Скачать презентацию Базы данных Аминокислотные базы данных http Скачать презентацию Базы данных Аминокислотные базы данных http

Базы данных.pptx

  • Количество слайдов: 6

Базы данных Базы данных

Аминокислотные базы данных • http: //web. expasy. org/docs/swissprot_guideline. html • http: //www. genome. jp/kegg/pathway. Аминокислотные базы данных • http: //web. expasy. org/docs/swissprot_guideline. html • http: //www. genome. jp/kegg/pathway. html

Генные базы данных • Genebank – американская база данных, http: //www. ncbi. nlm. nih. Генные базы данных • Genebank – американская база данных, http: //www. ncbi. nlm. nih. gov/pubmed/ • Ensembl – европейская база данных, http: //www. ensembl. org/index. html • http: //www. jcvi. org/cms/home/ • http: //www. genecards. org • http: //sci-hub. org

Подбор праймеров 1. Участки, которые содержат одинаковое число пуриновых (G, C) и пиримидиновых оснований Подбор праймеров 1. Участки, которые содержат одинаковое число пуриновых (G, C) и пиримидиновых оснований (A, T) 2. Без повторов одного основания более 1 -2 раз 3. Должны заканчиваться на пуриновые основания (G, C) 4. Не содержат комплементарных себе последовательностей 5. Два праймера не должны быть комплементарны другу

Параметры праймеров 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. Размер PCR-продукта: 50 -200 нп. Параметры праймеров 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. Размер PCR-продукта: 50 -200 нп. Температура плавления: 58 -65 OC. Длина праймера: 20 -30 нп. GC состав: ~40 -60%. Вторичная структура: по минимуму. Димеры: нет. Минимум G/C на 3' конце праймеров (не более трех из пяти последних нуклеотидов).

Программы для подбора праймеров • http: //www. bioinformatics. nl/cgibin/primer 3 plus. cgi/ • http: Программы для подбора праймеров • http: //www. bioinformatics. nl/cgibin/primer 3 plus. cgi/ • http: //primer 3. ut. ee/ • http: //www. genebee. msu. su - Ali. Bee - Multiple alignment Release 2. 0 • http: //www. idtdna. com/calc/analyzer • http: //www. basic. northwestern. edu/biotools/oli gocalc. html - Oligo calculator: oligonucleotide properties calculator • http: //www. frodo. wi. mit. edu