Памяти Александра Семёновича Саенко посвящается. Принципиальная схема Уотсона-Крика.

Памяти Александра Семёновича Саенко посвящается

Принципиальная схема Уотсона-Крика

Джон Кэйрнс

Белки, участвующие в репликации ДНК, и функциональные связи между ними

Схема репликации ДНК

Схема репликации ДНК

B I Sinzinis, G B Smirnov, A S Saenko Repair deficiency in Escherichia coli UV-sensitive mutator strain uvr502. Biochemical and Biophysical Research Communications 08/1973; 53(1):309-16. Synzynys BI, Il'ina TP, Smirnov G.B., Saenko AS Degradation, synthesis and reparation of the DNA in cells of E. coli UVR 502 following UV irradiation. Radiobiologiia 1974 Jan-Feb; 14(1):13-20

Saenko AS, Synzynys BI, Smirnov GB Study of the ability of a DNA polymerase mutant E. coli K12 pol A1 for elimination of single-stranded breaks in DNA caused by methyl methanesulfonate. Mol Biol 1972 Sep-Oct; 6(5):526-32

Smirnov GB, Filkova EV, Skavronskaya AG, Saenko AS, Sinzinis BI. Loss and restoration of viability of E. coli due to combinations of mutations affecting DNA polymerase I and repair activities. Mol Gen Genet. 1973 Mar 1;121(2):139-50.

Доменная с труктура ДНК-полимеразы I E.coli. A – взаимное расположение доменов. I – 5’-нуклеазный домен, II – (3’5’)-экзонуклеазный домен, III – ДНК-полимеразный домен. Стрелка соответствует кленовскому фрагменту ДНК-полимеразы I. B – мотивы полимеразного домена, консервативные среди бактериальных ДНК-полимераз I. Эти мотивы имеют следующие консенсусные последовательности: 699hhhhDhhxEhx712 (A), 754RpxxKxxxhGhhY766 (B) и 876hhxhHDЕhxxЕ888 (С) - , где h – гидрофобный остаток, х – произвольный остаток, р – преимущественно R (нумерация остатков ДНК-полимеразы I E. coli)

1. Определить сравнительную чувствительность мутанта и дикого типа к новобиоцину. 2. Определить возможность и частоту мутаций устойчивости к новобиоцину у бактерий мутанта и дикого типа. 3. Сравнить локализацию мутаций к новобиоцин-устойчивости в бактериях мутанта и дикого типа.

E. сoli K12 AB 1157 дикий тип

E. сoli K12 AB 2463 recA13 (мутант АВ 1157)

Кривые УФ-инактивации NovR мутантов recA мутанта АВ2463 recA Дикий тип Мелк. Крупн.

1. Какое отношение имеет АТФ-аза, обслуживающая субъединицу А ДНК-гиразы, к жизнеспособности мутанта recA? и 2. Как может мутация к NovR повлиять на репарацию, точнее на её отсутствие в мутанте recA?

AB 1157 дикий тип, диск - налидиксовая кислота 100 мкг/мл

АВ2463 recA13, диск - налидиксовая кислота 100 мкг/мл

АВ2463 NovR , диск - налидиксовая кислота 100 мкг/мл

Налидиксовая кислота

Белок RecA

RecA – The Evolution Gene Об эволюции: «It is a process that happens because various proteins interact with the DNA to recombine it. And in this regard, RecA is the star.» Mike Gene

Оценивая частоты использования механизма гомологичной рекомбинации клеткой для реактивации остановившихся репликационных вилок, Сох установил, что именно эта функция рекомбинации является основной . Почти каждая репликационная вилка бактериальной клетки, растущей в обычных аэробных условиях, останавливается из-за столкновения с повреждением ДНК. Причем это происходит не только в условиях стресса, например, при облучении ультрафиолетом, а в нормальных условиях аэробного роста, когда SOS-функции клетки не индуцируются. Вот почему белок RecA является столь важным для клетки.

Into the life and death: RecA a WISE factor working to integrate survival and evolution in Escherichia coli

Спасибо за внимание