Базы данных Аминокислотные базы данных http

Зарегистрируйтесь, чтобы просмотреть полный документ!

Базы данных

Аминокислотные базы данных • http: //web. expasy. org/docs/swissprot_guideline. html • http: //www. genome. jp/kegg/pathway. html

Генные базы данных • Genebank – американская база данных, http: //www. ncbi. nlm. nih. gov/pubmed/ • Ensembl – европейская база данных, http: //www. ensembl. org/index. html • http: //www. jcvi. org/cms/home/ • http: //www. genecards. org • http: //sci-hub. org

Подбор праймеров 1. Участки, которые содержат одинаковое число пуриновых (G, C) и пиримидиновых оснований (A, T) 2. Без повторов одного основания более 1 -2 раз 3. Должны заканчиваться на пуриновые основания (G, C) 4. Не содержат комплементарных себе последовательностей 5. Два праймера не должны быть комплементарны другу

Параметры праймеров 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. Размер PCR-продукта: 50 -200 нп. Температура плавления: 58 -65 OC. Длина праймера: 20 -30 нп. GC состав: ~40 -60%. Вторичная структура: по минимуму. Димеры: нет. Минимум G/C на 3' конце праймеров (не более трех из пяти последних нуклеотидов).

Программы для подбора праймеров • http: //www. bioinformatics. nl/cgibin/primer 3 plus. cgi/ • http: //primer 3. ut. ee/ • http: //www. genebee. msu. su - Ali. Bee - Multiple alignment Release 2. 0 • http: //www. idtdna. com/calc/analyzer • http: //www. basic. northwestern. edu/biotools/oli gocalc. html - Oligo calculator: oligonucleotide properties calculator • http: //www. frodo. wi. mit. edu

Скачать презентацию Базы данных Аминокислотные базы данных http

Базы данных.pptx

Количество слайдов: 6