14. Чужий серед своїх. Ендогенні ретровіруси – невід’ємний елемент геномів ссавців. Зважаючи на те, що це чужорідна генетична інформація, поясніть, чому організми утримують у своєму геномі такі елементи впродовж значного еволюційного періоду. Чужий серед своїх
Реплікативний цикл ретровірусів
Геном ретровірусів (на прикладі Moloney murine leukaemia virus )
Endogenous Retroviruses World (after Jern P, Sperber GO, Blomberg J, 2005)
Human genome structure (Vincent Racaniello, 2014)
Інтеграція – неспецифічна, але негативний добір при дизруптивній інтеграції
Cost-benefit balance Білки продукти еногенних ретровірусів можуть відігравати роль у нормальному розвитку (синцитин) ЕРВ можуть зумовлювати резистетнтність проти екзогенних ретровірусів ЕРВ походження елементи контролю транскрипції(промотори, енхансери) можуть регулювати експресію генів хазяїна (амілаза в слинних залозах, GTAp63 ): ЕРВ можуть забезпечувати альтернативні сайти поліаденілювання та сплайс-сайти, альтернативні стоп-кодони Гомологічна рекомбінацію із LTR – одне із джерел мінливості геному
Different effects of retroviral regulatory sequences on viral and host RNA expression
Синцитин – глікопротеїд ретровірусного походження, необхідний для утворення синцитіотрофобласта
Метилювання de novo і підтримка метилювання для сайленсингу ендогенних ретровірусів
piRNAs control ERV
Transcriptional silencing induces by piRNA
References Jonathan P. Stoye - Studies of endogenous retroviruses reveal a continuing evolutionary saga 2. Konstantin Khodosevich, Yuri Lebedev and Eugene Sverdlov - Endogenous retroviruses and human evolution, 2002 3. Reinhard Kurth and Norbert Bannert - Beneficial and detrimental effects of human endogenous retroviruses M. Rowe, Didier Trono - Dynamic control of endogenous retroviruses during development Helen Robert J. Ross1, Molly M. Weiner1 & Haifan Lin1 - PIWI proteins and PIWI-interacting RNAs in the soma 6. Endogenous Retroviruses and the Human Genome: Implications for Human Disease. Tara Donovan
An integrated provirus can have five possible fates [2,11]: it can serve as a source for infectious virus; it can evolve to give rise to a viral genome that amplifies itself solely intra-cellularly; it can decay into junk DNA; it can undergo recombination between the LTRs to leave a solo LTR; or it might contribute a gene that can have a physiological function in the host