки Вирион не имеет оболочки. Капсид икосаэдрического типа (Т=4) размером 40 нм состоит из 240 субъединиц. Геном – несегментированный (Betatetravirus) или состоит из 2 сегментов (Omegatetravirus) линейная одноцепочечная РНК(+) 6, 5 kb. 5’конец кэпирован у Omegatetravirus, на 3’ конце т. РНК-подобная структура. Геномная РНК транслирует полипротеин, который расщепляется с образованием белков, участвующих в репликации. Капсидные белки образуются с помощью трансляции субгеномных РНК.
Carmotetraviridae Род Alphacarmotetravirus Providence virus (Pr. V) Хозяева - Чешуекрылые Вирион не имеетоболочки. Капсид икосаэдрического типа (Т=4) размером 40 нм, состоит из 240 субъединиц (каждая из 2 белков). Геном – линейная одноцепочечная РНК(+) 6, 1 kb. Геномная РНК транслирует полипротеин, который расщепляется на белки репликации и белка 130 к. Д. Капсидные белки образуются с помощью трансляции субгеномных РНК.
Metaviridae en. wikipedia. org/w/index. php? title= Errantivirus&action=edit&redlink=1 Drosophila melanogaster gypsy virus Хозяева - насекомые Semotivirus Ascaris lumbricoides Tas virus Хозяева - аскариды Metaviridae – семейство вирусов родственное ретровирусам, существуют в виде ретротранспозонов в геноме эукариот хозяина и способные реплицировать одноцепочечный РНК(+) геном через стадию ДНК. Геном содержит гены, кодирующие обратную транскриптазу, интегразу (ферменты необходимые для обратной транскрипции и интеграции с геномом хозяина) и белки капсида. В некоторых случаях вирусоподобные частицы могут быть образованы из белков капсида и оц. РНК(+) генома и поражать ранее неинфицированных клетки. Примером этих вирусов является gypsy, ретроэлемент найденный в геноме дрозофилы. Способность инфицировать другие клетки определяется наличием генов env , которые кодируют белки оболочки.
Pseudoviridae Род Hemivirus Типичный вид Drosophila melanogaster copia virus Хозяева - насекомые Вирион без суперкапсидной оболочки сферической формы. Капсид икосаэдрического типа (Т=3), диаметр 30 -50 нм. Геном – несегментированная одноцепочечная РНК (+) длиной 4, 2 -9, 7 kb интегрируется в геном хозяина. Геном кодирует РНК-зависимую ДНК-полимеразу (обратную транскриптазу) и структурные белки. Синтез РНК (+) осуществляется хозяйскими ферментами ( например, ядерной РНК –полимеразой II ) в ядре или цитоплазме.
Nodaviridae От Nodamura, поселка в Японии, где впервые был выделен No. V Alphanodavirus Nodamura virus (No. V) Хозяева - насекомые Вирион без оболочки. Капсид икосаэдрического типа (Т=3) 30 нм в диаметре, состоит из 180 субъединиц. Геном сегментированный (2 части)линейная одноцепочечная РНК (3, 1 и 1, 4 kb). 5’конец каждого сегмента кэпирован. РНК-1 кодирует РНК зависимую РНК-полимеразу, РНК-2 – капсидный белок. Субгеномная РНК-3 (транскрибируется с 3’конца РНК-1) кодирует В 1 и В 2 белки.
Permutotetraviridae Alphapermutotetravirus Thosea asigna virus (Ta. V) Хозяева – насекомые (Lepidoptera) Вирион без оболочки. Капсид икосаэдрический (Т=4) 40 нм в диаметре, состоит из 240 белковых субъединиц. Геном -линейная оц. РНК (+) 5, 6 кб. 5'-конец соединен с VPg белком, 3'-конец не полиаденилирован. Геномная РНК является матрицей для полипротеина, расщепляющегося на белки, необходимые для репликации. Субгеномная РНК является матрицей для синтеза капсидного белка и белка 17 к. Д.
Iflaviridae Iflavirus Infectious flacherie virus (IFV) Хозяева - насекомые Вирион без оболочки. Капсид икосаэдрического типа (Т=3), 30 нм в диаметре. Геном Несегментированный – линейная оц. РНК (+) 8. 8 -9. 7 kb, геномный белок VPg связан с 5' –концом, 3'-конец полиаденилирован. На 5’конце находится длинный нетранслируемый регион, содержащий внутренний сайт для посадки рибосом. Трансляция полипротеина, который расщепляется протеазами на ряд функциональных белков.
Dicistroviridae РНК содержат 2 внутренних сайта для посадки рибосом. Трансляция 2 полипротеинов, которые расщепляются протеазами на ряд функциональных белков. Aparavirus Acute bee paralysis virus (ABPV) Cripavirus Cricket paralysis virus (Cr. PV) Вирион без оболочки. Капсид икосаэдрического типа (Т=3 псевдосимметрии) диаметром 30 нм. Геном – несегментированный, линейная оц. РНК(+) 8, 510, 2 kb, 5’конец связан с VPg белком, 3’конец полиаденилированный, содержит 2 ОРС, кодирующие структурные (3 и более) и белки репликации.
