Многообразие РНК
Молекулы РНК и ДНК
Транскриптом § - совокупность всех транскриптов (молекулы РНК, синтезированные на основе ДНК – матрице), синтезируемые одной клеткой (группой клеток или организмом), включая матричные (м. РНК) и некодирующие РНК.
§ Человеческий транскриптом удивительно сложен, большая часть генома транскрибируется, большая часть транскриптов (>80%) не кодирует полипептиды! Многие последовательности в геноме (>20%) транскрибируются по обеим цепям. § 45% генома млекопитающих– это транспозоны, и еще 10% - простые повторы. § В геномах млекопитающих выявлено ~35, 000 достаточно протяженных белок- некодирующих транскриптов из ~10, 000 разных локусов, для которых были характерны многие черты м. РНК.
Типы РНК: § § м. РНК (и. РНК, m. RNA – messenger) т. РНК регуляторные РНК
Тип РНК Функции Регуляторные РНК Примечания 20 -2000 оснований (нуклеотидов) circ. RNA Кольцевые Адсорбция других регуляторных РНК и подавление их активности. Ингибитор ингибитора – РНК – молекулы-губки микро. РНК (см. ниже). РНК-белковый комплекс U 6 - РНКсубъединицы сплайсосомы 7 SL-РНК Ядрышковые РНК 7 SK-РНК малые интерферирующие РНК или si. RNA, RNAi (вариант – двуцепочечные РНК, дц. РНК) Каталитическая активность при сплайсинге – процессе удаления интронов с м. РНК ми. РНК, микро. РНК Ингибирование участков м. РНК, приводящее не к их уничтожению, а накоплению. РНКсайленсинг. sm. RNA (small modulatory RNAs) модуляция транскрипции в стволовых клетках Trans-acting RNAs Блок трансляции за счет комплементарного спаривания, привлечение нуклеаз Экспорт белков за пределы клетки Модификация р. РНК регулятор синтеза матричной РНК Регуляция экспрессии генов. Выключение генов путем соединения с участками м. РНК, Эпигенетика: могут приводящего к уничтожению образовавшихся дуплексов. Внутриклеточный антивирусный наследоваться. 25 – 45 иммунитет. РНК- интерференция. Формирование гетерохроматиновых структур – оснований факультативный гетерохроматин. Эпигенетика: могут наследоваться. 22 основания ~20 Длинные ? От ½ до ¾ всего разнообразия транскриптов в клетках человека. длиннее 200 н некодирующие нк. РНК Xist - X-inactive specific transcript - это ген, кодирующий РНК, располагается на Х(long nc. RNAs) хромосоме плацентарных млекопитающихи является главным эффектором инактивации Ххромосомы. Транскрипт гена XIST у человека имеет длину около 17000 нуклеотидов и экспрессируется на инактивированной X-хромосоме и не экспрессируется на активной. Транскрипт гена Xist подвергается сплайсингу, как и м. РНК, однако не транслируется. РНК вирусов Участки подавления РНК-интерференции с помощью последовательностей-супрессоров
