14 607 21 0068 от 23 сентября

Зарегистрируйтесь, чтобы просмотреть полный документ!

№ 14. 607. 21. 0068 от 23 сентября 2016 г Федеральная целевая программа «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2014— 2020 годы» Приоритетное направление: Науки о жизни Программное мероприятие: 1. 2 Проведение прикладных научных исследований для развития отраслей экономики Соглашение № 14. 607. 21. 0068 от 23 сентября 2016 г. на период 2014 - 2016 гг. Тема: Разработка панели биомаркеров злокачественной трансформации предстательной железы для проведения ранней неинвазивной диагностики заболевания Руководитель проекта: д. б. н. , академик РАН Говорун В. М. Получатель субсидии Федеральное государственное бюджетное учреждение Федеральный научно-клинический центр Физико-химической медицины Федерального медико-биологического агентства России Индустриальный партнер Общество с ограниченной ответственностью Лаборатория «Литех» http: //www. lytech. ru/ Основной вид деятельности - научные исследования, направленные на разработку новых технологий для генодиагностики, клинической микробиологии, диагностики социально-значимых заболеваний человека, основанных на методах масс-спектрометрии и ПЦР Роль в проекте – софинансирование разработки, разработка производственных регламентов и постановка на производство готовых решений Ожидаемые результаты проекта 1. Экспериментальные образцы аналитической тест-системы для диагностики опухолей предстательной железы, включающие: 1. Набор реагентов для пробоподготовки и выделения РНК из осадка мочи (КРП 1) 2. Набор реагентов для проведения ПЦР в режиме реального времени (МРП 4) 2. Лабораторный регламент изготовления аналитической тест-системы 3. Проект инструкции по применению аналитической тест-системы 4. Проект технического задания на проведение ОТР по теме «Создание метода мониторинга больных со злокачественной трансформацией предстательной железы при проведении ранней неинвазивной диагностике заболевания Цели и задачи проекта Цель - создать аналитическую тест-систему на основе РНК биомаркеров для диагностики или типирования рака предстательной железы. Задачи 1. Провести массированное чтение геномов, экзомов, анализ метиломов, транскриптомов и протеомов опухолей предстательной железы 2. Выявить набор РНК биомаркеров, биомаркеров метилирования, мутационных и протеомных биомаркеров рака предстательной железы. 3. На основе подобранных биомаркеров разработать аналитическую систему, позволяющую выделять РНК из мочи и проводить диагностику рака предстательной железы Перспективы практического использования Имеющиеся в настоящее время скриннинговые диагностические решения для рака простаты (ПСА крови, ПРИ) имеют неудовлетворительные чувствительность и специфичность, так как дают большое количество ложно-положительных результатов при последующей трансректальной диагностической биопсии. Поэтому малоинвазивные диагностические решения при раке простаты являются чрезвычайно актуальными. В настоящее время в мире одобрено только одно малоинвазивное решение с удовлетворительной специфичностью – детекция ПСА 3 в моче тестом Progensa от компании Hologic. Поэтому разрабатываемое диагностическое решение является в достаточной степени уникальным и востребованным в практическом здравоохранении. В перспективе оно способно сократить в несколько раз количество ненужных биопсий для диагностики рака простаты. Текущие результаты проекта Общие и уникальные для 4 -х типов биомаркеров гены. 1 – РНК 2 -эпигеномные 3 -протеомные 4 -геномные. Корреляция результатов анализа экспрессии РНК в проекте TCGA и текущем проекте. № 14. 607. 21. 0068 от 23 сентября 2016 г 1. Проведено секвенирование экзомов и экзомных панелей 400 образцов рака предстательной железы, а также группы контроля с аденомой и без рака простаты. Было выявлено 1823 нон реф основания в 770 генах анализируемых образцов, при этом частота их присутствия в генах не отличается в раковых и не раковых образцах. 2. Проведено исследование протеома 50 образцов раковых тканей простаты , а также группы контроля. При анализе протеомных маркеров всего удалось достоверно оценить представленность белков 2679 генов. Из них у 93 наблюдается достоверное различие (pзначение <= 0. 05) представленности соответствующего белка в раковой и контрольной тканях. 3. При анализе метилома был проведен отбор участков из группы 21610 дифференциально гиперметилированных Cp. G сайтов. Итоговый список Cp. G сайтов, кроссвалидированных по независимому массиву образцов от TCGA, составил шесть Cp. G сайтов. Находятся они в генах LRRC 17, LRRC 18, KCNJ 3, ZIC 5, PON 3. Однако валидация данных сайтов методом секвенирования по Сэнгеру не показала воcпроизводимости чиповых результатов по всем генам, за исключением 2 -х сайтов метилирования в генах KCNJ 3 и ZIC 5. 4. Анализ дифференциально экспрессированных генов показал, что 6296 генов являются достоверно дифференциально экспрессированными, из которых были отобраны 35 таких генов, из которых 8 подтвердили свою потенциальную диагностическую маркерность по данным литературы. Все 8 маркерных генов были проверены при разработке аналитической тест системы, и из 3 -х, показавших наилучшую диагностическую чувствительность и специфичность, и был составлена итоговый набор МРП 4. 5. Разработан набор КРП 1 для выделения РНК из мочи.

Скачать презентацию 14 607 21 0068 от 23 сентября

499c88c2505a358378c9013de6008550.ppt

Количество слайдов: 1