Roniviridae Порядок Nidovirales Сем. Roniviridae Род Okavirus Gill-associated virus (GAV) Хозяева – ракообразные (креветки) Вирион с наружной оболочкой, палочковидной формы, размер - 150 -200 нм х 40 -60 нм. Нуклеокапсид спирального типа симметрии, диаметр 20 -30 нм. Геном – несегментированная линейная оц РНК (+) 26 kb, кэпирована и полиаденилирована. Белки, участвующие в репликации, транслируются с геномной РНК. Субгеномные м. РНК являются матрицами для синтеза структурных белков
Birnaviridae Род Entomobirnavirus Типичный вид Drosophila X virus (DXV) Хозяева – насекомые (Diptera) Вирион без оболочки, сферический, диаметром 70 нм. Капсид икосаэдрического типа (Т=13), состоящий из 260 тримеров белка. VP 2. VP 3 белок образует с РНК комплекс. Минорный белок VP 1 ковалентно связан с 5’концом генома. Геном – сегментированная (А и В сегменты размером 3, 2 -3, 5 kb) двухцепочечная РНК. Сегмент А кодирует полипротеин, который расщепляется вирусной протеазой, сегмент В – РНК зависимую РНК полимеразу.
Reoviridae Род Cardoreovirus Типичный вид Eriocheir sinensis reovirus Хозяева - крабы Вирион без оболочки. Капсид тройной, без «башень» икосаэдрического типа (внутренний капсид - Т=2, промежуточный Т=13). Геном – сегментированная (12 сегментов, общий размер генома 21 kb) двухцепочечная РНК. Каждый сегмент кодирует 1 белок.
Reoviridae Род Cypovirus (от цитоплазматический полиэдроз) Типичный вид Cypovirus 1 (CPV-1) Хозяева - насекомые Вирион без оболочки. Капсид одинарный икосаэдрического типа (Т=2) 65 нм в диаметре. Пентамерные «башни» выступают снаружи капсида. Геном сегментированный (10 сегментов размером от 1 до 4, 2 kb, общий размер генома 25 kb) двухцепочечная РНК. Геном кодирует 10 -12 белков. РНК-зависимая. РНк полимераза синтезирует кэпированные неполиаденилированные моноцистронные м. РНК с каждого сегмента.
Reoviridae Род Seadornavirus Типичный вид Banna virus (BAV) Хозяева – человек, некоторые млекопитающие, комары Вирион без оболочки 6070 нм в диаметре. Капсид тройной, без «башень» икосаэдрического типа (внутренний капсид - Т=2, промежуточный -Т=13). Геном – сегментированная (12 сегментов, общий размер генома 21 kb) двухцепочечная РНК. Каждый сегмент кодирует 1 белок.
Reoviridae Род Idnoreovirus Типичный вид Idnoreovirus 1: Diadromus pulchellus idnoreovirus 1 (Dp. IRV-1) Хозяева – насекомые (Hymonoptera) Вирион без оболочки диаметром 70 нм. Капсид двойной икосаэдрического типа (наружный Т=13, внутренний Т=2), имеются «башни» , расположенные с наружной стороны внутреннего капсида. Геном – сегментированная (1011 сегментов) двухцепочечная РНК. Общий размер генома -27 -30 kb.
Parvoviridae Подсемейство Densovirinae Род Densovirus Galleria mellonella densovirus Род Iteravirus Bombyx mori densovirus 5 Род Brevidensovirus Aedes aegypti densovirus Род Pefudensovirus Periplaneta fuliginosa densovirus Хозяева - насекомые Вирион без оболочки 18 -26 нм в диаметре. Капсид икосаэдрического типа (Т=1) состоит из 60 копий белка VP 1. Геном – линейная одноцепочечная ДНК длиной 4 -6 kb, имеет длинные инвертированные концевые повторы. Комплементарные цепочки ДНК находятся в разных капсидах. ОРС структурных и неструктурных белков локализованы на одной или обоих цепочках ДНК. Репликация происходит в ядре.
Bidnaviridae (от bisegmented ss. DNAviruses) Род Bidensovirus Типичный вид Bombyx mori bidensovirus 3 Хозяева - шелкопряды Вирион без оболочки 25 нм в диаметре. Капсид икосаэдрического типа (Т=1) состоит из 60 копий белка СР. Геном – 2 сегмента линейной одноцепочечной ДНК (6 и 6, 5 kb). Как сегменты, так и «+» и «-» цепочки содержатся в различных капсидах (4 типа частиц).
Род Ascovirus Типичный вид от греч. «asc» - мешок, ссылаясь на пузырьки вмещающие большое количество вирионов, Spodoptera frugiperda которые получаются в результате ascovirus 1 a (Sf. AV-1 a) расщепления клетки-хозяина Хозяева - совки Ascoviridae Вирион имеет наружную мембрану, кор и внутреннюю липидную мембрану. Вирион палочковидной, овоидной или аллантоидной формы шириной 130 нм, длиной 200 -400 нм соодержит не менее 15 различных белков. Геном – кольцевая двухцепочечная ДНК 156 -186 kb, содержащая два тандема инвертированных повторов.
Baculoviridae Alphabaculovirus Autographa californica multiple nucleopolyhedrovirus Betabaculovirus Cydia pomonella granulovirus (Cp. GV) Deltabaculovirus Culex nigripalpus NPV Gammabaculovirus Neodiprion lecontei nucleopolyhedrovirus Хозяева – насекомые Вирион имеет оболочку. Бакуловирусы - возбудители ядерных полиэдрозов, заключены в ядерные белковые включения типа многогранников (полиэдров) с размером от 0, 3 до 15 мкм. Возбудители гранулезов образуют внутриклеточные гранулы 300 -500 нм. Вирионы располагаются в белковом матриксе одиночно (гранулы) или группами (полиэдры). В одной группе может находиться до 20 -25 вирионов, заключённых в общую мембрану. Вирионы также могут быть и вне полиэдров. Они инфицируют соседние клетки. Геном – кольцевая двухцепочечная ДНК размером 80 -180 kb, кодирует 100 -180 белков. Репликация в ядре.
Hytrosaviridae Glossinavirus Glossina hytrosavirus (GHV) Muscavirus Musca hytrosavirus (MHV) Хозяева - Diptera Палочковидный вирион, имеющий оболочку, размером 65 -100× 550 -1000 нм , нуклеокапсид 50 нм диаметром. Геном – кольцевая двухцепочечная ДНК 120 -190 kb, содержащая 108 -160 ОРС, которые равномерно распределены в обоих цепочках ДНК.
Polydnaviridae viralzone. expasy. org/ all_by_protein/577. ht ml Cotesia melanoscela bracovirus (Cme. BV) Ichnovirus Campoletis sonorensis ichnovirus (Cs. IV) Хозяева – паразитические осы Вирион имеет оболочку, эллипсоидной формой (Іchnovirus) и цилиндрической (Вracovirus). В зависимости от вида, вирион содержит один или несколько нуклеокапсидов. Геном –сегментированный, кольцевая суперспирализированная двухцепочечная ДНК размером 2, 0 -31 kb. Каждый вириона содержит несколько копий генома. Вирус может вызвать продуктивную инфекцию либо интегрироваться в геном хозяина и реплицироваться вместе с ним.
Poxviridae Alphaentomopoxviru Amsacta moorei entomopoxvirus ‘L’ (AMEV) viralzone. expasy. org/al l_by_species/158. html Chironomus luridus entomopoxvirus (CLEV) Gammaentopoxvirus Melolontha entomopoxvirus (MMEV) Хозяева - насекомые Вирион имеет оболочку. , яйцевидной формы, 70 -250 × 350 нм размером. Существует два типа различных вирусных частиц : внутриклеточный зрелый вирус (IMV) и внеклеточный вирус в дополнительной оболочке (EEV). Геном - линейная двухцепочечной ДНК 250 -380 kb. Линейные геном фланкированный инвертированными концевыми повторяющимися последовательностями, которые ковалентно замкнуты на концах.
Nimaviridae Nima – от лат. «нить» , ссылаясь на хвостовой отросток Whispovirus White spot syndrome virus 1 (WSSV-1) Хозяева - ракообразные Вирион имеет оболочку, овоидной формы около 275 нм длиной и 120 нм шириной с хвостом на одном конце. Геном – кольцевая двухцепочечная ДНК около 300 kb, кодирующая по крайней мере 531 OРС.
Iridoviridae Iridovirus Invertebrate Иридо: от греческой богини Ирис, знак которой была радуга, ссылаясь на появление радужной окраски инфицированных iridescent virus 6 (IIV-6) беспозвоночных Chloriridovirus Invertebrate iridescent virus 3 (IIV-3) Хозяева - насекомые Полиэдрические вирионы 180 нм в диаметре. Капсид икосаэдрического типа симметрии T = 189 -217, с внутренней липидной мембраной. Вирионы снаружи окружены оболочкой , либо нет в зависимости от того, вышли они из клеточной мембраны хозяина в результате почкования или были организованы в паракристаллы в цитоплазме клетки-хозяина и освобождены в результате лизиса. Геном - линейная, двухцепочечная ДНК около 135 kb. Кодирует около 126 белков.
Скачать презентацию Cистематика вирусов безпозвоночных Alphatetraviridae Род Betatetravirus Nudaurelia
Cистематика вирусов безпозвоночных.ppt